251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1270 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  100 
 
 
322 aa  617  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  67.71 
 
 
333 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  50.79 
 
 
337 aa  280  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  33.71 
 
 
375 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  29.57 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  31.46 
 
 
312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  38.71 
 
 
346 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  28.66 
 
 
320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  28.89 
 
 
327 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  24.37 
 
 
321 aa  125  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  34.8 
 
 
484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  35.94 
 
 
361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  28.79 
 
 
351 aa  116  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  30.65 
 
 
349 aa  112  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  31.14 
 
 
430 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  31.35 
 
 
343 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.34 
 
 
322 aa  106  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  32.95 
 
 
318 aa  105  9e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  25.9 
 
 
342 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  32.76 
 
 
325 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  25.78 
 
 
428 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1919  hypothetical protein  30.58 
 
 
284 aa  93.6  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.57396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1935  carbamoyl phosphate synthase-like protein  31.43 
 
 
324 aa  93.6  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  28.61 
 
 
330 aa  93.2  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3212  protein of unknown function DUF201  28.25 
 
 
322 aa  92.8  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.72 
 
 
354 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.52 
 
 
327 aa  87.8  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  29.52 
 
 
334 aa  85.9  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.46 
 
 
677 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0342  protein of unknown function DUF201  33.57 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5241  hypothetical protein  32.32 
 
 
429 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0582778  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  26.96 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  27.91 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0533  carbamoyl phosphate synthase-like protein  22.84 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19040  carbamoylphosphate synthase large subunit  32.39 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  28.24 
 
 
404 aa  72.8  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  24.84 
 
 
339 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  29.18 
 
 
356 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  29.39 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  25.36 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  26.84 
 
 
355 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  21.8 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5257  protein of unknown function DUF201  28.48 
 
 
363 aa  66.2  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  23.43 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0933  hypothetical protein  28.49 
 
 
332 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0801  hypothetical protein  28.49 
 
 
332 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  25.39 
 
 
390 aa  63.5  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  29.22 
 
 
393 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  31.01 
 
 
391 aa  63.2  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3693  protein of unknown function DUF201  26.87 
 
 
354 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184207  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  27.19 
 
 
356 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  27.07 
 
 
386 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0081  hypothetical protein  33.63 
 
 
372 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  19.94 
 
 
387 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0896  hypothetical protein  30.77 
 
 
335 aa  60.1  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  30.4 
 
 
412 aa  60.1  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  27.02 
 
 
359 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  28.75 
 
 
410 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0373  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  30.54 
 
 
1075 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1349  ATP-grasp domain protein  37.29 
 
 
352 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204009  normal  0.65425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  33.49 
 
 
410 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  21.78 
 
 
339 aa  57.4  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  26.37 
 
 
439 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02890  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  29.7 
 
 
1067 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0882  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  32.14 
 
 
1063 aa  57  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0029  protein of unknown function DUF201  23.55 
 
 
386 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  34.33 
 
 
306 aa  56.6  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0759  hypothetical protein  25.2 
 
 
391 aa  56.6  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.227198 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  26.69 
 
 
440 aa  55.8  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  27.02 
 
 
427 aa  55.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1598  carbamoyl phosphate synthase large subunit  30.43 
 
 
1042 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0762  hypothetical protein  23.64 
 
 
388 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.960806  normal  0.0752452 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_11  predicted protein  30.11 
 
 
1994 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  31.34 
 
 
418 aa  53.9  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1684  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  27.88 
 
 
1071 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000705985  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  28.99 
 
 
894 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0689  D-alanyl-alanine synthetase A  25 
 
 
303 aa  53.1  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000234965  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  21.22 
 
 
416 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  28.78 
 
 
896 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3357  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  28.76 
 
 
1112 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0979  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  28.08 
 
 
659 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.513441  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  28.4 
 
 
316 aa  52.8  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3531  hypothetical protein  26.67 
 
 
397 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1541  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.67 
 
 
1077 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0136  D-alanine/D-alanine ligase  34.07 
 
 
302 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1644  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  23.61 
 
 
347 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  29.59 
 
 
318 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  29.03 
 
 
924 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  27.47 
 
 
439 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2222  hypothetical protein  28.79 
 
 
354 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3878  hypothetical protein  35.51 
 
 
353 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0188025  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1643  D-alanine--D-alanine ligase  21.29 
 
 
298 aa  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  31.88 
 
 
457 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0661  hypothetical protein  35.51 
 
 
352 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.015179  normal  0.248709 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3790  hypothetical protein  35.51 
 
 
353 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000713822  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  28.83 
 
 
926 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4985  hypothetical protein  28.62 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.076001  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0741  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.35 
 
 
1040 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1553  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp, putative  24.02 
 
 
267 aa  50.8  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1262  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.67 
 
 
1057 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>