241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1015 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1015  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 362 aa  739    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1118  basic membrane lipoprotein  75.69 
 
 		 359 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0536373  normal  0.804172 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5058  basic membrane lipoprotein  72.83 
 
 		 365 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2057  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  67.57 
 
 		 359 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0567  bmp family protein  56.5 
 
 		 355 aa  425  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3629  basic membrane lipoprotein  56.78 
 
 		 355 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178645  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1415  basic membrane lipoprotein  53.63 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218463  normal  0.0969049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2169  lipoprotein  54 
 
 		 357 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0737964  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1106  basic membrane lipoprotein  58.38 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1708  basic membrane lipoprotein  58.43 
 
 		 426 aa  381  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.918914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2027  basic membrane lipoprotein  58.13 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.073285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1903  basic membrane lipoprotein  54.07 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94528  normal  0.373123 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1719  basic membrane lipoprotein  54.09 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00548824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2148  basic membrane lipoprotein  55.86 
 
 		 360 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.863295  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0493  basic membrane lipoprotein  50.3 
 
 		 358 aa  350  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00240976  normal  0.0511349 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1690  basic membrane lipoprotein  52.21 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00161056  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1902  basic membrane lipoprotein  47.24 
 
 		 359 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2993  basic membrane lipoprotein  48.94 
 
 		 361 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1923  basic membrane lipoprotein  45.61 
 
 		 355 aa  335  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0526758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2594  basic membrane lipoprotein  46.06 
 
 		 362 aa  333  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0663  basic membrane lipoprotein  48.94 
 
 		 364 aa  332  8e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.888677  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0673  basic membrane lipoprotein  46.33 
 
 		 357 aa  332  9e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0869  basic membrane lipoprotein  45.3 
 
 		 356 aa  329  4e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0759  bmp family protein  48.04 
 
 		 364 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1766  basic membrane lipoprotein  46.48 
 
 		 358 aa  321  9.000000000000001e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0224  hypothetical protein  46.55 
 
 		 365 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3560  ABC transporter periplasmic-binding protein  44.63 
 
 		 364 aa  316  5e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3942  hypothetical protein  44.35 
 
 		 364 aa  315  5e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01800  hypothetical protein  46.25 
 
 		 365 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347768  normal  0.597763 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3243  basic membrane lipoprotein  44.35 
 
 		 364 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0928  basic membrane lipoprotein  44.69 
 
 		 360 aa  311  7.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2964  putative basic membrane protein  44.41 
 
 		 387 aa  309  5e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3453  basic membrane lipoprotein  43.58 
 
 		 383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1135  basic membrane lipoprotein  45.18 
 
 		 388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3882  basic membrane lipoprotein  44.54 
 
 		 366 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2501  basic membrane lipoprotein  44.97 
 
 		 381 aa  299  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403436  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1063  basic membrane lipoprotein  44.44 
 
 		 377 aa  298  8e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1060  basic membrane lipoprotein  44.14 
 
 		 377 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2142  basic membrane lipoprotein  43.2 
 
 		 385 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3176  basic membrane lipoprotein  43.2 
 
 		 376 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2177  basic membrane lipoprotein  40.06 
 
 		 368 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1039  basic membrane lipoprotein  45.35 
 
 		 383 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1002  basic membrane lipoprotein  43.67 
 
 		 377 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5006  basic membrane lipoprotein  44.58 
 
 		 382 aa  295  6e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167093  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2177  lipoprotein  44.74 
 
 		 380 aa  295  8e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3900  basic membrane lipoprotein  43.98 
 
 		 390 aa  295  9e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381277  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0794  basic membrane lipoprotein  45.05 
 
 		 380 aa  295  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0638378  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1486  basic membrane lipoprotein  45.21 
 
 		 386 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2443  basic membrane lipoprotein  42.6 
 
 		 384 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2444  basic membrane lipoprotein  44.14 
 
 		 382 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0806  putative lipoprotein  44.04 
 
 		 385 aa  290  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2379  basic membrane lipoprotein  44.44 
 
 		 385 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3296  basic membrane lipoprotein  41.11 
 
 		 363 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1979  basic membrane lipoprotein  44.44 
 
 		 385 aa  289  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1044  basic membrane lipoprotein  43.09 
 
 		 361 aa  288  8e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3163  basic membrane lipoprotein  43.07 
 
 		 387 aa  287  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4187  basic membrane lipoprotein  41.37 
 
 		 373 aa  285  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.083899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2146  basic membrane lipoprotein  41.84 
 
 		 368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2138  basic membrane lipoprotein  42.77 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1490  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  41.57 
 
 		 376 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0307169  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2636  basic membrane lipoprotein  41.57 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.894025 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3026  basic membrane lipoprotein  39.15 
 
 		 380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1927  basic membrane lipoprotein  42.81 
 
 		 382 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.940408  normal  0.0318829 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3721  basic membrane lipoprotein  41.87 
 
 		 367 aa  281  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1142  basic membrane lipoprotein  41.59 
 
 		 366 aa  280  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111164  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1953  basic membrane lipoprotein  41.98 
 
 		 373 aa  279  6e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0267127 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1507  Bmp family membrane protein  42.33 
 
 		 382 aa  275  7e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0216  basic membrane lipoprotein  40.45 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3237  basic membrane lipoprotein  41.41 
 
 		 352 aa  272  6e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5873  basic membrane lipoprotein  41.39 
 
 		 364 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2299  basic membrane lipoprotein  40.63 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0532  bmp family protein  55.2 
 
 		 400 aa  262  6e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1288  basic membrane lipoprotein  37.33 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1941  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  37.16 
 
 		 364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00208553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2318  basic membrane lipoprotein  36.93 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  0.178466 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4465  basic membrane lipoprotein  35.96 
 
 		 365 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.117985 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6465  basic membrane lipoprotein  35.55 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1406  basic membrane lipoprotein  37.05 
 
 		 386 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000211605  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0450  basic membrane lipoprotein  31.66 
 
 		 625 aa  192  7e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1460  basic membrane lipoprotein  32.9 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.892929 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0975  basic membrane lipoprotein  30.81 
 
 		 432 aa  184  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.494831 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1794  basic membrane lipoprotein  34.74 
 
 		 381 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1044  basic membrane lipoprotein  30.38 
 
 		 428 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00211594 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1314  basic membrane lipoprotein  31.62 
 
 		 431 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.348799  normal  0.383779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0141  Bmp family membrane protein  31.38 
 
 		 364 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041374  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1176  basic membrane lipoprotein  30.15 
 
 		 430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0623927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4847  basic membrane lipoprotein  34.3 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4236  basic membrane lipoprotein  33.24 
 
 		 360 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0536  bmp family protein  58.39 
 
 		 173 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736006  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2076  basic membrane lipoprotein  32.51 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0315473 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3152  basic membrane lipoprotein  30.59 
 
 		 380 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.445916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1001  basic membrane lipoprotein  32.5 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1243  basic membrane lipoprotein  31.89 
 
 		 379 aa  159  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.202679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1159  bmp family protein  31.72 
 
 		 363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4620  ABC transporter substrate-binding protein  31.94 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0689181 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5420  lipoprotein  28.82 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5243  basic membrane lipoprotein  29.94 
 
 		 365 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1368  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  30.75 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0529921  normal  0.073818 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0853  basic membrane lipoprotein  30.86 
 
 		 372 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.674254  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0270  basic membrane lipoprotein  31.48 
 
 		 372 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>