35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1269 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1269  ParB domain protein nuclease  100 
 
 
262 aa  523  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3036  hypothetical protein  41.08 
 
 
322 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2062  hypothetical protein  38.67 
 
 
310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00103487 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0425  transcriptional regulator  44.29 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.941173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0443  hypothetical protein  38.52 
 
 
305 aa  172  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.185705  normal  0.214074 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1720  hypothetical protein  40.34 
 
 
309 aa  167  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0826893  normal  0.142518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3118  transcriptional regulator  41.33 
 
 
304 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1745  hypothetical protein  37.14 
 
 
637 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4010  hypothetical protein  39.58 
 
 
443 aa  158  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0698  transcriptional regulator  41.21 
 
 
292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0776  UspA domain protein  38.53 
 
 
570 aa  138  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1204  hypothetical protein  31.67 
 
 
290 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1870  hypothetical protein  29.88 
 
 
285 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1807  hypothetical protein  44.32 
 
 
200 aa  89.4  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1718  hypothetical protein  27.97 
 
 
410 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393628  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2681  hypothetical protein  46.15 
 
 
62 aa  52.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2160  hypothetical protein  28.44 
 
 
409 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1789  hypothetical protein  28.44 
 
 
410 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0084  hypothetical protein  26.42 
 
 
418 aa  48.9  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3935  hypothetical protein  27.27 
 
 
411 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2498  hypothetical protein  28.28 
 
 
415 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0464385  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0069  hypothetical protein  27.1 
 
 
471 aa  45.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0105826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0416  hypothetical protein  32.67 
 
 
402 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875248  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  26.47 
 
 
298 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  26.61 
 
 
292 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1050  YD repeat-containing protein  37.29 
 
 
1157 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0096  ParB family chromosome partitioning protein  27.33 
 
 
278 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0108  ParB family chromosome partitioning protein  27.33 
 
 
278 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0136  ParB family chromosome partitioning protein  27.33 
 
 
278 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  28.72 
 
 
295 aa  43.9  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1472  lipopolysaccharide kinase  26.42 
 
 
470 aa  42.7  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0065  chromosome partitioning protein  30.89 
 
 
315 aa  43.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.446293  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3855  hypothetical protein  24.27 
 
 
419 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0033  ParB-like partition domain-containing protein  30.89 
 
 
289 aa  42.7  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  28.75 
 
 
296 aa  42.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>