15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1204 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1204  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  583  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1870  hypothetical protein  62.32 
 
 		 285 aa  354  6.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0698  transcriptional regulator  39.47 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0443  hypothetical protein  37.35 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.185705  normal  0.214074 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1720  hypothetical protein  34.83 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0826893  normal  0.142518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2062  hypothetical protein  34.21 
 
 		 310 aa  135  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103487 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0425  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.941173 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3036  hypothetical protein  34.46 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4010  hypothetical protein  29.96 
 
 		 443 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3118  transcriptional regulator  34.16 
 
 		 304 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0776  UspA domain protein  31.92 
 
 		 570 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1807  hypothetical protein  45.86 
 
 		 200 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1269  ParB domain protein nuclease  31.67 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1745  hypothetical protein  30.21 
 
 		 637 aa  92.4  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2681  hypothetical protein  47.92 
 
 		 62 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>