More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1989 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 344 aa  677    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  43.6 
 
 		 333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  35.19 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  36.28 
 
 		 359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  35.92 
 
 		 328 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  36.89 
 
 		 328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  37.68 
 
 		 320 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  34.52 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  35.71 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  36.47 
 
 		 336 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  35.1 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  41.86 
 
 		 342 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  35.92 
 
 		 320 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  33.01 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  37.02 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  36.06 
 
 		 280 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  30.12 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  34.09 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  33.88 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  34.23 
 
 		 324 aa  119  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  34.27 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  30.41 
 
 		 348 aa  116  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  32.67 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  38.24 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  34.98 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  33.18 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  29.9 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  32.04 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  29.57 
 
 		 331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  33.5 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  38.38 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  33.33 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  31.65 
 
 		 342 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  36.75 
 
 		 274 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  39.89 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  36.16 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  25.5 
 
 		 368 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  40.98 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  31.19 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  35.75 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  33.68 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  34.18 
 
 		 277 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  30.19 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  35.9 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  29.69 
 
 		 377 aa  106  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  31.8 
 
 		 319 aa  106  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  32.19 
 
 		 316 aa  106  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  37.69 
 
 		 327 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  29.17 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2389  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  29.73 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12376  hitchhiker  0.0000606712 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  41.72 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  34.12 
 
 		 375 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  31.65 
 
 		 345 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  36.84 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  30.7 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  30.55 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  30.14 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  29.85 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  28.36 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  31.97 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3834  anti-FecI sigma factor, FecR  30.57 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  28.7 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  34.53 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  37.22 
 
 		 315 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  28.66 
 
 		 329 aa  99.4  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  30.1 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4737  anti-FecI sigma factor, FecR  33.66 
 
 		 324 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  29.22 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  28.93 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  29.85 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  34.15 
 
 		 283 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  34.72 
 
 		 374 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  30.24 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1133  anti-FecI sigma factor, FecR  30.5 
 
 		 322 aa  97.1  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4232  anti-FecI sigma factor, FecR  28.66 
 
 		 329 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  30.62 
 
 		 330 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  28.2 
 
 		 359 aa  96.7  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  31.94 
 
 		 338 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  31.67 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1809  anti-FecI sigma factor, FecR  29.52 
 
 		 318 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  33.16 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  31.51 
 
 		 327 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4367  anti-FecI sigma factor, FecR  28.34 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  33.16 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  31.89 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  34.02 
 
 		 383 aa  94  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  28.48 
 
 		 317 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  28.76 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  30.18 
 
 		 319 aa  93.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  31.99 
 
 		 336 aa  92.4  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  34.15 
 
 		 328 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  32.34 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  36.14 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3127  putative FecR  31.2 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.892412  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  32.98 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  30.84 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  35.57 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  35.32 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  30.4 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  35.32 
 
 		 324 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>