33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4891 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4891  hypothetical protein  100 
 
 
446 aa  905    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0084  hypothetical protein  65.92 
 
 
418 aa  531  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0782  hypothetical protein  55.47 
 
 
415 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.540249  normal  0.366312 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0749  hypothetical protein  51.28 
 
 
471 aa  435  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0866  hypothetical protein  51.4 
 
 
472 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0285  hypothetical protein  57.18 
 
 
421 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  normal  0.543149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0244  hypothetical protein  56.86 
 
 
421 aa  428  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0527558  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2685  hypothetical protein  53.81 
 
 
418 aa  422  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  0.62203 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0673  hypothetical protein  51.43 
 
 
428 aa  422  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.527645  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31730  hypothetical protein  51.89 
 
 
413 aa  415  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.872295  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7709  hypothetical protein  53.25 
 
 
403 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12720  hypothetical protein  53.38 
 
 
413 aa  402  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.520291  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0915  hypothetical protein  51.26 
 
 
420 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2066  hypothetical protein  49.76 
 
 
413 aa  400  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.465784  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1472  lipopolysaccharide kinase  51.72 
 
 
470 aa  393  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2951  hypothetical protein  51.13 
 
 
413 aa  392  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.124646  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03780  hypothetical protein  51.81 
 
 
423 aa  390  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04000  hypothetical protein  52.14 
 
 
433 aa  372  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0069  hypothetical protein  47.79 
 
 
471 aa  367  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0105826 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4011  hypothetical protein  47.24 
 
 
401 aa  334  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456276  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3935  hypothetical protein  48.35 
 
 
411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2498  hypothetical protein  44.22 
 
 
415 aa  318  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0464385  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2160  hypothetical protein  41.3 
 
 
409 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1718  hypothetical protein  40.52 
 
 
410 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1789  hypothetical protein  40.26 
 
 
410 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1264  hypothetical protein  38.46 
 
 
422 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1274  hypothetical protein  38.46 
 
 
422 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294638  normal  0.591376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1247  hypothetical protein  38.46 
 
 
422 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3855  hypothetical protein  38.5 
 
 
419 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1640  hypothetical protein  38.99 
 
 
422 aa  222  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.229414  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2540  hypothetical protein  38.23 
 
 
420 aa  220  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5157  hypothetical protein  39.56 
 
 
412 aa  217  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.739341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0416  hypothetical protein  34.96 
 
 
402 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875248  normal  0.906322 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>