91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0776 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0776  UspA domain protein  100 
 
 
570 aa  1154    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4010  hypothetical protein  43.14 
 
 
443 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1720  hypothetical protein  39.64 
 
 
309 aa  182  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0826893  normal  0.142518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2062  hypothetical protein  40.23 
 
 
310 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00103487 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3118  transcriptional regulator  39.85 
 
 
304 aa  179  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0443  hypothetical protein  39.47 
 
 
305 aa  177  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.185705  normal  0.214074 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0425  transcriptional regulator  39.84 
 
 
302 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.941173 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3036  hypothetical protein  38.76 
 
 
322 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0698  transcriptional regulator  40.95 
 
 
292 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1269  ParB domain protein nuclease  38.53 
 
 
262 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1204  hypothetical protein  31.92 
 
 
290 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1745  hypothetical protein  26.2 
 
 
637 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1870  hypothetical protein  30.15 
 
 
285 aa  106  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1807  hypothetical protein  41.54 
 
 
200 aa  97.4  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  29.44 
 
 
273 aa  79.3  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  30.23 
 
 
276 aa  63.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  33.33 
 
 
281 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  29.53 
 
 
283 aa  57  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
281 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  31.29 
 
 
156 aa  55.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  30.39 
 
 
271 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  26.15 
 
 
277 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  29.32 
 
 
289 aa  54.7  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  29.82 
 
 
297 aa  54.7  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  27.06 
 
 
277 aa  54.7  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  26.15 
 
 
277 aa  53.9  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  25.42 
 
 
284 aa  53.5  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  29.41 
 
 
274 aa  52.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  25 
 
 
281 aa  52.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  30.22 
 
 
149 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2681  hypothetical protein  58.7 
 
 
62 aa  52.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  26.92 
 
 
277 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  29.62 
 
 
289 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  33.86 
 
 
128 aa  52  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  32.31 
 
 
286 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  31.2 
 
 
143 aa  51.2  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  33.12 
 
 
280 aa  51.2  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  36.72 
 
 
128 aa  50.8  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0095  UspA domain-containing protein  41.56 
 
 
157 aa  50.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  27.11 
 
 
278 aa  50.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  32.31 
 
 
286 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  24.19 
 
 
279 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  26.95 
 
 
284 aa  50.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  25.52 
 
 
284 aa  49.7  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  25.52 
 
 
284 aa  49.7  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  30.34 
 
 
281 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  24.47 
 
 
312 aa  49.3  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 
144 aa  49.3  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  32.24 
 
 
284 aa  48.5  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 
324 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  32 
 
 
157 aa  47.8  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  31.58 
 
 
147 aa  47.8  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  27.66 
 
 
286 aa  47.8  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  26.41 
 
 
280 aa  47.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  25 
 
 
139 aa  47.4  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  26.86 
 
 
390 aa  47  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  28.57 
 
 
278 aa  47  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  29.35 
 
 
279 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 
271 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  30.08 
 
 
295 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  26.11 
 
 
281 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  25.87 
 
 
145 aa  45.8  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  24.29 
 
 
141 aa  45.8  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  22.41 
 
 
273 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  24.16 
 
 
283 aa  46.2  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  23.49 
 
 
287 aa  45.8  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  31.16 
 
 
138 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  23.49 
 
 
287 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  23.49 
 
 
287 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 
280 aa  46.2  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  26.15 
 
 
278 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  26.78 
 
 
314 aa  45.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  28.11 
 
 
279 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  27.6 
 
 
287 aa  44.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  31.5 
 
 
291 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 
277 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  27.82 
 
 
297 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  25.21 
 
 
173 aa  44.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  30.11 
 
 
271 aa  44.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  26.81 
 
 
140 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 
172 aa  44.3  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 
277 aa  44.3  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  29.45 
 
 
155 aa  44.3  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  25.54 
 
 
278 aa  44.3  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  25.95 
 
 
297 aa  44.3  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 
277 aa  44.3  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  26.29 
 
 
279 aa  43.9  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  26.29 
 
 
279 aa  43.9  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  27.57 
 
 
279 aa  43.9  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  26.85 
 
 
291 aa  43.9  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  24.11 
 
 
143 aa  43.5  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>