16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1745 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1745  hypothetical protein  100 
 
 
637 aa  1274    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1269  ParB domain protein nuclease  37.14 
 
 
262 aa  164  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1720  hypothetical protein  30.5 
 
 
309 aa  138  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0826893  normal  0.142518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2062  hypothetical protein  31.7 
 
 
310 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00103487 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3036  hypothetical protein  29.93 
 
 
322 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3118  transcriptional regulator  30.86 
 
 
304 aa  125  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0443  hypothetical protein  28.79 
 
 
305 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.185705  normal  0.214074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4010  hypothetical protein  25.5 
 
 
443 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0698  transcriptional regulator  29.96 
 
 
292 aa  111  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0425  transcriptional regulator  28.02 
 
 
302 aa  110  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.941173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0776  UspA domain protein  26.2 
 
 
570 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1807  hypothetical protein  33.85 
 
 
200 aa  93.2  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1204  hypothetical protein  30.21 
 
 
290 aa  92.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1870  hypothetical protein  27.31 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0450  basic membrane lipoprotein  29.6 
 
 
625 aa  73.6  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2681  hypothetical protein  57.14 
 
 
62 aa  63.9  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>