128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4795 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  861    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  50.61 
 
 		 436 aa  420  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0168  hypothetical protein  50.36 
 
 		 414 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  49.4 
 
 		 427 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  50.12 
 
 		 453 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  49.4 
 
 		 427 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  47.36 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  49.39 
 
 		 428 aa  396  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  43.13 
 
 		 432 aa  344  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  42.17 
 
 		 423 aa  340  2.9999999999999998e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0829  hypothetical protein  32.7 
 
 		 448 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.476785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  30.79 
 
 		 429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  30.46 
 
 		 436 aa  216  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1133  hypothetical protein  31.5 
 
 		 450 aa  209  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3973  hypothetical protein  30.25 
 
 		 450 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0831495  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  30.99 
 
 		 448 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  31.22 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  30.21 
 
 		 429 aa  176  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  30.02 
 
 		 439 aa  173  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  31.19 
 
 		 437 aa  170  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1302  hypothetical protein  30.28 
 
 		 445 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1319  hypothetical protein  30.28 
 
 		 445 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150757 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1338  hypothetical protein  30.28 
 
 		 445 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  30.95 
 
 		 436 aa  142  8e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1642  hypothetical protein  30.37 
 
 		 437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0060  hypothetical protein  27.41 
 
 		 437 aa  136  7.000000000000001e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  28.89 
 
 		 412 aa  133  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0725  hypothetical protein  30.81 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00111805  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1597  hypothetical protein  27.88 
 
 		 412 aa  127  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0694  hypothetical protein  25.41 
 
 		 409 aa  99.8  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.452898  normal  0.129497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  27.46 
 
 		 520 aa  76.6  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  24.94 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  28.2 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  22.66 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  22.82 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.32 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  22.65 
 
 		 506 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  25.89 
 
 		 488 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  24.81 
 
 		 599 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  24.24 
 
 		 722 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  24.12 
 
 		 516 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  25.08 
 
 		 475 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  22.74 
 
 		 537 aa  53.9  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  23.33 
 
 		 435 aa  53.5  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2352  FAD dependent oxidoreductase  25.1 
 
 		 495 aa  53.1  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125181  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  45.61 
 
 		 508 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  24.76 
 
 		 475 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  23.37 
 
 		 524 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  23.55 
 
 		 539 aa  52.8  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  26.76 
 
 		 452 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  26.76 
 
 		 452 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  26.76 
 
 		 452 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  23.13 
 
 		 624 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3309  amine oxidase  21.01 
 
 		 484 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  26.43 
 
 		 509 aa  51.2  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  25.35 
 
 		 478 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  26.81 
 
 		 471 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  24.73 
 
 		 463 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  23.53 
 
 		 500 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  42.11 
 
 		 507 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  22.71 
 
 		 447 aa  50.1  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.5 
 
 		 472 aa  50.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  26.94 
 
 		 479 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  33.04 
 
 		 520 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  33.04 
 
 		 520 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  25.93 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  45.61 
 
 		 559 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  43.86 
 
 		 554 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  46.77 
 
 		 722 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  21.99 
 
 		 511 aa  48.9  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  24.92 
 
 		 488 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  36.56 
 
 		 520 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  26.15 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  43.86 
 
 		 508 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  26.86 
 
 		 477 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  35.71 
 
 		 519 aa  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  43.94 
 
 		 711 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  43.86 
 
 		 508 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  43.86 
 
 		 554 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  25.93 
 
 		 488 aa  47.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  40.35 
 
 		 511 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  48.33 
 
 		 717 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  27.14 
 
 		 513 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0933  amine oxidase  23.77 
 
 		 400 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  40.35 
 
 		 508 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  25.51 
 
 		 486 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3171  phytoene dehydrogenase, putative  47.06 
 
 		 488 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  26.47 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3148  amine oxidase  27.92 
 
 		 527 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0719859  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  25.38 
 
 		 552 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  23.66 
 
 		 497 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  27.32 
 
 		 497 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  27.32 
 
 		 497 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  26.6 
 
 		 507 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  22.58 
 
 		 497 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  24.81 
 
 		 479 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  24.57 
 
 		 481 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  26.78 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  20.7 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  37.14 
 
 		 518 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>