More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0959 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0959  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 199 aa  397  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0842  TPR repeat-containing protein  69.39 
 
 		 201 aa  277  7e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  64.06 
 
 		 201 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  56.02 
 
 		 194 aa  223  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0741  TPR repeat-containing protein  58.76 
 
 		 191 aa  217  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  51.28 
 
 		 199 aa  201  7e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0632  TPR repeat-containing protein  52.54 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 		 4079 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 878 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 		 681 aa  77.8  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 376 aa  75.9  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.59 
 
 		 2240 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 362 aa  75.5  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 1827 aa  75.5  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.13 
 
 		 810 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 3035 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 		 685 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 4489 aa  73.6  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 583 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 1276 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0278  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.24 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000289042  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 637 aa  72  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.84 
 
 		 816 aa  72  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.32 
 
 		 462 aa  71.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  27.22 
 
 		 539 aa  72  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 739 aa  71.2  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  29.49 
 
 		 514 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  29.05 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  30.3 
 
 		 865 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.07 
 
 		 764 aa  69.3  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.87 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.87 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 		 637 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.81 
 
 		 622 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 3145 aa  68.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.47 
 
 		 406 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.47 
 
 		 406 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.98 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 639 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 740 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 635 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 635 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.95 
 
 		 1056 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 		 611 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.57 
 
 		 603 aa  68.2  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 361 aa  67.8  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 909 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 617 aa  67.8  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 562 aa  67.4  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 		 565 aa  67.8  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 718 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 311 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 594 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 1421 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 927 aa  66.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  29.65 
 
 		 594 aa  65.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 356 aa  65.9  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0823  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 502 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 762 aa  66.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 		 1127 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.76 
 
 		 397 aa  65.5  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3025  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.12 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.34 
 
 		 725 aa  65.1  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  26.28 
 
 		 295 aa  64.7  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 612 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  29.63 
 
 		 837 aa  64.7  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  27.03 
 
 		 887 aa  64.7  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 		 784 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  30.91 
 
 		 550 aa  64.3  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 612 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  28.95 
 
 		 1013 aa  63.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.8 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 824 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 605 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.49 
 
 		 1694 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.57 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.42 
 
 		 875 aa  64.7  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.48 
 
 		 1022 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  26.28 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 636 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.55 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.07 
 
 		 689 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.48 
 
 		 626 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  25.41 
 
 		 581 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  31.5 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 716 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.48 
 
 		 626 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.48 
 
 		 614 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1676 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.48 
 
 		 614 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 614 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 614 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 515 aa  63.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>