More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1976 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
412 aa  813    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2207  Extracellular ligand-binding receptor  69.27 
 
 
426 aa  540  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0104  Extracellular ligand-binding receptor  53.9 
 
 
422 aa  388  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  46.21 
 
 
449 aa  333  3e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  45.95 
 
 
424 aa  332  6e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  44.84 
 
 
426 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2892  Extracellular ligand-binding receptor  37.47 
 
 
439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  37 
 
 
415 aa  212  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  34.84 
 
 
414 aa  199  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0957  Extracellular ligand-binding receptor  34.79 
 
 
415 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3207  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  42.42 
 
 
446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0778  extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 
437 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.964446  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  31.65 
 
 
404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0893  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
423 aa  131  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 
442 aa  129  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0165  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  36.4 
 
 
444 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.503783  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0174  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  35.42 
 
 
449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19527  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  29.36 
 
 
439 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  30.94 
 
 
440 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 
397 aa  112  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1149  Extracellular ligand-binding receptor  29.51 
 
 
442 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  30.35 
 
 
440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0926  extracellular ligand-binding receptor  30.6 
 
 
394 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  31.17 
 
 
433 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  25.77 
 
 
421 aa  107  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1272  extracellular ligand-binding receptor  27.87 
 
 
399 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.570271  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2923  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  30 
 
 
394 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1568  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 
394 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  33.77 
 
 
375 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  31.42 
 
 
376 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  28.45 
 
 
427 aa  100  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3970  Extracellular ligand-binding receptor  28.13 
 
 
425 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  32.29 
 
 
373 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  31.3 
 
 
376 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2165  extracellular ligand-binding receptor  34.6 
 
 
399 aa  97.1  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131423  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1522  putative periplasmic ligand-binding protein  27.5 
 
 
395 aa  97.1  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.371953 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1959  extracellular ligand-binding receptor  26.4 
 
 
418 aa  96.3  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 
440 aa  95.5  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  31.9 
 
 
393 aa  93.6  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
441 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 
376 aa  90.5  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1378  Extracellular ligand-binding receptor  29.95 
 
 
439 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3932  extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 
394 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2423  Extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0867221 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  29.08 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  25.84 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1489  Legumain  24.93 
 
 
741 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.26033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1977  periplasmic binding protein  26.4 
 
 
420 aa  84  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.343651  normal  0.981595 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  27.13 
 
 
401 aa  84  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3335  extracellular ligand-binding receptor  33.13 
 
 
370 aa  83.2  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0096  extracellular ligand-binding receptor  27.86 
 
 
416 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.809601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  29.29 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0089  Extracellular ligand-binding receptor  28.86 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0070  extracellular ligand-binding receptor  28.86 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  27.43 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  28.52 
 
 
388 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2389  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  31.55 
 
 
382 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.520842  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19650  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid binding protein  25.79 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337564  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 
379 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1736  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  36.65 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2956  extracellular ligand-binding receptor  30.24 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.22 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  28.4 
 
 
400 aa  79  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1970  extracellular ligand-binding receptor  29.81 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1774  extracellular ligand-binding receptor  28.05 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110922  normal  0.433234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  25.76 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1670  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00502897  hitchhiker  0.00000000193878 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  25.88 
 
 
381 aa  77  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 
412 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  27.16 
 
 
389 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 
397 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 
397 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  28.84 
 
 
377 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.83 
 
 
376 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  31 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3333  Extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 
422 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  27.6 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  26.46 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  25.42 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  28.77 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  25.68 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3090  Extracellular ligand-binding receptor  38.46 
 
 
425 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.989636  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3863  extracellular ligand-binding receptor  28.76 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  26.07 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  29.35 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  33.12 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  24.64 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  28.44 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0834  extracellular ligand-binding receptor  27.64 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1290  branched chain amino acid ABC transporter permease  25.07 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.169952  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.34 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  26.18 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  28.44 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6118  branched chain amino-acid ABC transporter substrate-binding protein  28.7 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  31.34 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.34 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.34 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>