38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3935 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3935  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  820    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2498  hypothetical protein  54.26 
 
 		 415 aa  438  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0464385  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0084  hypothetical protein  50.85 
 
 		 418 aa  362  6e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31730  hypothetical protein  48.37 
 
 		 413 aa  356  5e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.872295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0782  hypothetical protein  49.49 
 
 		 415 aa  355  8.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.540249  normal  0.366312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0915  hypothetical protein  48.21 
 
 		 420 aa  350  3e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0673  hypothetical protein  46.13 
 
 		 428 aa  343  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.527645  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1472  lipopolysaccharide kinase  47.4 
 
 		 470 aa  342  7e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03780  hypothetical protein  45.68 
 
 		 423 aa  342  8e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4891  hypothetical protein  48.35 
 
 		 446 aa  341  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12720  hypothetical protein  48.97 
 
 		 413 aa  340  2e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.520291  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0749  hypothetical protein  46.09 
 
 		 471 aa  339  7e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2685  hypothetical protein  49.24 
 
 		 418 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  0.62203 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2066  hypothetical protein  46.55 
 
 		 413 aa  332  6e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.465784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0866  hypothetical protein  45.95 
 
 		 472 aa  332  6e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2951  hypothetical protein  46.55 
 
 		 413 aa  331  1e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.124646  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0069  hypothetical protein  44.89 
 
 		 471 aa  325  6e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0105826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7709  hypothetical protein  47.3 
 
 		 403 aa  323  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0244  hypothetical protein  47.95 
 
 		 421 aa  317  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0527558  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0285  hypothetical protein  48.21 
 
 		 421 aa  316  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  normal  0.543149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4011  hypothetical protein  46.15 
 
 		 401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456276  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04000  hypothetical protein  46.38 
 
 		 433 aa  275  7e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3855  hypothetical protein  42.75 
 
 		 419 aa  272  7e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1247  hypothetical protein  43.62 
 
 		 422 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1264  hypothetical protein  43.62 
 
 		 422 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1274  hypothetical protein  43.37 
 
 		 422 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294638  normal  0.591376 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2160  hypothetical protein  43.63 
 
 		 409 aa  262  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2540  hypothetical protein  41.97 
 
 		 420 aa  260  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1789  hypothetical protein  42.52 
 
 		 410 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1718  hypothetical protein  42.52 
 
 		 410 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393628  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1640  hypothetical protein  39.11 
 
 		 422 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.229414  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5157  hypothetical protein  35.81 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.739341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0416  hypothetical protein  37.18 
 
 		 402 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875248  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0443  hypothetical protein  34 
 
 		 305 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.185705  normal  0.214074 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06125  hypothetical protein  31.94 
 
 		 254 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1269  ParB domain protein nuclease  27 
 
 		 262 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2062  hypothetical protein  37.76 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103487 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1720  hypothetical protein  34.07 
 
 		 309 aa  43.5  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0826893  normal  0.142518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>