15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2681 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2681  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  125  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0698  transcriptional regulator  56.86 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1745  hypothetical protein  57.14 
 
 		 637 aa  63.9  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1720  hypothetical protein  53.06 
 
 		 309 aa  57.4  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0826893  normal  0.142518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4010  hypothetical protein  65 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0443  hypothetical protein  58 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.185705  normal  0.214074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2062  hypothetical protein  67.5 
 
 		 310 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103487 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3036  hypothetical protein  65.85 
 
 		 322 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0776  UspA domain protein  58.7 
 
 		 570 aa  52.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1807  hypothetical protein  48 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1269  ParB domain protein nuclease  46.15 
 
 		 262 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3118  transcriptional regulator  44 
 
 		 304 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0425  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 302 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.941173 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1204  hypothetical protein  47.92 
 
 		 290 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1870  hypothetical protein  47.73 
 
 		 285 aa  47  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>