128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0417 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0417  cyclase family protein  100 
 
 
260 aa  538  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421227  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  65.52 
 
 
267 aa  370  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  65.12 
 
 
275 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  65.12 
 
 
268 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  65.12 
 
 
268 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  66.28 
 
 
268 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  64.75 
 
 
268 aa  362  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  65.89 
 
 
262 aa  363  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  63.95 
 
 
258 aa  354  5.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  64.75 
 
 
260 aa  344  8e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  62.02 
 
 
271 aa  343  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  63.57 
 
 
260 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2398  cyclase family protein  63.04 
 
 
263 aa  338  5e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1005  cyclase family protein  59 
 
 
266 aa  334  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.70726 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  60.94 
 
 
262 aa  333  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  59.85 
 
 
259 aa  333  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  61.63 
 
 
260 aa  331  8e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  59.85 
 
 
259 aa  330  1e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  60.23 
 
 
258 aa  325  5e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1225  putative cyclase  62.79 
 
 
262 aa  322  3e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  56.2 
 
 
261 aa  314  9e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  46.74 
 
 
253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  44.02 
 
 
253 aa  205  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  42.02 
 
 
270 aa  204  9e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  43.63 
 
 
253 aa  203  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  41.38 
 
 
287 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  41.38 
 
 
283 aa  202  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  41.92 
 
 
262 aa  198  9e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  40.38 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  38.46 
 
 
254 aa  178  7e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  39 
 
 
253 aa  175  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  38.43 
 
 
236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  23.72 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  28.87 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  27.09 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  30.05 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  25.19 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  26.21 
 
 
219 aa  62.4  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  27.86 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  28.1 
 
 
216 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  25.24 
 
 
226 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  28.5 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  27.05 
 
 
291 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  24.77 
 
 
210 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  24.51 
 
 
226 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  27.51 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  26.67 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  26.67 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  26.01 
 
 
216 aa  58.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  24.9 
 
 
213 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  26.67 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  26.67 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  26.39 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  26.52 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  26.67 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  26.14 
 
 
233 aa  57  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  27.75 
 
 
210 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  26.64 
 
 
210 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  27.96 
 
 
219 aa  56.2  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  26.34 
 
 
210 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  25.19 
 
 
231 aa  56.2  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  24.78 
 
 
215 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  24.64 
 
 
249 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  24.66 
 
 
261 aa  52.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  26.7 
 
 
210 aa  52.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  30.48 
 
 
335 aa  52.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  28.64 
 
 
267 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  28.79 
 
 
211 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  27.7 
 
 
216 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  24.2 
 
 
215 aa  51.2  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  24.27 
 
 
227 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  27.12 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  28.23 
 
 
214 aa  50.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  26.32 
 
 
219 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  26.32 
 
 
276 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  24.03 
 
 
209 aa  48.9  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  25.37 
 
 
237 aa  48.9  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  26.69 
 
 
275 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  24.47 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  25.91 
 
 
213 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  27.4 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  24.22 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  26.62 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1500  cyclase family protein  24.88 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.256572  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  28.71 
 
 
377 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  27.75 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  25 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  26.51 
 
 
247 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  25.48 
 
 
228 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  24.88 
 
 
205 aa  47  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  25.85 
 
 
213 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1511  putative cyclase  25.12 
 
 
217 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3685  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  27.31 
 
 
250 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  27.31 
 
 
250 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  31.09 
 
 
215 aa  46.6  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  25 
 
 
226 aa  46.2  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  29.03 
 
 
269 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  24.06 
 
 
290 aa  46.2  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  30.6 
 
 
217 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  25.11 
 
 
270 aa  46.2  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>