262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2443 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2443  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 384 aa  779    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1135  basic membrane lipoprotein  78.61 
 
 		 388 aa  590  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3900  basic membrane lipoprotein  77.69 
 
 		 390 aa  586  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381277  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5006  basic membrane lipoprotein  76.5 
 
 		 382 aa  570  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2142  basic membrane lipoprotein  76.36 
 
 		 385 aa  561  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3163  basic membrane lipoprotein  76.1 
 
 		 387 aa  560  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1486  basic membrane lipoprotein  74.03 
 
 		 386 aa  558  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3453  basic membrane lipoprotein  71.47 
 
 		 383 aa  533  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1039  basic membrane lipoprotein  72.77 
 
 		 383 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2138  basic membrane lipoprotein  66.13 
 
 		 390 aa  515  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2444  basic membrane lipoprotein  66.67 
 
 		 382 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0806  putative lipoprotein  64.72 
 
 		 385 aa  448  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3176  basic membrane lipoprotein  62.35 
 
 		 376 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2177  lipoprotein  61.73 
 
 		 380 aa  441  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1002  basic membrane lipoprotein  62.28 
 
 		 377 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0794  basic membrane lipoprotein  62.29 
 
 		 380 aa  438  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0638378  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2379  basic membrane lipoprotein  64.86 
 
 		 385 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1979  basic membrane lipoprotein  65.17 
 
 		 385 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2501  basic membrane lipoprotein  60.72 
 
 		 381 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403436  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1063  basic membrane lipoprotein  61.68 
 
 		 377 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1060  basic membrane lipoprotein  61.38 
 
 		 377 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0869  basic membrane lipoprotein  53.47 
 
 		 356 aa  387  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1288  basic membrane lipoprotein  49.07 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1490  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  49.7 
 
 		 376 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0307169  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2636  basic membrane lipoprotein  50.75 
 
 		 376 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.894025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1941  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  50.76 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00208553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2318  basic membrane lipoprotein  49.85 
 
 		 368 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  0.178466 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1923  basic membrane lipoprotein  49.26 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0526758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1927  basic membrane lipoprotein  45.81 
 
 		 382 aa  349  4e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.940408  normal  0.0318829 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4187  basic membrane lipoprotein  49.85 
 
 		 373 aa  343  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.083899  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0759  bmp family protein  48.81 
 
 		 364 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2594  basic membrane lipoprotein  47.11 
 
 		 362 aa  335  7.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2993  basic membrane lipoprotein  47.73 
 
 		 361 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0663  basic membrane lipoprotein  47.62 
 
 		 364 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.888677  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3629  basic membrane lipoprotein  46.69 
 
 		 355 aa  334  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2177  basic membrane lipoprotein  43.88 
 
 		 368 aa  332  8e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0567  bmp family protein  47.32 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1902  basic membrane lipoprotein  49.1 
 
 		 359 aa  328  9e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1766  basic membrane lipoprotein  45.48 
 
 		 358 aa  327  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0673  basic membrane lipoprotein  47.02 
 
 		 357 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2057  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  46.49 
 
 		 359 aa  324  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5058  basic membrane lipoprotein  44.59 
 
 		 365 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0493  basic membrane lipoprotein  49.09 
 
 		 358 aa  322  7e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00240976  normal  0.0511349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2148  basic membrane lipoprotein  49.56 
 
 		 360 aa  322  7e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.863295  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1507  Bmp family membrane protein  46.18 
 
 		 382 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1118  basic membrane lipoprotein  45.24 
 
 		 359 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0536373  normal  0.804172 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1415  basic membrane lipoprotein  46.31 
 
 		 356 aa  316  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218463  normal  0.0969049 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3237  basic membrane lipoprotein  44.98 
 
 		 352 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3026  basic membrane lipoprotein  42.52 
 
 		 380 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0224  hypothetical protein  43.81 
 
 		 365 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3296  basic membrane lipoprotein  44.87 
 
 		 363 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2169  lipoprotein  44.84 
 
 		 357 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0737964  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1903  basic membrane lipoprotein  45.59 
 
 		 358 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94528  normal  0.373123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3882  basic membrane lipoprotein  45.72 
 
 		 366 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01800  hypothetical protein  43.81 
 
 		 365 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347768  normal  0.597763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2299  basic membrane lipoprotein  41.71 
 
 		 384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1953  basic membrane lipoprotein  45.13 
 
 		 373 aa  309  5e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0267127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1719  basic membrane lipoprotein  45.13 
 
 		 358 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00548824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3243  basic membrane lipoprotein  45.88 
 
 		 364 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3942  hypothetical protein  45.16 
 
 		 364 aa  305  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3560  ABC transporter periplasmic-binding protein  45.88 
 
 		 364 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2146  basic membrane lipoprotein  42.33 
 
 		 368 aa  302  7.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0216  basic membrane lipoprotein  43.84 
 
 		 354 aa  301  9e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0928  basic membrane lipoprotein  43.54 
 
 		 360 aa  300  3e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1044  basic membrane lipoprotein  44.08 
 
 		 361 aa  299  6e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2964  putative basic membrane protein  45.4 
 
 		 387 aa  299  7e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1690  basic membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 355 aa  293  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00161056  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3721  basic membrane lipoprotein  42.3 
 
 		 367 aa  292  8e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1015  basic membrane lipoprotein  42.6 
 
 		 362 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1142  basic membrane lipoprotein  41.59 
 
 		 366 aa  288  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111164  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1106  basic membrane lipoprotein  44.38 
 
 		 357 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2027  basic membrane lipoprotein  44.38 
 
 		 426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.073285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1708  basic membrane lipoprotein  44.38 
 
 		 426 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.918914 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1406  basic membrane lipoprotein  40.86 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000211605  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0141  Bmp family membrane protein  39.6 
 
 		 364 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041374  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6465  basic membrane lipoprotein  35.71 
 
 		 365 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4465  basic membrane lipoprotein  35.12 
 
 		 365 aa  235  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.117985 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5873  basic membrane lipoprotein  33.14 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1314  basic membrane lipoprotein  37.69 
 
 		 431 aa  225  1e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.348799  normal  0.383779 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1044  basic membrane lipoprotein  34.12 
 
 		 428 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00211594 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0450  basic membrane lipoprotein  33.99 
 
 		 625 aa  219  3.9999999999999997e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3152  basic membrane lipoprotein  36 
 
 		 380 aa  219  8.999999999999998e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.445916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4847  basic membrane lipoprotein  36.67 
 
 		 371 aa  213  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1176  basic membrane lipoprotein  36.18 
 
 		 430 aa  211  2e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0623927 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0975  basic membrane lipoprotein  34.93 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.494831 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0853  basic membrane lipoprotein  34.03 
 
 		 372 aa  202  7e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.674254  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1159  bmp family protein  34.73 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1001  basic membrane lipoprotein  35.63 
 
 		 363 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1794  basic membrane lipoprotein  34.93 
 
 		 381 aa  199  7e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4236  basic membrane lipoprotein  36.75 
 
 		 360 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2076  basic membrane lipoprotein  34.86 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0315473 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5243  basic membrane lipoprotein  37.57 
 
 		 365 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1243  basic membrane lipoprotein  33.24 
 
 		 379 aa  196  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.202679 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1368  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  37.57 
 
 		 365 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0529921  normal  0.073818 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0532  bmp family protein  42.59 
 
 		 400 aa  192  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4474  basic membrane lipoprotein  32.21 
 
 		 375 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.766807 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0764  basic membrane lipoprotein  33.59 
 
 		 390 aa  189  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000134233  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1360  bmp family protein  33.59 
 
 		 369 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0836  basic membrane lipoprotein  34.88 
 
 		 367 aa  188  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1169  twin-arginine translocation pathway signal  33.07 
 
 		 369 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>