266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0869 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0869  basic membrane lipoprotein  100 
 
 
356 aa  731    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1902  basic membrane lipoprotein  59.28 
 
 
359 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2142  basic membrane lipoprotein  55.59 
 
 
385 aa  401  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1979  basic membrane lipoprotein  57.91 
 
 
385 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0806  putative lipoprotein  59.2 
 
 
385 aa  397  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2379  basic membrane lipoprotein  57.49 
 
 
385 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185576  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3453  basic membrane lipoprotein  55.12 
 
 
383 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2501  basic membrane lipoprotein  55.56 
 
 
381 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403436  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0794  basic membrane lipoprotein  55.89 
 
 
380 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0638378  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3900  basic membrane lipoprotein  54.98 
 
 
390 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381277  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2177  lipoprotein  57.06 
 
 
380 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0567  bmp family protein  53.09 
 
 
355 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1288  basic membrane lipoprotein  54.75 
 
 
364 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2594  basic membrane lipoprotein  54.71 
 
 
362 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266805  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1490  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  55.39 
 
 
376 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0307169  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3176  basic membrane lipoprotein  54.55 
 
 
376 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1135  basic membrane lipoprotein  55.29 
 
 
388 aa  388  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.293026 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5006  basic membrane lipoprotein  54.05 
 
 
382 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167093  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2443  basic membrane lipoprotein  53.47 
 
 
384 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1923  basic membrane lipoprotein  50.99 
 
 
355 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0526758  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2636  basic membrane lipoprotein  55.09 
 
 
376 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.894025 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3629  basic membrane lipoprotein  51.12 
 
 
355 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178645  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1063  basic membrane lipoprotein  54.38 
 
 
377 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3163  basic membrane lipoprotein  53.31 
 
 
387 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1486  basic membrane lipoprotein  54.19 
 
 
386 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1060  basic membrane lipoprotein  54.08 
 
 
377 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1002  basic membrane lipoprotein  53.78 
 
 
377 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2057  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  51.03 
 
 
359 aa  371  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2318  basic membrane lipoprotein  50.82 
 
 
368 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  0.178466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1941  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  54.46 
 
 
364 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00208553  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1039  basic membrane lipoprotein  53.92 
 
 
383 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2993  basic membrane lipoprotein  51 
 
 
361 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0663  basic membrane lipoprotein  50.56 
 
 
364 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.888677  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4187  basic membrane lipoprotein  50.14 
 
 
373 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.083899  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0759  bmp family protein  50.28 
 
 
364 aa  360  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5058  basic membrane lipoprotein  48.61 
 
 
365 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0673  basic membrane lipoprotein  49.86 
 
 
357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1118  basic membrane lipoprotein  47.99 
 
 
359 aa  355  5e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0536373  normal  0.804172 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2138  basic membrane lipoprotein  49.4 
 
 
390 aa  355  8.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2148  basic membrane lipoprotein  52.84 
 
 
360 aa  353  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.863295  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2177  basic membrane lipoprotein  47.29 
 
 
368 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0224  hypothetical protein  50.45 
 
 
365 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2444  basic membrane lipoprotein  49.85 
 
 
382 aa  349  5e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01800  hypothetical protein  50.15 
 
 
365 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347768  normal  0.597763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1106  basic membrane lipoprotein  51.96 
 
 
357 aa  346  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0493  basic membrane lipoprotein  51.04 
 
 
358 aa  345  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00240976  normal  0.0511349 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1953  basic membrane lipoprotein  51.2 
 
 
373 aa  342  5.999999999999999e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0267127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2027  basic membrane lipoprotein  51.98 
 
 
426 aa  341  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.073285  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1708  basic membrane lipoprotein  51.98 
 
 
426 aa  341  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.918914 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2169  lipoprotein  46.37 
 
 
357 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0737964  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3296  basic membrane lipoprotein  45.81 
 
 
363 aa  339  4e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3882  basic membrane lipoprotein  46.24 
 
 
366 aa  338  5.9999999999999996e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1903  basic membrane lipoprotein  48.39 
 
 
358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94528  normal  0.373123 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1507  Bmp family membrane protein  47.26 
 
 
382 aa  335  5e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3237  basic membrane lipoprotein  48.04 
 
 
352 aa  335  5e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1719  basic membrane lipoprotein  48.09 
 
 
358 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00548824  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1415  basic membrane lipoprotein  45.1 
 
 
356 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218463  normal  0.0969049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1766  basic membrane lipoprotein  46.91 
 
 
358 aa  333  3e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3721  basic membrane lipoprotein  47.59 
 
 
367 aa  333  4e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3026  basic membrane lipoprotein  44.69 
 
 
380 aa  331  1e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3942  hypothetical protein  45.88 
 
 
364 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0928  basic membrane lipoprotein  45.76 
 
 
360 aa  329  4e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1690  basic membrane lipoprotein  49.26 
 
 
355 aa  328  6e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00161056  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1927  basic membrane lipoprotein  47.59 
 
 
382 aa  326  3e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.940408  normal  0.0318829 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1044  basic membrane lipoprotein  46.35 
 
 
361 aa  325  5e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3243  basic membrane lipoprotein  45.87 
 
 
364 aa  325  9e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25432  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3560  ABC transporter periplasmic-binding protein  45.87 
 
 
364 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1015  basic membrane lipoprotein  45.4 
 
 
362 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0216  basic membrane lipoprotein  42.66 
 
 
354 aa  322  6e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1142  basic membrane lipoprotein  47.55 
 
 
366 aa  320  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111164  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2146  basic membrane lipoprotein  43.75 
 
 
368 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233394  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2964  putative basic membrane protein  44.93 
 
 
387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2299  basic membrane lipoprotein  44.71 
 
 
384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1406  basic membrane lipoprotein  43.24 
 
 
386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000211605  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5873  basic membrane lipoprotein  40.63 
 
 
364 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6465  basic membrane lipoprotein  39.23 
 
 
365 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866986  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4465  basic membrane lipoprotein  39.23 
 
 
365 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.117985 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1044  basic membrane lipoprotein  37.76 
 
 
428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00211594 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1794  basic membrane lipoprotein  36.03 
 
 
381 aa  247  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0975  basic membrane lipoprotein  36.83 
 
 
432 aa  244  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.494831 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1460  basic membrane lipoprotein  35.45 
 
 
382 aa  243  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.892929 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1314  basic membrane lipoprotein  36.02 
 
 
431 aa  233  3e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.348799  normal  0.383779 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1176  basic membrane lipoprotein  35.25 
 
 
430 aa  231  2e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0623927 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0141  Bmp family membrane protein  35.17 
 
 
364 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041374  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0532  bmp family protein  49.77 
 
 
400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0450  basic membrane lipoprotein  33.82 
 
 
625 aa  223  6e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3152  basic membrane lipoprotein  36 
 
 
380 aa  219  5e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.445916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1159  bmp family protein  34.73 
 
 
363 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4847  basic membrane lipoprotein  35.35 
 
 
371 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1001  basic membrane lipoprotein  32.49 
 
 
363 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4236  basic membrane lipoprotein  34.53 
 
 
360 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3026  basic membrane lipoprotein  36 
 
 
381 aa  206  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2076  basic membrane lipoprotein  36.31 
 
 
371 aa  206  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0315473 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5420  lipoprotein  34.94 
 
 
370 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1243  basic membrane lipoprotein  35.69 
 
 
379 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.202679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4620  ABC transporter substrate-binding protein  38.69 
 
 
369 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0689181 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0853  basic membrane lipoprotein  35.33 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.674254  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4349  basic membrane lipoprotein  34.73 
 
 
366 aa  200  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.494999  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5659  lipoprotein  35.92 
 
 
422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373529  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5243  basic membrane lipoprotein  35.84 
 
 
365 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>