15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0425 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0425  transcriptional regulator  100 
 
 
302 aa  616  1e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.941173 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3118  transcriptional regulator  69.9 
 
 
304 aa  418  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1720  hypothetical protein  54.91 
 
 
309 aa  296  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0826893  normal  0.142518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2062  hypothetical protein  47.04 
 
 
310 aa  239  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00103487 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0443  hypothetical protein  45.23 
 
 
305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.185705  normal  0.214074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3036  hypothetical protein  44.81 
 
 
322 aa  229  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4010  hypothetical protein  43.08 
 
 
443 aa  215  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0776  UspA domain protein  39.84 
 
 
570 aa  176  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1269  ParB domain protein nuclease  44.29 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0698  transcriptional regulator  41.9 
 
 
292 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1204  hypothetical protein  34.55 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1870  hypothetical protein  33.04 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1745  hypothetical protein  28.02 
 
 
637 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1807  hypothetical protein  37.21 
 
 
200 aa  85.5  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2681  hypothetical protein  43.75 
 
 
62 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>