213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0710 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0710  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  769    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  36.66 
 
 
376 aa  247  3e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  36.44 
 
 
388 aa  242  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  37.53 
 
 
387 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  37.25 
 
 
368 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  36.75 
 
 
388 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  36.75 
 
 
388 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4713  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 
393 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317853  normal  0.0266117 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  36.63 
 
 
396 aa  237  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  35.59 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  37.06 
 
 
362 aa  234  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  36.31 
 
 
358 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  37.36 
 
 
373 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  37.39 
 
 
367 aa  230  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  36.02 
 
 
358 aa  230  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  37.65 
 
 
386 aa  229  5e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  37.54 
 
 
359 aa  229  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 
361 aa  229  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  37.35 
 
 
360 aa  228  9e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  34.09 
 
 
368 aa  226  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  35.71 
 
 
373 aa  224  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  35.06 
 
 
359 aa  224  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  35.06 
 
 
372 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  36.26 
 
 
365 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  36.1 
 
 
359 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  36.21 
 
 
354 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  35.34 
 
 
371 aa  219  7e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  35.1 
 
 
367 aa  215  8e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  35.26 
 
 
364 aa  215  9.999999999999999e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  36.76 
 
 
358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1686  Radical SAM domain protein  36.21 
 
 
354 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  34.57 
 
 
367 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  35.59 
 
 
360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1880  Radical SAM domain protein  36.39 
 
 
397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  36.58 
 
 
373 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  33.62 
 
 
387 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  34.66 
 
 
367 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  35.57 
 
 
349 aa  207  2e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  35 
 
 
353 aa  207  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  35.21 
 
 
348 aa  206  4e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  37.18 
 
 
360 aa  206  7e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1370  hypothetical protein  34.38 
 
 
354 aa  206  7e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  34.81 
 
 
350 aa  205  9e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  35.19 
 
 
352 aa  204  1e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  36.65 
 
 
347 aa  204  1e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0282  hypothetical protein  34.38 
 
 
354 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  35.2 
 
 
355 aa  202  7e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0220  hypothetical protein  34.41 
 
 
353 aa  202  7e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  37.7 
 
 
364 aa  202  7e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  34.19 
 
 
380 aa  200  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1560  hypothetical protein  33.81 
 
 
354 aa  200  3e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  37.29 
 
 
348 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  34.47 
 
 
362 aa  199  5e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  38.39 
 
 
358 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  34.81 
 
 
350 aa  199  7e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  35.48 
 
 
371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  32.95 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 
367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1417  radical SAM domain-containing protein  32.29 
 
 
364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  33.82 
 
 
362 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  39.31 
 
 
360 aa  194  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  34.01 
 
 
365 aa  194  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  35.69 
 
 
353 aa  193  4e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  35.61 
 
 
355 aa  193  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  35.74 
 
 
363 aa  192  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1325  radical SAM domain-containing protein  35.37 
 
 
362 aa  191  2e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.270915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8066  Radical SAM domain protein  34.08 
 
 
386 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437454  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.89 
 
 
382 aa  190  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2962  Radical SAM domain protein  33.24 
 
 
360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0300282  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  36.56 
 
 
386 aa  190  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  34.04 
 
 
353 aa  190  4e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  34.46 
 
 
355 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  34.52 
 
 
376 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  34.35 
 
 
354 aa  189  9e-47  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  32.29 
 
 
395 aa  189  9e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  33.03 
 
 
360 aa  189  9e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  33.72 
 
 
372 aa  188  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  36.14 
 
 
375 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  36.15 
 
 
348 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  36.15 
 
 
348 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  35.55 
 
 
354 aa  188  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  34.71 
 
 
357 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  34.09 
 
 
357 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  35.81 
 
 
348 aa  187  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  31.56 
 
 
376 aa  187  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0220  radical SAM domain-containing protein  32.73 
 
 
350 aa  186  4e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  35.52 
 
 
355 aa  186  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  33.64 
 
 
884 aa  186  7e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  37.24 
 
 
359 aa  186  8e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  32.15 
 
 
859 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  35.81 
 
 
348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  35.06 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  31.5 
 
 
362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  35.4 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  31.89 
 
 
435 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  32.84 
 
 
453 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  33.14 
 
 
364 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  35.12 
 
 
625 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  31.86 
 
 
353 aa  183  5.0000000000000004e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  33.62 
 
 
875 aa  182  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>