34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5157 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5157  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  842    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.739341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0416  hypothetical protein  52.25 
 
 
402 aa  389  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875248  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1718  hypothetical protein  43 
 
 
410 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1789  hypothetical protein  42.46 
 
 
410 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2160  hypothetical protein  42.46 
 
 
409 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1264  hypothetical protein  41.56 
 
 
422 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1472  lipopolysaccharide kinase  35.4 
 
 
470 aa  249  5e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1247  hypothetical protein  41.56 
 
 
422 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1274  hypothetical protein  41.31 
 
 
422 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294638  normal  0.591376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2540  hypothetical protein  39.29 
 
 
420 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3855  hypothetical protein  39.29 
 
 
419 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0673  hypothetical protein  37.08 
 
 
428 aa  237  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.527645  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31730  hypothetical protein  36.39 
 
 
413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.872295  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1640  hypothetical protein  38.02 
 
 
422 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.229414  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0084  hypothetical protein  36.75 
 
 
418 aa  230  4e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4011  hypothetical protein  36.48 
 
 
401 aa  227  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456276  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0915  hypothetical protein  35.15 
 
 
420 aa  223  4.9999999999999996e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0069  hypothetical protein  33.33 
 
 
471 aa  222  9.999999999999999e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0105826 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2685  hypothetical protein  35.54 
 
 
418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  0.62203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4891  hypothetical protein  35.01 
 
 
446 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2066  hypothetical protein  33.49 
 
 
413 aa  219  7e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.465784  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0866  hypothetical protein  36.03 
 
 
472 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7709  hypothetical protein  36.3 
 
 
403 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0749  hypothetical protein  35.51 
 
 
471 aa  218  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03780  hypothetical protein  34.91 
 
 
423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0285  hypothetical protein  36.48 
 
 
421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  normal  0.543149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0244  hypothetical protein  35.98 
 
 
421 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0527558  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0782  hypothetical protein  33.42 
 
 
415 aa  210  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.540249  normal  0.366312 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2951  hypothetical protein  33.5 
 
 
413 aa  205  9e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.124646  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12720  hypothetical protein  30.98 
 
 
413 aa  205  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.520291  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2498  hypothetical protein  35.1 
 
 
415 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0464385  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3935  hypothetical protein  35.33 
 
 
411 aa  199  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04000  hypothetical protein  35.86 
 
 
433 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0587  hypothetical protein  24.48 
 
 
244 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00125956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>