255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1460 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1460  basic membrane lipoprotein  100 
 
 
382 aa  789    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.892929 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1794  basic membrane lipoprotein  82.97 
 
 
381 aa  644    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1044  basic membrane lipoprotein  40.67 
 
 
428 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00211594 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2177  basic membrane lipoprotein  40.11 
 
 
368 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0975  basic membrane lipoprotein  38.34 
 
 
432 aa  253  3e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.494831 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3026  basic membrane lipoprotein  37.57 
 
 
380 aa  252  6e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2299  basic membrane lipoprotein  37.67 
 
 
384 aa  249  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1507  Bmp family membrane protein  39.77 
 
 
382 aa  248  9e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1314  basic membrane lipoprotein  39.58 
 
 
431 aa  248  2e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.348799  normal  0.383779 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1902  basic membrane lipoprotein  39.15 
 
 
359 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0567  bmp family protein  36.48 
 
 
355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1927  basic membrane lipoprotein  36.69 
 
 
382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.940408  normal  0.0318829 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0869  basic membrane lipoprotein  35.45 
 
 
356 aa  243  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3629  basic membrane lipoprotein  36.22 
 
 
355 aa  242  9e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178645  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1176  basic membrane lipoprotein  36.27 
 
 
430 aa  239  5e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0623927 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4187  basic membrane lipoprotein  36.54 
 
 
373 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.083899  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0673  basic membrane lipoprotein  35.64 
 
 
357 aa  236  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0759  bmp family protein  36.1 
 
 
364 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3237  basic membrane lipoprotein  36.62 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0663  basic membrane lipoprotein  35.83 
 
 
364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.888677  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0216  basic membrane lipoprotein  34.13 
 
 
354 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2594  basic membrane lipoprotein  37.46 
 
 
362 aa  232  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266805  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1288  basic membrane lipoprotein  35.98 
 
 
364 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1490  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  35.13 
 
 
376 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0307169  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1941  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  36.26 
 
 
364 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00208553  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2636  basic membrane lipoprotein  35.69 
 
 
376 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.894025 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2318  basic membrane lipoprotein  35.69 
 
 
368 aa  229  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  0.178466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2993  basic membrane lipoprotein  35.39 
 
 
361 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1923  basic membrane lipoprotein  33.15 
 
 
355 aa  222  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0526758  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1953  basic membrane lipoprotein  35.64 
 
 
373 aa  222  8e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0267127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2027  basic membrane lipoprotein  37.04 
 
 
426 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.073285  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1708  basic membrane lipoprotein  37.04 
 
 
426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.918914 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1979  basic membrane lipoprotein  36.03 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2148  basic membrane lipoprotein  37.12 
 
 
360 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.863295  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0224  hypothetical protein  34.93 
 
 
365 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01800  hypothetical protein  34.67 
 
 
365 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347768  normal  0.597763 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2379  basic membrane lipoprotein  35.75 
 
 
385 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185576  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0794  basic membrane lipoprotein  35.08 
 
 
380 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0638378  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1106  basic membrane lipoprotein  36.47 
 
 
357 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2177  lipoprotein  35.85 
 
 
380 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1406  basic membrane lipoprotein  36.39 
 
 
386 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000211605  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2146  basic membrane lipoprotein  34.26 
 
 
368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233394  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2501  basic membrane lipoprotein  33.7 
 
 
381 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403436  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2057  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  39.66 
 
 
359 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1415  basic membrane lipoprotein  33.87 
 
 
356 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218463  normal  0.0969049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3453  basic membrane lipoprotein  34.9 
 
 
383 aa  210  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1142  basic membrane lipoprotein  36.29 
 
 
366 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111164  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3942  hypothetical protein  34.88 
 
 
364 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1690  basic membrane lipoprotein  33.06 
 
 
355 aa  206  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00161056  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2169  lipoprotein  34.17 
 
 
357 aa  206  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0737964  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3243  basic membrane lipoprotein  33.85 
 
 
364 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25432  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3560  ABC transporter periplasmic-binding protein  33.85 
 
 
364 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0806  putative lipoprotein  40.8 
 
 
385 aa  204  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1766  basic membrane lipoprotein  34.38 
 
 
358 aa  203  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3176  basic membrane lipoprotein  42.39 
 
 
376 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0493  basic membrane lipoprotein  34.71 
 
 
358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00240976  normal  0.0511349 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1063  basic membrane lipoprotein  40.16 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1118  basic membrane lipoprotein  32.3 
 
 
359 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0536373  normal  0.804172 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5058  basic membrane lipoprotein  30.53 
 
 
365 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1044  basic membrane lipoprotein  34.91 
 
 
361 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3882  basic membrane lipoprotein  34.44 
 
 
366 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3296  basic membrane lipoprotein  34.34 
 
 
363 aa  199  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1060  basic membrane lipoprotein  39.36 
 
 
377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1002  basic membrane lipoprotein  39.84 
 
 
377 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3721  basic membrane lipoprotein  32.87 
 
 
367 aa  196  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3163  basic membrane lipoprotein  33.71 
 
 
387 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1039  basic membrane lipoprotein  35.25 
 
 
383 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5006  basic membrane lipoprotein  37.12 
 
 
382 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167093  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2142  basic membrane lipoprotein  32.4 
 
 
385 aa  190  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1135  basic membrane lipoprotein  37.59 
 
 
388 aa  189  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.293026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3900  basic membrane lipoprotein  37.22 
 
 
390 aa  189  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381277  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2964  putative basic membrane protein  31.95 
 
 
387 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0928  basic membrane lipoprotein  33.07 
 
 
360 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2443  basic membrane lipoprotein  33.15 
 
 
384 aa  187  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1903  basic membrane lipoprotein  30.62 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94528  normal  0.373123 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1015  basic membrane lipoprotein  32.87 
 
 
362 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1719  basic membrane lipoprotein  30.35 
 
 
358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00548824  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1001  basic membrane lipoprotein  34.2 
 
 
363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1486  basic membrane lipoprotein  34.34 
 
 
386 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1159  bmp family protein  34.36 
 
 
363 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2444  basic membrane lipoprotein  32.87 
 
 
382 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2138  basic membrane lipoprotein  31.74 
 
 
390 aa  179  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4236  basic membrane lipoprotein  32.41 
 
 
360 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4847  basic membrane lipoprotein  32.13 
 
 
371 aa  171  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6465  basic membrane lipoprotein  32.55 
 
 
365 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866986  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5873  basic membrane lipoprotein  28.76 
 
 
364 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4465  basic membrane lipoprotein  32.15 
 
 
365 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.117985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1243  basic membrane lipoprotein  32.95 
 
 
379 aa  166  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.202679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2076  basic membrane lipoprotein  34.09 
 
 
371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0315473 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0450  basic membrane lipoprotein  29.69 
 
 
625 aa  163  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4349  basic membrane lipoprotein  32.19 
 
 
366 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.494999  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4474  basic membrane lipoprotein  33.6 
 
 
375 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.766807 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3152  basic membrane lipoprotein  30.66 
 
 
380 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.445916 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5420  lipoprotein  32.29 
 
 
370 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5659  lipoprotein  33.33 
 
 
422 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373529  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6457  basic membrane lipoprotein  33.15 
 
 
375 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.153955 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0769  bmp family protein  30.87 
 
 
374 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.109974  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0141  Bmp family membrane protein  27.91 
 
 
364 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0270  basic membrane lipoprotein  31.38 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5243  basic membrane lipoprotein  31.2 
 
 
365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>