33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2066 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_31730  hypothetical protein  78.69 
 
 
413 aa  671    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.872295  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2066  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  837    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.465784  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0673  hypothetical protein  73.89 
 
 
428 aa  615  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.527645  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0782  hypothetical protein  72.84 
 
 
415 aa  612  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.540249  normal  0.366312 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2951  hypothetical protein  69.19 
 
 
413 aa  546  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.124646  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0915  hypothetical protein  64.44 
 
 
420 aa  540  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12720  hypothetical protein  64.57 
 
 
413 aa  513  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.520291  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1472  lipopolysaccharide kinase  61.38 
 
 
470 aa  513  1e-144  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0069  hypothetical protein  59.9 
 
 
471 aa  488  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0105826 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0749  hypothetical protein  58.13 
 
 
471 aa  485  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0866  hypothetical protein  58.62 
 
 
472 aa  483  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03780  hypothetical protein  57.92 
 
 
423 aa  481  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2685  hypothetical protein  58.06 
 
 
418 aa  449  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  0.62203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7709  hypothetical protein  57.53 
 
 
403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0285  hypothetical protein  53.73 
 
 
421 aa  411  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  normal  0.543149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0244  hypothetical protein  53.98 
 
 
421 aa  413  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0527558  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4011  hypothetical protein  53.16 
 
 
401 aa  412  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456276  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0084  hypothetical protein  54.59 
 
 
418 aa  409  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4891  hypothetical protein  50.38 
 
 
446 aa  401  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04000  hypothetical protein  50.63 
 
 
433 aa  363  4e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3935  hypothetical protein  46.55 
 
 
411 aa  316  6e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2498  hypothetical protein  42.79 
 
 
415 aa  292  9e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0464385  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2160  hypothetical protein  37.69 
 
 
409 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1789  hypothetical protein  37.18 
 
 
410 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1718  hypothetical protein  37.18 
 
 
410 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1264  hypothetical protein  36.88 
 
 
422 aa  236  8e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1247  hypothetical protein  36.88 
 
 
422 aa  236  8e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1274  hypothetical protein  36.88 
 
 
422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294638  normal  0.591376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2540  hypothetical protein  37.1 
 
 
420 aa  233  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3855  hypothetical protein  37.6 
 
 
419 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1640  hypothetical protein  36.6 
 
 
422 aa  219  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.229414  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5157  hypothetical protein  33.25 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.739341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0416  hypothetical protein  35.79 
 
 
402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875248  normal  0.906322 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>