253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0141 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0141  Bmp family membrane protein  100 
 
 		 364 aa  757    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041374  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1927  basic membrane lipoprotein  43.14 
 
 		 382 aa  278  8e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.940408  normal  0.0318829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0663  basic membrane lipoprotein  40.05 
 
 		 364 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.888677  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3026  basic membrane lipoprotein  38.3 
 
 		 380 aa  272  9e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0759  bmp family protein  39.24 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1507  Bmp family membrane protein  42.73 
 
 		 382 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3237  basic membrane lipoprotein  41.54 
 
 		 352 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2177  basic membrane lipoprotein  39.13 
 
 		 368 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0673  basic membrane lipoprotein  39.07 
 
 		 357 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1953  basic membrane lipoprotein  42.52 
 
 		 373 aa  260  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0267127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2993  basic membrane lipoprotein  40.29 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1923  basic membrane lipoprotein  37.09 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0526758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0216  basic membrane lipoprotein  40 
 
 		 354 aa  252  6e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1902  basic membrane lipoprotein  38.76 
 
 		 359 aa  250  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0224  hypothetical protein  37.81 
 
 		 365 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01800  hypothetical protein  37.46 
 
 		 365 aa  249  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347768  normal  0.597763 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1135  basic membrane lipoprotein  39.82 
 
 		 388 aa  248  8e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3163  basic membrane lipoprotein  40.88 
 
 		 387 aa  248  9e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2443  basic membrane lipoprotein  39.3 
 
 		 384 aa  246  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2501  basic membrane lipoprotein  39.53 
 
 		 381 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403436  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2142  basic membrane lipoprotein  39.23 
 
 		 385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1415  basic membrane lipoprotein  38.36 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218463  normal  0.0969049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0794  basic membrane lipoprotein  39.23 
 
 		 380 aa  242  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0638378  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1941  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  40.41 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00208553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2318  basic membrane lipoprotein  40.06 
 
 		 368 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  0.178466 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3629  basic membrane lipoprotein  36.78 
 
 		 355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178645  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1979  basic membrane lipoprotein  37.35 
 
 		 385 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2177  lipoprotein  38.01 
 
 		 380 aa  239  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2299  basic membrane lipoprotein  38.66 
 
 		 384 aa  239  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2594  basic membrane lipoprotein  39.17 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266805  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3243  basic membrane lipoprotein  36.96 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1288  basic membrane lipoprotein  38.32 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0567  bmp family protein  36.81 
 
 		 355 aa  237  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5006  basic membrane lipoprotein  38.64 
 
 		 382 aa  237  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2379  basic membrane lipoprotein  36.76 
 
 		 385 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3560  ABC transporter periplasmic-binding protein  36.68 
 
 		 364 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3900  basic membrane lipoprotein  38.35 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381277  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3942  hypothetical protein  36.64 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3453  basic membrane lipoprotein  37.35 
 
 		 383 aa  230  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1039  basic membrane lipoprotein  37.94 
 
 		 383 aa  229  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1490  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  37.94 
 
 		 376 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0307169  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0493  basic membrane lipoprotein  37.79 
 
 		 358 aa  229  7e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00240976  normal  0.0511349 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3296  basic membrane lipoprotein  36.29 
 
 		 363 aa  228  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1690  basic membrane lipoprotein  37.28 
 
 		 355 aa  227  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00161056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2138  basic membrane lipoprotein  36.76 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2636  basic membrane lipoprotein  38.24 
 
 		 376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.894025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1486  basic membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 386 aa  226  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1903  basic membrane lipoprotein  36.07 
 
 		 358 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94528  normal  0.373123 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1719  basic membrane lipoprotein  37.1 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00548824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0869  basic membrane lipoprotein  34.82 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3882  basic membrane lipoprotein  35.52 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2169  lipoprotein  35.42 
 
 		 357 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0737964  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1766  basic membrane lipoprotein  36.68 
 
 		 358 aa  223  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4187  basic membrane lipoprotein  37.13 
 
 		 373 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.083899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2444  basic membrane lipoprotein  35.59 
 
 		 382 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2057  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  36.24 
 
 		 359 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2148  basic membrane lipoprotein  34.78 
 
 		 360 aa  210  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.863295  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5058  basic membrane lipoprotein  33.6 
 
 		 365 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1142  basic membrane lipoprotein  35.84 
 
 		 366 aa  209  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111164  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2146  basic membrane lipoprotein  36.44 
 
 		 368 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1002  basic membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 377 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1106  basic membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 357 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1063  basic membrane lipoprotein  36.47 
 
 		 377 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1406  basic membrane lipoprotein  36.84 
 
 		 386 aa  206  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000211605  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3721  basic membrane lipoprotein  35.59 
 
 		 367 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1060  basic membrane lipoprotein  36.18 
 
 		 377 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3176  basic membrane lipoprotein  35 
 
 		 376 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5873  basic membrane lipoprotein  32.95 
 
 		 364 aa  203  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2964  putative basic membrane protein  34.06 
 
 		 387 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0928  basic membrane lipoprotein  33.97 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1044  basic membrane lipoprotein  34.08 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0806  putative lipoprotein  33.93 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2027  basic membrane lipoprotein  34.81 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.073285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1708  basic membrane lipoprotein  34.81 
 
 		 426 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.918914 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1118  basic membrane lipoprotein  32.87 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0536373  normal  0.804172 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1015  basic membrane lipoprotein  31.38 
 
 		 362 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4236  basic membrane lipoprotein  30.58 
 
 		 360 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1794  basic membrane lipoprotein  30.71 
 
 		 381 aa  162  8.000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6465  basic membrane lipoprotein  28.7 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4847  basic membrane lipoprotein  29.29 
 
 		 371 aa  160  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0450  basic membrane lipoprotein  28.25 
 
 		 625 aa  159  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4465  basic membrane lipoprotein  28.7 
 
 		 365 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.117985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1001  basic membrane lipoprotein  30.77 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4349  basic membrane lipoprotein  30.64 
 
 		 366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.494999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3152  basic membrane lipoprotein  30.26 
 
 		 380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.445916 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1460  basic membrane lipoprotein  27.13 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.892929 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0853  basic membrane lipoprotein  27.55 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.674254  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6457  basic membrane lipoprotein  31.56 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.153955 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0975  basic membrane lipoprotein  30 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.494831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1169  twin-arginine translocation pathway signal  30.56 
 
 		 369 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1159  bmp family protein  28.74 
 
 		 363 aa  143  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0764  basic membrane lipoprotein  31.43 
 
 		 390 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000134233  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5243  basic membrane lipoprotein  29.26 
 
 		 365 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1314  basic membrane lipoprotein  30.93 
 
 		 431 aa  140  3e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.348799  normal  0.383779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1360  bmp family protein  29.76 
 
 		 369 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4474  basic membrane lipoprotein  30.29 
 
 		 375 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.766807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0836  basic membrane lipoprotein  28.53 
 
 		 367 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0769  bmp family protein  27.89 
 
 		 374 aa  138  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.109974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1368  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  28.46 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0529921  normal  0.073818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4620  ABC transporter substrate-binding protein  29.46 
 
 		 369 aa  136  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0689181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>