15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1807 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1807  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  392  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0698  transcriptional regulator  62.59 
 
 
292 aa  171  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2062  hypothetical protein  47.33 
 
 
310 aa  120  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00103487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1870  hypothetical protein  44.76 
 
 
285 aa  121  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0443  hypothetical protein  47.73 
 
 
305 aa  115  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.185705  normal  0.214074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4010  hypothetical protein  43.88 
 
 
443 aa  114  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1204  hypothetical protein  45.86 
 
 
290 aa  112  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3036  hypothetical protein  43.51 
 
 
322 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1720  hypothetical protein  43.26 
 
 
309 aa  105  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0826893  normal  0.142518 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0776  UspA domain protein  41.54 
 
 
570 aa  97.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3118  transcriptional regulator  43.18 
 
 
304 aa  97.8  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1745  hypothetical protein  33.85 
 
 
637 aa  93.2  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1269  ParB domain protein nuclease  44.32 
 
 
262 aa  89.4  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0425  transcriptional regulator  37.21 
 
 
302 aa  85.5  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.941173 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2681  hypothetical protein  42.65 
 
 
62 aa  52.4  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>