260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2057 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2057  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  100 
 
 		 359 aa  741    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1118  basic membrane lipoprotein  73.3 
 
 		 359 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0536373  normal  0.804172 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5058  basic membrane lipoprotein  71.03 
 
 		 365 aa  554  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1015  basic membrane lipoprotein  67.57 
 
 		 362 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0567  bmp family protein  67.94 
 
 		 355 aa  491  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3629  basic membrane lipoprotein  66.3 
 
 		 355 aa  493  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178645  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1415  basic membrane lipoprotein  62.92 
 
 		 356 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218463  normal  0.0969049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2169  lipoprotein  63.59 
 
 		 357 aa  461  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0737964  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1903  basic membrane lipoprotein  64.62 
 
 		 358 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94528  normal  0.373123 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1719  basic membrane lipoprotein  64.04 
 
 		 358 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00548824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1106  basic membrane lipoprotein  67.37 
 
 		 357 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2027  basic membrane lipoprotein  66.77 
 
 		 426 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.073285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1708  basic membrane lipoprotein  66.47 
 
 		 426 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.918914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2148  basic membrane lipoprotein  63.99 
 
 		 360 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.863295  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1902  basic membrane lipoprotein  57.58 
 
 		 359 aa  413  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1690  basic membrane lipoprotein  59.76 
 
 		 355 aa  411  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00161056  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1923  basic membrane lipoprotein  54.62 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0526758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0663  basic membrane lipoprotein  53.93 
 
 		 364 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.888677  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0759  bmp family protein  52.81 
 
 		 364 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0493  basic membrane lipoprotein  55.39 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00240976  normal  0.0511349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2993  basic membrane lipoprotein  54.22 
 
 		 361 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0673  basic membrane lipoprotein  51.26 
 
 		 357 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0224  hypothetical protein  52.39 
 
 		 365 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0869  basic membrane lipoprotein  50.56 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3560  ABC transporter periplasmic-binding protein  50.55 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01800  hypothetical protein  51.12 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347768  normal  0.597763 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1766  basic membrane lipoprotein  52.65 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3243  basic membrane lipoprotein  50.55 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3942  hypothetical protein  50.84 
 
 		 364 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2594  basic membrane lipoprotein  52.12 
 
 		 362 aa  371  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266805  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2964  putative basic membrane protein  48.77 
 
 		 387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0928  basic membrane lipoprotein  46.81 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2177  basic membrane lipoprotein  45.78 
 
 		 368 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3453  basic membrane lipoprotein  50.15 
 
 		 383 aa  348  8e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3900  basic membrane lipoprotein  50.45 
 
 		 390 aa  348  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381277  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2142  basic membrane lipoprotein  49.7 
 
 		 385 aa  345  5e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1063  basic membrane lipoprotein  50.45 
 
 		 377 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1002  basic membrane lipoprotein  49.85 
 
 		 377 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1060  basic membrane lipoprotein  49.85 
 
 		 377 aa  342  7e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3176  basic membrane lipoprotein  48.19 
 
 		 376 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0806  putative lipoprotein  50.15 
 
 		 385 aa  339  4e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3296  basic membrane lipoprotein  46.15 
 
 		 363 aa  332  5e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1135  basic membrane lipoprotein  46.25 
 
 		 388 aa  332  6e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293026 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1039  basic membrane lipoprotein  49.7 
 
 		 383 aa  332  6e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1927  basic membrane lipoprotein  48.32 
 
 		 382 aa  332  8e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.940408  normal  0.0318829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3882  basic membrane lipoprotein  46.09 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3721  basic membrane lipoprotein  46.32 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2501  basic membrane lipoprotein  49.26 
 
 		 381 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403436  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3163  basic membrane lipoprotein  48.2 
 
 		 387 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3026  basic membrane lipoprotein  46.18 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5006  basic membrane lipoprotein  45.95 
 
 		 382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1486  basic membrane lipoprotein  48.06 
 
 		 386 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0216  basic membrane lipoprotein  45.56 
 
 		 354 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0794  basic membrane lipoprotein  48.2 
 
 		 380 aa  325  9e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0638378  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1507  Bmp family membrane protein  46.93 
 
 		 382 aa  323  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3237  basic membrane lipoprotein  45.9 
 
 		 352 aa  323  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2443  basic membrane lipoprotein  46.55 
 
 		 384 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2177  lipoprotein  46.41 
 
 		 380 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2146  basic membrane lipoprotein  45.51 
 
 		 368 aa  317  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1953  basic membrane lipoprotein  46.22 
 
 		 373 aa  315  8e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0267127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1288  basic membrane lipoprotein  44.01 
 
 		 364 aa  315  9e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2299  basic membrane lipoprotein  46.04 
 
 		 384 aa  315  9e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2636  basic membrane lipoprotein  44.88 
 
 		 376 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.894025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1979  basic membrane lipoprotein  45.81 
 
 		 385 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2379  basic membrane lipoprotein  45.81 
 
 		 385 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1044  basic membrane lipoprotein  45.87 
 
 		 361 aa  311  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1142  basic membrane lipoprotein  45.29 
 
 		 366 aa  310  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111164  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1490  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  43.67 
 
 		 376 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0307169  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2444  basic membrane lipoprotein  45.37 
 
 		 382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4187  basic membrane lipoprotein  45.65 
 
 		 373 aa  309  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.083899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2138  basic membrane lipoprotein  43.58 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5873  basic membrane lipoprotein  42.94 
 
 		 364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0532  bmp family protein  59.51 
 
 		 400 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1941  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  44.21 
 
 		 364 aa  298  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00208553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2318  basic membrane lipoprotein  43.57 
 
 		 368 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  0.178466 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4465  basic membrane lipoprotein  38.82 
 
 		 365 aa  265  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.117985 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6465  basic membrane lipoprotein  38.53 
 
 		 365 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1406  basic membrane lipoprotein  40.3 
 
 		 386 aa  246  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000211605  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1460  basic membrane lipoprotein  39.23 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.892929 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0141  Bmp family membrane protein  36.24 
 
 		 364 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041374  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0450  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 625 aa  213  3.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1794  basic membrane lipoprotein  35.41 
 
 		 381 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4847  basic membrane lipoprotein  37.31 
 
 		 371 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0536  bmp family protein  71.77 
 
 		 173 aa  199  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736006  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0975  basic membrane lipoprotein  32.88 
 
 		 432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.494831 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1176  basic membrane lipoprotein  31.62 
 
 		 430 aa  194  3e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0623927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1001  basic membrane lipoprotein  33.42 
 
 		 363 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1044  basic membrane lipoprotein  31.55 
 
 		 428 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00211594 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1314  basic membrane lipoprotein  30.89 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.348799  normal  0.383779 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5659  lipoprotein  35.96 
 
 		 422 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0764  basic membrane lipoprotein  35.4 
 
 		 390 aa  183  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000134233  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1159  bmp family protein  33.94 
 
 		 363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4236  basic membrane lipoprotein  32.96 
 
 		 360 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1117  basic membrane lipoprotein  35.5 
 
 		 384 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.246215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5243  basic membrane lipoprotein  33.61 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1368  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  33.33 
 
 		 365 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0529921  normal  0.073818 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3152  basic membrane lipoprotein  32.2 
 
 		 380 aa  179  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.445916 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4474  basic membrane lipoprotein  33.61 
 
 		 375 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.766807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1701  basic membrane lipoprotein  33.24 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.126126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2020  basic membrane lipoprotein  33.24 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>