More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3360 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
202 aa  392  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  63.02 
 
 
216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  52.28 
 
 
364 aa  208  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  54.97 
 
 
244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  51.56 
 
 
321 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  42.93 
 
 
1780 aa  155  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  47.18 
 
 
284 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  46.29 
 
 
317 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  44.26 
 
 
283 aa  145  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  43.41 
 
 
353 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  36.46 
 
 
251 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  41.3 
 
 
317 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  38.29 
 
 
299 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  38.74 
 
 
217 aa  125  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  38.34 
 
 
215 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  38.54 
 
 
212 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  42.78 
 
 
259 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 
221 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  37.29 
 
 
301 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  36.31 
 
 
204 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  40.93 
 
 
285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  32.97 
 
 
417 aa  118  6e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  41.76 
 
 
307 aa  118  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  36.46 
 
 
219 aa  117  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  34.2 
 
 
277 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  36.22 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  34.01 
 
 
302 aa  117  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  34.6 
 
 
240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  39.56 
 
 
229 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  41.99 
 
 
267 aa  115  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  35.94 
 
 
354 aa  115  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 
405 aa  115  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  35.14 
 
 
232 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 
264 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  31.73 
 
 
927 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  31.73 
 
 
1115 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  31.73 
 
 
1119 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.73 
 
 
1115 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  34.44 
 
 
373 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.73 
 
 
1115 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 
1154 aa  112  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  29.8 
 
 
321 aa  112  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.21 
 
 
1115 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 
294 aa  112  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  44.13 
 
 
503 aa  112  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  40.66 
 
 
465 aa  111  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  30.93 
 
 
247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  40.32 
 
 
468 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  30.77 
 
 
872 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  32.65 
 
 
481 aa  109  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  33.7 
 
 
279 aa  109  3e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 
275 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 
275 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 
275 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 
275 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  32.43 
 
 
275 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 
275 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  40.11 
 
 
273 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  31.89 
 
 
345 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  38.04 
 
 
413 aa  108  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 
276 aa  108  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  39.56 
 
 
287 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  31.89 
 
 
275 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  40.33 
 
 
352 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 
264 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 
275 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  32.23 
 
 
573 aa  107  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 
275 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  38.56 
 
 
324 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  30.14 
 
 
571 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  32.02 
 
 
479 aa  106  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  34.97 
 
 
789 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  34.97 
 
 
789 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  34.97 
 
 
789 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 
256 aa  105  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 
256 aa  104  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  35.42 
 
 
488 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  38.74 
 
 
1099 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.87 
 
 
241 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  28.88 
 
 
291 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.42 
 
 
260 aa  102  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  36.26 
 
 
752 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 
479 aa  102  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 
320 aa  102  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  37.91 
 
 
522 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  32.79 
 
 
373 aa  101  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 
261 aa  101  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  31.02 
 
 
267 aa  101  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 
382 aa  101  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  40.61 
 
 
227 aa  101  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  28.06 
 
 
211 aa  101  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  29.35 
 
 
522 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3831  polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 
175 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 
368 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 
246 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 
204 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  30.98 
 
 
244 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  31.22 
 
 
271 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 
1124 aa  99.4  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>