296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3737 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3737  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0294352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2732  RND family efflux transporter MFP subunit  39.04 
 
 		 361 aa  116  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844309  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2746  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.1 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.41 
 
 		 374 aa  105  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.41 
 
 		 359 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0105666  normal  0.0985719 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0579  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.99 
 
 		 362 aa  95.1  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.087454  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0747  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.29 
 
 		 405 aa  94.7  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0830  cation eflux system protein  31.58 
 
 		 368 aa  89  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1342  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.25 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1536  secretion protein HlyD  33.12 
 
 		 625 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4294  RND family efflux transporter MFP subunit  27.1 
 
 		 361 aa  75.5  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.67 
 
 		 512 aa  74.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  30.43 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0060  secretion protein HlyD precursor  28.48 
 
 		 477 aa  72.4  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3642  putative cation efflux system protein cusB precursor  28.48 
 
 		 475 aa  69.3  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.58 
 
 		 509 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.430144 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2263  heavy metal efflux pump membrane fusion protein, putative  29.8 
 
 		 422 aa  68.9  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.74 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  27.67 
 
 		 540 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0918  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.48 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.85 
 
 		 508 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4658  secretion protein HlyD  26.85 
 
 		 478 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  24 
 
 		 517 aa  64.7  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3973  RND family efflux transporter MFP subunit  27.15 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1853  secretion protein HlyD  26.85 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  26.8 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3042  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 		 487 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4405  secretion protein HlyD  30.19 
 
 		 550 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  29.41 
 
 		 546 aa  63.2  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  28.29 
 
 		 537 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  27.88 
 
 		 715 aa  62.4  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  28.29 
 
 		 538 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.33 
 
 		 494 aa  62  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1001  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.67 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.612781  normal  0.0455845 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.75 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.22 
 
 		 497 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.97 
 
 		 537 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  26.42 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  29.14 
 
 		 468 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1260  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.09 
 
 		 497 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3812  RND family efflux transporter MFP subunit  27.94 
 
 		 498 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.999648  normal  0.340628 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2454  RND family efflux transporter MFP subunit  28.67 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  28.1 
 
 		 537 aa  59.3  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  27.63 
 
 		 418 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  27.27 
 
 		 413 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4358  secretion protein HlyD  26.85 
 
 		 472 aa  58.9  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  25.16 
 
 		 683 aa  58.9  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 510 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034543  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.72 
 
 		 412 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1102  secretion protein HlyD  24.83 
 
 		 470 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4832  RND family efflux transporter MFP subunit  27.15 
 
 		 472 aa  58.9  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3936  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  26.8 
 
 		 491 aa  58.5  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4592  RND family efflux transporter MFP subunit  28.95 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.29 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  28.48 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484161  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.77 
 
 		 358 aa  57  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  27.01 
 
 		 504 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.48 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.35 
 
 		 460 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 510 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.94 
 
 		 671 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  27.88 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 580 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2912  secretion protein HlyD  28.24 
 
 		 418 aa  55.8  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0023  RND family efflux transporter MFP subunit  27.41 
 
 		 488 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  27.41 
 
 		 488 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561063  hitchhiker  0.00444957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  27.41 
 
 		 488 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.249144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  27.7 
 
 		 472 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  30.66 
 
 		 581 aa  55.5  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1604  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.67 
 
 		 464 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.344035  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  25.85 
 
 		 455 aa  55.1  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.76 
 
 		 526 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  26.2 
 
 		 500 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  26.49 
 
 		 466 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  27.97 
 
 		 527 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  26.76 
 
 		 504 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  27.5 
 
 		 397 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  33.08 
 
 		 421 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.81 
 
 		 364 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.76 
 
 		 568 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  30.88 
 
 		 417 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2362  chemiosmotic efflux system B protein B  21.85 
 
 		 377 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.83 
 
 		 456 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  25.66 
 
 		 629 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2393  RND family efflux transporter MFP subunit  25.97 
 
 		 525 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.49 
 
 		 465 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  27.59 
 
 		 394 aa  53.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.59 
 
 		 380 aa  53.1  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3297  secretion protein HlyD  25.95 
 
 		 418 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  24.84 
 
 		 509 aa  53.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7202  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.12 
 
 		 336 aa  52.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3427  cation efflux system protein cusB precursor  24.5 
 
 		 474 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2740  secretion protein HlyD  23.33 
 
 		 462 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.93 
 
 		 354 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2846  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  26.99 
 
 		 396 aa  52.4  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0277  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.21 
 
 		 627 aa  52.4  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3686  RND family efflux transporter MFP subunit  22.22 
 
 		 440 aa  52  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5032  copper and silver tricomponent efflux membrane fusion protein CusB (CzcB-like)  23.56 
 
 		 505 aa  52  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  27.33 
 
 		 397 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>