224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4620 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4620  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 369 aa  760    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0689181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2020  basic membrane lipoprotein  63.81 
 
 		 368 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1117  basic membrane lipoprotein  64.64 
 
 		 384 aa  481  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.246215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1701  basic membrane lipoprotein  63.81 
 
 		 379 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.126126 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4474  basic membrane lipoprotein  61.83 
 
 		 375 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.766807 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5243  basic membrane lipoprotein  62.6 
 
 		 365 aa  471  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0853  basic membrane lipoprotein  61.43 
 
 		 372 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.674254  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1368  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  62.05 
 
 		 365 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0529921  normal  0.073818 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5659  lipoprotein  61.75 
 
 		 422 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373529  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0270  basic membrane lipoprotein  62.67 
 
 		 372 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6457  basic membrane lipoprotein  63.45 
 
 		 375 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.153955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0836  basic membrane lipoprotein  59.78 
 
 		 367 aa  460  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1169  twin-arginine translocation pathway signal  61.26 
 
 		 369 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1360  bmp family protein  61.54 
 
 		 369 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0769  bmp family protein  62.33 
 
 		 374 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.109974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3026  basic membrane lipoprotein  65.41 
 
 		 381 aa  434  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3237  basic membrane lipoprotein  39.35 
 
 		 352 aa  246  6e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0216  basic membrane lipoprotein  39.12 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3026  basic membrane lipoprotein  38.39 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1927  basic membrane lipoprotein  40.54 
 
 		 382 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.940408  normal  0.0318829 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2177  basic membrane lipoprotein  40.06 
 
 		 368 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1507  Bmp family membrane protein  39.64 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1953  basic membrane lipoprotein  38.55 
 
 		 373 aa  219  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0267127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2299  basic membrane lipoprotein  35.59 
 
 		 384 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0663  basic membrane lipoprotein  37.4 
 
 		 364 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.888677  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0759  bmp family protein  36.57 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0869  basic membrane lipoprotein  38.72 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2993  basic membrane lipoprotein  38.97 
 
 		 361 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0673  basic membrane lipoprotein  35.1 
 
 		 357 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1923  basic membrane lipoprotein  34.57 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0526758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1406  basic membrane lipoprotein  36.53 
 
 		 386 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000211605  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1001  basic membrane lipoprotein  36.06 
 
 		 363 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1159  bmp family protein  36.75 
 
 		 363 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0806  putative lipoprotein  37.72 
 
 		 385 aa  193  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2501  basic membrane lipoprotein  36.04 
 
 		 381 aa  193  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403436  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1902  basic membrane lipoprotein  36.12 
 
 		 359 aa  192  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2594  basic membrane lipoprotein  34.44 
 
 		 362 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266805  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1979  basic membrane lipoprotein  36.04 
 
 		 385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2379  basic membrane lipoprotein  36.04 
 
 		 385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0794  basic membrane lipoprotein  35.14 
 
 		 380 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0638378  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2169  lipoprotein  35.18 
 
 		 357 aa  189  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0737964  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2177  lipoprotein  35.8 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1486  basic membrane lipoprotein  36.12 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01800  hypothetical protein  34.74 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347768  normal  0.597763 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2636  basic membrane lipoprotein  34.03 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.894025 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0224  hypothetical protein  34.14 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2142  basic membrane lipoprotein  36.83 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1490  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  33.43 
 
 		 376 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0307169  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1039  basic membrane lipoprotein  36.31 
 
 		 383 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4847  basic membrane lipoprotein  36.12 
 
 		 371 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2443  basic membrane lipoprotein  34.83 
 
 		 384 aa  179  9e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1288  basic membrane lipoprotein  31.99 
 
 		 364 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3163  basic membrane lipoprotein  35.82 
 
 		 387 aa  179  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4187  basic membrane lipoprotein  32.64 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.083899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1135  basic membrane lipoprotein  34.23 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293026 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5006  basic membrane lipoprotein  35.63 
 
 		 382 aa  178  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3900  basic membrane lipoprotein  35.82 
 
 		 390 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381277  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2318  basic membrane lipoprotein  32.93 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  0.178466 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1415  basic membrane lipoprotein  34.84 
 
 		 356 aa  176  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218463  normal  0.0969049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1941  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  32.54 
 
 		 364 aa  176  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00208553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1063  basic membrane lipoprotein  37.42 
 
 		 377 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3721  basic membrane lipoprotein  32.93 
 
 		 367 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3453  basic membrane lipoprotein  33.63 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3176  basic membrane lipoprotein  35.62 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1060  basic membrane lipoprotein  37.1 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3882  basic membrane lipoprotein  32.7 
 
 		 366 aa  173  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2444  basic membrane lipoprotein  35.14 
 
 		 382 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1118  basic membrane lipoprotein  33.71 
 
 		 359 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0536373  normal  0.804172 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1002  basic membrane lipoprotein  37.1 
 
 		 377 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1719  basic membrane lipoprotein  35.71 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00548824  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0567  bmp family protein  33.84 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3629  basic membrane lipoprotein  33.62 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178645  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1142  basic membrane lipoprotein  32.34 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111164  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3942  hypothetical protein  31.42 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1903  basic membrane lipoprotein  35.42 
 
 		 358 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94528  normal  0.373123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5058  basic membrane lipoprotein  33.61 
 
 		 365 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2138  basic membrane lipoprotein  35.05 
 
 		 390 aa  169  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2148  basic membrane lipoprotein  36.07 
 
 		 360 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.863295  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0450  basic membrane lipoprotein  30.99 
 
 		 625 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3243  basic membrane lipoprotein  30.87 
 
 		 364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4236  basic membrane lipoprotein  34.02 
 
 		 360 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2057  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  33.93 
 
 		 359 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1044  basic membrane lipoprotein  33.43 
 
 		 361 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5873  basic membrane lipoprotein  31.72 
 
 		 364 aa  165  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3560  ABC transporter periplasmic-binding protein  30.6 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2146  basic membrane lipoprotein  31.16 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1106  basic membrane lipoprotein  34.44 
 
 		 357 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1314  basic membrane lipoprotein  34.35 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.348799  normal  0.383779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2027  basic membrane lipoprotein  34.14 
 
 		 426 aa  159  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.073285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1708  basic membrane lipoprotein  34.14 
 
 		 426 aa  159  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.918914 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3296  basic membrane lipoprotein  30.83 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4349  basic membrane lipoprotein  32.53 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.494999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0975  basic membrane lipoprotein  32.89 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.494831 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1690  basic membrane lipoprotein  32.22 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00161056  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0493  basic membrane lipoprotein  30.36 
 
 		 358 aa  152  8e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00240976  normal  0.0511349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1015  basic membrane lipoprotein  31.94 
 
 		 362 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0928  basic membrane lipoprotein  31.04 
 
 		 360 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2964  putative basic membrane protein  30.81 
 
 		 387 aa  149  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1176  basic membrane lipoprotein  31.79 
 
 		 430 aa  147  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0623927 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1766  basic membrane lipoprotein  31.52 
 
 		 358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>