288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2166 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  100 
 
 		 176 aa  367  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  45.83 
 
 		 170 aa  157  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  45.91 
 
 		 176 aa  154  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  45.09 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  41.52 
 
 		 174 aa  140  8e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  37.2 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  32.96 
 
 		 170 aa  96.7  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 178 aa  95.1  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 163 aa  90.9  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  32 
 
 		 181 aa  87.8  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  32.21 
 
 		 178 aa  87.4  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  32.3 
 
 		 168 aa  85.1  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  27.44 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  31.41 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  26.71 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  30 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  28.32 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  30.32 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  30.36 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  29.44 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  26.78 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  25.97 
 
 		 178 aa  72  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  25.68 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  30.67 
 
 		 202 aa  70.9  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  28.85 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  29.89 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  28.18 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0782  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.74 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  27.01 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  27.72 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  28.77 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  29.61 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  28.03 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  26.14 
 
 		 192 aa  67.4  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  26.04 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  26.04 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  27.72 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  28 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  28.22 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  27.33 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  25.62 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  29.51 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  26.79 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  28.22 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  28.1 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  28.81 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  28.22 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  29.24 
 
 		 329 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  28.05 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  29.41 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  30.38 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  28.8 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  28.8 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28.39 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  25.26 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  26.6 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  26.8 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1872  nitroreductase  28.14 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  25.68 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  26.35 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  26.35 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  26.35 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  26.35 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  26.35 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  26.71 
 
 		 171 aa  62  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.21 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  26.35 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  26.35 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  28.76 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  25.75 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  27.22 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  24.32 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  27.98 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  26.35 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  26.55 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  28.74 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  24.4 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  26.22 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  29.76 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  29.59 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  33.55 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  27.33 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1059  nitroreductase  30.07 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000184024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  26.13 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  28.95 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  28 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  28 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  29.08 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0743  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.71 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  23.73 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  24.4 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  25.15 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  25.15 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  27.98 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0445  nitroreductase  28.49 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.861043  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  26.58 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  26.32 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  25.27 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  30.77 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  26.8 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>