188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0450 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0450  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 625 aa  1275    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1927  basic membrane lipoprotein  38.62 
 
 		 382 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.940408  normal  0.0318829 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3026  basic membrane lipoprotein  35.96 
 
 		 380 aa  278  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2177  basic membrane lipoprotein  39.37 
 
 		 368 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0216  basic membrane lipoprotein  37.25 
 
 		 354 aa  274  3e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1507  Bmp family membrane protein  36.5 
 
 		 382 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2594  basic membrane lipoprotein  37.5 
 
 		 362 aa  272  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1953  basic membrane lipoprotein  40.71 
 
 		 373 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0267127 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3237  basic membrane lipoprotein  36.2 
 
 		 352 aa  264  4e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3721  basic membrane lipoprotein  37.06 
 
 		 367 aa  258  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0663  basic membrane lipoprotein  37.83 
 
 		 364 aa  249  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.888677  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1902  basic membrane lipoprotein  34.82 
 
 		 359 aa  249  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2299  basic membrane lipoprotein  36.2 
 
 		 384 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0759  bmp family protein  37.54 
 
 		 364 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0673  basic membrane lipoprotein  37.24 
 
 		 357 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3882  basic membrane lipoprotein  34.84 
 
 		 366 aa  241  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2993  basic membrane lipoprotein  36.5 
 
 		 361 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1923  basic membrane lipoprotein  36.07 
 
 		 355 aa  238  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0526758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3296  basic membrane lipoprotein  34.2 
 
 		 363 aa  236  9e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1406  basic membrane lipoprotein  38.35 
 
 		 386 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000211605  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1142  basic membrane lipoprotein  35.31 
 
 		 366 aa  234  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111164  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0224  hypothetical protein  34.42 
 
 		 365 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2169  lipoprotein  35.19 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0737964  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01800  hypothetical protein  33.83 
 
 		 365 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347768  normal  0.597763 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1415  basic membrane lipoprotein  34.78 
 
 		 356 aa  229  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218463  normal  0.0969049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1044  basic membrane lipoprotein  33.05 
 
 		 361 aa  225  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1690  basic membrane lipoprotein  33.92 
 
 		 355 aa  223  7e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00161056  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0869  basic membrane lipoprotein  33.82 
 
 		 356 aa  223  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3629  basic membrane lipoprotein  34.72 
 
 		 355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178645  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2146  basic membrane lipoprotein  32.3 
 
 		 368 aa  221  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1490  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  32.84 
 
 		 376 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0307169  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1903  basic membrane lipoprotein  33.72 
 
 		 358 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94528  normal  0.373123 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1719  basic membrane lipoprotein  34.02 
 
 		 358 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00548824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1135  basic membrane lipoprotein  34.42 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1486  basic membrane lipoprotein  35.56 
 
 		 386 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1106  basic membrane lipoprotein  34.42 
 
 		 357 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4187  basic membrane lipoprotein  33.72 
 
 		 373 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.083899  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2177  lipoprotein  34.91 
 
 		 380 aa  216  7e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0567  bmp family protein  33.83 
 
 		 355 aa  216  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2027  basic membrane lipoprotein  34.12 
 
 		 426 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.073285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2636  basic membrane lipoprotein  32.26 
 
 		 376 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.894025 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1708  basic membrane lipoprotein  34.12 
 
 		 426 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.918914 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2443  basic membrane lipoprotein  34.72 
 
 		 384 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0794  basic membrane lipoprotein  33.73 
 
 		 380 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0638378  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3163  basic membrane lipoprotein  35.01 
 
 		 387 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2964  putative basic membrane protein  35.28 
 
 		 387 aa  213  5.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2057  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  33.33 
 
 		 359 aa  213  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1766  basic membrane lipoprotein  34.39 
 
 		 358 aa  213  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1039  basic membrane lipoprotein  35.26 
 
 		 383 aa  212  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2501  basic membrane lipoprotein  33.43 
 
 		 381 aa  211  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403436  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1979  basic membrane lipoprotein  34.32 
 
 		 385 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1288  basic membrane lipoprotein  33.14 
 
 		 364 aa  211  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2379  basic membrane lipoprotein  34.32 
 
 		 385 aa  210  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0493  basic membrane lipoprotein  34.42 
 
 		 358 aa  210  7e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00240976  normal  0.0511349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2148  basic membrane lipoprotein  33.14 
 
 		 360 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.863295  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5006  basic membrane lipoprotein  32.94 
 
 		 382 aa  209  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3453  basic membrane lipoprotein  33.53 
 
 		 383 aa  208  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2138  basic membrane lipoprotein  33.73 
 
 		 390 aa  206  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3942  hypothetical protein  34.22 
 
 		 364 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3900  basic membrane lipoprotein  33.23 
 
 		 390 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381277  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2444  basic membrane lipoprotein  33.86 
 
 		 382 aa  204  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1118  basic membrane lipoprotein  32.85 
 
 		 359 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0536373  normal  0.804172 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3243  basic membrane lipoprotein  34.22 
 
 		 364 aa  204  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3560  ABC transporter periplasmic-binding protein  33.92 
 
 		 364 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0806  putative lipoprotein  33.03 
 
 		 385 aa  201  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1941  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  32.16 
 
 		 364 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00208553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5058  basic membrane lipoprotein  31.07 
 
 		 365 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2142  basic membrane lipoprotein  32.05 
 
 		 385 aa  200  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3176  basic membrane lipoprotein  33.65 
 
 		 376 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2318  basic membrane lipoprotein  31.73 
 
 		 368 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  0.178466 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1002  basic membrane lipoprotein  32.91 
 
 		 377 aa  193  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1060  basic membrane lipoprotein  32.91 
 
 		 377 aa  193  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1044  basic membrane lipoprotein  32.15 
 
 		 428 aa  193  8e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00211594 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1015  basic membrane lipoprotein  31.66 
 
 		 362 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1063  basic membrane lipoprotein  32.59 
 
 		 377 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0928  basic membrane lipoprotein  31.27 
 
 		 360 aa  189  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0764  basic membrane lipoprotein  34.29 
 
 		 390 aa  187  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000134233  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0975  basic membrane lipoprotein  31.61 
 
 		 432 aa  186  8e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.494831 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5873  basic membrane lipoprotein  29.25 
 
 		 364 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1314  basic membrane lipoprotein  29.35 
 
 		 431 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.348799  normal  0.383779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4847  basic membrane lipoprotein  30.83 
 
 		 371 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4236  basic membrane lipoprotein  31.95 
 
 		 360 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4620  ABC transporter substrate-binding protein  31.05 
 
 		 369 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0689181 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1460  basic membrane lipoprotein  29.69 
 
 		 382 aa  163  8.000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.892929 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1794  basic membrane lipoprotein  29.83 
 
 		 381 aa  161  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1001  basic membrane lipoprotein  27.19 
 
 		 363 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1159  bmp family protein  27.78 
 
 		 363 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0141  Bmp family membrane protein  28.25 
 
 		 364 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041374  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1176  basic membrane lipoprotein  27.25 
 
 		 430 aa  159  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0623927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0270  basic membrane lipoprotein  30.17 
 
 		 372 aa  158  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6465  basic membrane lipoprotein  25.87 
 
 		 365 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4465  basic membrane lipoprotein  26.02 
 
 		 365 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.117985 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5659  lipoprotein  29.71 
 
 		 422 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373529  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1368  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  31.15 
 
 		 365 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0529921  normal  0.073818 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6457  basic membrane lipoprotein  28.81 
 
 		 375 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.153955 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1169  twin-arginine translocation pathway signal  31.7 
 
 		 369 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0769  bmp family protein  31.39 
 
 		 374 aa  153  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.109974  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1360  bmp family protein  31.05 
 
 		 369 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0853  basic membrane lipoprotein  30.92 
 
 		 372 aa  151  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.674254  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5243  basic membrane lipoprotein  30.49 
 
 		 365 aa  151  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>