18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2062 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2062  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  636    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103487 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3036  hypothetical protein  83.22 
 
 		 322 aa  524  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0443  hypothetical protein  61.42 
 
 		 305 aa  328  8e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.185705  normal  0.214074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4010  hypothetical protein  50.93 
 
 		 443 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0425  transcriptional regulator  47.04 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.941173 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3118  transcriptional regulator  45.05 
 
 		 304 aa  229  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1720  hypothetical protein  44.37 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0826893  normal  0.142518 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0698  transcriptional regulator  46.09 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1269  ParB domain protein nuclease  38.67 
 
 		 262 aa  182  7e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0776  UspA domain protein  40.23 
 
 		 570 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1204  hypothetical protein  34.21 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1745  hypothetical protein  31.7 
 
 		 637 aa  132  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1870  hypothetical protein  32.82 
 
 		 285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1807  hypothetical protein  47.33 
 
 		 200 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2681  hypothetical protein  67.5 
 
 		 62 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0450  basic membrane lipoprotein  22.65 
 
 		 625 aa  47.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2498  hypothetical protein  36.36 
 
 		 415 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0464385  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3935  hypothetical protein  37.76 
 
 		 411 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>