17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3118 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_3118  transcriptional regulator  100 
 
 
304 aa  617  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0425  transcriptional regulator  69.67 
 
 
302 aa  432  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.941173 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1720  hypothetical protein  58.27 
 
 
309 aa  322  5e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0826893  normal  0.142518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2062  hypothetical protein  44.48 
 
 
310 aa  231  9e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00103487 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3036  hypothetical protein  45.52 
 
 
322 aa  229  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0443  hypothetical protein  44.06 
 
 
305 aa  229  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.185705  normal  0.214074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4010  hypothetical protein  42.45 
 
 
443 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0776  UspA domain protein  39.69 
 
 
570 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0698  transcriptional regulator  43.03 
 
 
292 aa  176  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1269  ParB domain protein nuclease  41.33 
 
 
262 aa  166  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1870  hypothetical protein  37.85 
 
 
285 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1745  hypothetical protein  30.48 
 
 
637 aa  125  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1204  hypothetical protein  33.21 
 
 
290 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1807  hypothetical protein  40.28 
 
 
200 aa  99  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2681  hypothetical protein  44 
 
 
62 aa  52.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0450  basic membrane lipoprotein  24.26 
 
 
625 aa  45.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1718  hypothetical protein  30.77 
 
 
410 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>