261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1294 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1294  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 269 aa  563  1.0000000000000001e-159  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3169  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.29 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.926354 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3096  helix-turn-helix domain-containing protein  29.22 
 
 		 273 aa  122  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3758  transcriptional regulator, AraC family  25.73 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3306  helix-turn-helix domain-containing protein  39.77 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0598  transcriptional regulator, AraC family  26.74 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2572  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 319 aa  75.5  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2683  helix-turn-helix domain-containing protein  26.98 
 
 		 321 aa  72  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421098  normal  0.349304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2298  transcriptional regulator, AraC family  38.2 
 
 		 310 aa  68.6  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000152227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2462  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529684  hitchhiker  0.000432103 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2782  transcriptional regulator, AraC family  25.99 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2696  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1608  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.322364  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2708  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 317 aa  65.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0276102  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2155  helix-turn-helix domain-containing protein  26.58 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6120  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0180  helix-turn-helix domain-containing protein  25.15 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3025  helix-turn-helix domain-containing protein  24.8 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1400  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301522  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0346  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5673  transcriptional regulator, AraC family  24.42 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.48691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0972  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  20.43 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03070  putative transcriptional regulator  32.97 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00675677  hitchhiker  0.00000142232 
 
 
-
 
NC_002950  PG2125  AraC family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14410  Transcriptional regulator PobR (AraC family)  33.67 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5379  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1416  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.813304  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1738  transcriptional regulator, AraC family  29.51 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2965  transcriptional regulator, AraC family  34.15 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000197043  hitchhiker  0.00000564139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5741  transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188023  normal  0.762448 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7131  transcriptional regulator, AraC family  25.14 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0334  putative transcriptional regulator  31.18 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4019  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992917  hitchhiker  0.00536454 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5794  transcriptional regulator, AraC family  26.16 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4017  AraC family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6762  transcriptional regulator, AraC family  26.12 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2146  transcriptional regulator, AraC family  24.63 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00502673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1732  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4362  helix-turn-helix domain-containing protein  31.31 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.272956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20310  transcriptional regulator, AraC family  36.05 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.944905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10660  putative transcriptional regulator  22.52 
 
 		 303 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.967663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  24.26 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4132  transcriptional regulator, AraC family  25.56 
 
 		 299 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5414  transcriptional regulator, AraC family  27.04 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00395268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1751  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 299 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1416  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1908  transcriptional regulator PobR  28.06 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104323  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4477  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1834  transcriptional regulator, AraC family  27.34 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.73118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1401  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0891461  normal  0.79487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2696  transcriptional regulator, AraC family  25.83 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2197  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5021  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2717  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2574  helix-turn-helix domain-containing protein  34.31 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2506  transcriptional regulator, AraC family  22.86 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.108721 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4013  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2791  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.209694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2749  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 290 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981488  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1497  transcriptional regulator, AraC family  23.62 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1306  transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.272206 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 506 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4241  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.495489  normal  0.82932 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6000  transcriptional regulator, AraC family  26.21 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3499  helix-turn-helix, AraC type  30.93 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1598  helix-turn-helix domain-containing protein  28.12 
 
 		 351 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2198  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 292 aa  53.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.983823  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3253  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 289 aa  53.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3388  transcriptional regulator, AraC family  25.49 
 
 		 328 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.470852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2106  hypothetical protein  24.07 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.89932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1158  transcriptional regulator, AraC family  21.79 
 
 		 303 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2714  transcriptional regulator, AraC family  35.44 
 
 		 290 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  0.456872 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0640  pobR protein  32.65 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1765  transcriptional regulator, AraC family  20.66 
 
 		 292 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1649  AraC family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 303 aa  52.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1237  AraC family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 272 aa  52.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000177874  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2709  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 305 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4892  transcriptional regulator, AraC family  25.24 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.838106  normal  0.621301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4826  helix-turn-helix domain-containing protein  30.34 
 
 		 296 aa  52.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1200  transcriptional regulator, AraC family  27.62 
 
 		 296 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0477  helix-turn-helix domain-containing protein  20.87 
 
 		 304 aa  52.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1945  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 292 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.140047  hitchhiker  0.000477729 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2048  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0841586  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0383  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6221  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2992  helix-turn-helix domain-containing protein  26.67 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0239813  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5317  transcriptional regulator, AraC family  28.75 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.803525 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4441  helix-turn-helix domain-containing protein  36.49 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4803  transcriptional regulator, AraC family  21.09 
 
 		 299 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.413232 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3538  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.847123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0313  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.5 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.593516  normal  0.0908723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2607  helix-turn-helix domain-containing protein  25.89 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.634815 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 293 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3290  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 324 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3722  helix-turn-helix domain-containing protein  33.67 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1539  transcriptional regulator, AraC family  31.17 
 
 		 293 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0619786  normal  0.154235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>