18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1720 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1720  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  626  1e-178  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0826893  normal  0.142518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3118  transcriptional regulator  59.7 
 
 		 304 aa  317  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0425  transcriptional regulator  54.91 
 
 		 302 aa  296  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.941173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0443  hypothetical protein  48.26 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.185705  normal  0.214074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2062  hypothetical protein  44.37 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103487 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3036  hypothetical protein  44.16 
 
 		 322 aa  215  8e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4010  hypothetical protein  44.6 
 
 		 443 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0776  UspA domain protein  39.64 
 
 		 570 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0698  transcriptional regulator  42.8 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1269  ParB domain protein nuclease  40.34 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1204  hypothetical protein  34.83 
 
 		 290 aa  142  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1745  hypothetical protein  30.5 
 
 		 637 aa  138  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1870  hypothetical protein  32.96 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1807  hypothetical protein  43.26 
 
 		 200 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2681  hypothetical protein  53.06 
 
 		 62 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0450  basic membrane lipoprotein  25 
 
 		 625 aa  51.6  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2498  hypothetical protein  33.93 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0464385  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3935  hypothetical protein  34.07 
 
 		 411 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>