261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2142 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2142  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 385 aa  780    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1135  basic membrane lipoprotein  80.41 
 
 		 388 aa  611  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3900  basic membrane lipoprotein  79.23 
 
 		 390 aa  598  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381277  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5006  basic membrane lipoprotein  77.28 
 
 		 382 aa  579  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3163  basic membrane lipoprotein  78.18 
 
 		 387 aa  569  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2443  basic membrane lipoprotein  76.1 
 
 		 384 aa  570  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1486  basic membrane lipoprotein  75.13 
 
 		 386 aa  559  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1039  basic membrane lipoprotein  75.98 
 
 		 383 aa  542  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3453  basic membrane lipoprotein  70.6 
 
 		 383 aa  540  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2138  basic membrane lipoprotein  65.16 
 
 		 390 aa  508  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2444  basic membrane lipoprotein  64.68 
 
 		 382 aa  501  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2501  basic membrane lipoprotein  61.11 
 
 		 381 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403436  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0806  putative lipoprotein  64.11 
 
 		 385 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2177  lipoprotein  62.57 
 
 		 380 aa  448  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0794  basic membrane lipoprotein  62.95 
 
 		 380 aa  448  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0638378  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3176  basic membrane lipoprotein  63.03 
 
 		 376 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2379  basic membrane lipoprotein  63.77 
 
 		 385 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1979  basic membrane lipoprotein  63.88 
 
 		 385 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1060  basic membrane lipoprotein  61.93 
 
 		 377 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1063  basic membrane lipoprotein  62.24 
 
 		 377 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1002  basic membrane lipoprotein  62.24 
 
 		 377 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0869  basic membrane lipoprotein  55.62 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2636  basic membrane lipoprotein  52.54 
 
 		 376 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.894025 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1288  basic membrane lipoprotein  48.68 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1490  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  51.5 
 
 		 376 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0307169  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1941  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  51.06 
 
 		 364 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00208553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2318  basic membrane lipoprotein  50.43 
 
 		 368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  0.178466 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1902  basic membrane lipoprotein  51.51 
 
 		 359 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4187  basic membrane lipoprotein  50.3 
 
 		 373 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.083899  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0567  bmp family protein  50.15 
 
 		 355 aa  355  1e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2993  basic membrane lipoprotein  50.6 
 
 		 361 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2594  basic membrane lipoprotein  49.85 
 
 		 362 aa  353  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266805  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3629  basic membrane lipoprotein  50.45 
 
 		 355 aa  353  4e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178645  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1923  basic membrane lipoprotein  48.25 
 
 		 355 aa  351  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0526758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2057  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  49.27 
 
 		 359 aa  349  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0663  basic membrane lipoprotein  48.81 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.888677  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0759  bmp family protein  48.51 
 
 		 364 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2148  basic membrane lipoprotein  52.8 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.863295  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1766  basic membrane lipoprotein  50.3 
 
 		 358 aa  341  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5058  basic membrane lipoprotein  48.06 
 
 		 365 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3237  basic membrane lipoprotein  46.53 
 
 		 352 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1415  basic membrane lipoprotein  49.26 
 
 		 356 aa  335  7.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218463  normal  0.0969049 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0493  basic membrane lipoprotein  49.7 
 
 		 358 aa  335  9e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00240976  normal  0.0511349 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1927  basic membrane lipoprotein  43.46 
 
 		 382 aa  335  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.940408  normal  0.0318829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0673  basic membrane lipoprotein  46.88 
 
 		 357 aa  333  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3942  hypothetical protein  48.25 
 
 		 364 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0928  basic membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 360 aa  332  5e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1903  basic membrane lipoprotein  48.08 
 
 		 358 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94528  normal  0.373123 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3243  basic membrane lipoprotein  48.82 
 
 		 364 aa  332  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3560  ABC transporter periplasmic-binding protein  48.82 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1118  basic membrane lipoprotein  46.69 
 
 		 359 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0536373  normal  0.804172 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2169  lipoprotein  46.99 
 
 		 357 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0737964  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1719  basic membrane lipoprotein  47.79 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00548824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2177  basic membrane lipoprotein  44.54 
 
 		 368 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0224  hypothetical protein  45.92 
 
 		 365 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01800  hypothetical protein  45.92 
 
 		 365 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347768  normal  0.597763 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3026  basic membrane lipoprotein  43.5 
 
 		 380 aa  323  4e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1507  Bmp family membrane protein  44.51 
 
 		 382 aa  323  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3296  basic membrane lipoprotein  44.66 
 
 		 363 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2299  basic membrane lipoprotein  43.23 
 
 		 384 aa  318  9e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3882  basic membrane lipoprotein  46.59 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2964  putative basic membrane protein  46.65 
 
 		 387 aa  317  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1690  basic membrane lipoprotein  47.18 
 
 		 355 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00161056  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1106  basic membrane lipoprotein  48.64 
 
 		 357 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2146  basic membrane lipoprotein  44.51 
 
 		 368 aa  312  5.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3721  basic membrane lipoprotein  44.41 
 
 		 367 aa  312  6.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0216  basic membrane lipoprotein  43.88 
 
 		 354 aa  309  5e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2027  basic membrane lipoprotein  48.63 
 
 		 426 aa  308  8e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.073285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1044  basic membrane lipoprotein  46.76 
 
 		 361 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1708  basic membrane lipoprotein  48.63 
 
 		 426 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.918914 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1142  basic membrane lipoprotein  43.69 
 
 		 366 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111164  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1953  basic membrane lipoprotein  43.42 
 
 		 373 aa  303  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0267127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1015  basic membrane lipoprotein  43.2 
 
 		 362 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5873  basic membrane lipoprotein  36.39 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1406  basic membrane lipoprotein  43.15 
 
 		 386 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000211605  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6465  basic membrane lipoprotein  37.87 
 
 		 365 aa  253  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4465  basic membrane lipoprotein  37.28 
 
 		 365 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.117985 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0141  Bmp family membrane protein  39.13 
 
 		 364 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041374  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1314  basic membrane lipoprotein  36.8 
 
 		 431 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.348799  normal  0.383779 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1044  basic membrane lipoprotein  32.71 
 
 		 428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00211594 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1176  basic membrane lipoprotein  34.44 
 
 		 430 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0623927 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0532  bmp family protein  45.83 
 
 		 400 aa  210  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0450  basic membrane lipoprotein  31.71 
 
 		 625 aa  207  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3152  basic membrane lipoprotein  34.01 
 
 		 380 aa  206  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.445916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4847  basic membrane lipoprotein  35.78 
 
 		 371 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1159  bmp family protein  35.35 
 
 		 363 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0975  basic membrane lipoprotein  32.09 
 
 		 432 aa  201  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.494831 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1794  basic membrane lipoprotein  33.89 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1001  basic membrane lipoprotein  35.56 
 
 		 363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2769  basic membrane lipoprotein  34.88 
 
 		 342 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4474  basic membrane lipoprotein  33.42 
 
 		 375 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.766807 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0764  basic membrane lipoprotein  33.42 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000134233  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1360  bmp family protein  34.45 
 
 		 369 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1460  basic membrane lipoprotein  32.4 
 
 		 382 aa  189  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.892929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0836  basic membrane lipoprotein  35.17 
 
 		 367 aa  189  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1169  twin-arginine translocation pathway signal  33.93 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1368  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  35.52 
 
 		 365 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0529921  normal  0.073818 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5243  basic membrane lipoprotein  35.22 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6457  basic membrane lipoprotein  33.91 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.153955 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4236  basic membrane lipoprotein  35.35 
 
 		 360 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>