255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1486 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1486  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 386 aa  779    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1135  basic membrane lipoprotein  82.64 
 
 		 388 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3163  basic membrane lipoprotein  82.17 
 
 		 387 aa  595  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1039  basic membrane lipoprotein  85.23 
 
 		 383 aa  597  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3900  basic membrane lipoprotein  79.38 
 
 		 390 aa  591  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381277  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5006  basic membrane lipoprotein  76.62 
 
 		 382 aa  583  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2443  basic membrane lipoprotein  74.29 
 
 		 384 aa  556  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2142  basic membrane lipoprotein  76.42 
 
 		 385 aa  547  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3453  basic membrane lipoprotein  71.69 
 
 		 383 aa  540  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2138  basic membrane lipoprotein  65.53 
 
 		 390 aa  491  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2444  basic membrane lipoprotein  64.25 
 
 		 382 aa  489  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2501  basic membrane lipoprotein  64.09 
 
 		 381 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403436  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1979  basic membrane lipoprotein  66.96 
 
 		 385 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2379  basic membrane lipoprotein  66.96 
 
 		 385 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0794  basic membrane lipoprotein  64.92 
 
 		 380 aa  450  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0638378  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2177  lipoprotein  64.78 
 
 		 380 aa  444  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3176  basic membrane lipoprotein  63.25 
 
 		 376 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0806  putative lipoprotein  64.94 
 
 		 385 aa  442  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1060  basic membrane lipoprotein  63.06 
 
 		 377 aa  438  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1063  basic membrane lipoprotein  62.76 
 
 		 377 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1002  basic membrane lipoprotein  63.06 
 
 		 377 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0869  basic membrane lipoprotein  54.46 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1288  basic membrane lipoprotein  50.39 
 
 		 364 aa  362  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1490  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  52.24 
 
 		 376 aa  358  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0307169  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2636  basic membrane lipoprotein  51.64 
 
 		 376 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.894025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1941  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  52.27 
 
 		 364 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00208553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2318  basic membrane lipoprotein  48.43 
 
 		 368 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  0.178466 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4187  basic membrane lipoprotein  50.45 
 
 		 373 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.083899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2993  basic membrane lipoprotein  49.4 
 
 		 361 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0663  basic membrane lipoprotein  49.55 
 
 		 364 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.888677  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3629  basic membrane lipoprotein  50.6 
 
 		 355 aa  339  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178645  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1923  basic membrane lipoprotein  48.8 
 
 		 355 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0526758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0759  bmp family protein  48.96 
 
 		 364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2594  basic membrane lipoprotein  46.53 
 
 		 362 aa  335  5.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266805  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0567  bmp family protein  49.7 
 
 		 355 aa  334  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1902  basic membrane lipoprotein  48.96 
 
 		 359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2057  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  47.93 
 
 		 359 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5058  basic membrane lipoprotein  48.53 
 
 		 365 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0673  basic membrane lipoprotein  45.97 
 
 		 357 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1118  basic membrane lipoprotein  47.85 
 
 		 359 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0536373  normal  0.804172 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3237  basic membrane lipoprotein  45.51 
 
 		 352 aa  318  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1927  basic membrane lipoprotein  42.97 
 
 		 382 aa  317  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.940408  normal  0.0318829 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1415  basic membrane lipoprotein  47.51 
 
 		 356 aa  317  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218463  normal  0.0969049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0224  hypothetical protein  45.05 
 
 		 365 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1766  basic membrane lipoprotein  45.41 
 
 		 358 aa  316  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01800  hypothetical protein  45.05 
 
 		 365 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347768  normal  0.597763 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2148  basic membrane lipoprotein  50.58 
 
 		 360 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.863295  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2177  basic membrane lipoprotein  46.43 
 
 		 368 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2169  lipoprotein  47.76 
 
 		 357 aa  313  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0737964  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1507  Bmp family membrane protein  43.32 
 
 		 382 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3882  basic membrane lipoprotein  47.7 
 
 		 366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1903  basic membrane lipoprotein  46.47 
 
 		 358 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94528  normal  0.373123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3026  basic membrane lipoprotein  42.44 
 
 		 380 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1719  basic membrane lipoprotein  46.33 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00548824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0493  basic membrane lipoprotein  47.59 
 
 		 358 aa  300  4e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00240976  normal  0.0511349 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0928  basic membrane lipoprotein  43.43 
 
 		 360 aa  299  7e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1953  basic membrane lipoprotein  43.61 
 
 		 373 aa  296  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0267127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1690  basic membrane lipoprotein  46.99 
 
 		 355 aa  295  7e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00161056  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1015  basic membrane lipoprotein  45.21 
 
 		 362 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3296  basic membrane lipoprotein  42.57 
 
 		 363 aa  292  7e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0216  basic membrane lipoprotein  43.2 
 
 		 354 aa  291  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3243  basic membrane lipoprotein  42.3 
 
 		 364 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3942  hypothetical protein  42.04 
 
 		 364 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3560  ABC transporter periplasmic-binding protein  42.3 
 
 		 364 aa  289  6e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1044  basic membrane lipoprotein  45.51 
 
 		 361 aa  289  7e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2964  putative basic membrane protein  44.06 
 
 		 387 aa  286  5e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1106  basic membrane lipoprotein  47.13 
 
 		 357 aa  286  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2146  basic membrane lipoprotein  41.43 
 
 		 368 aa  285  7e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1142  basic membrane lipoprotein  44.51 
 
 		 366 aa  285  9e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111164  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3721  basic membrane lipoprotein  41.44 
 
 		 367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2027  basic membrane lipoprotein  46.83 
 
 		 426 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.073285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1708  basic membrane lipoprotein  46.83 
 
 		 426 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.918914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2299  basic membrane lipoprotein  37.99 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1406  basic membrane lipoprotein  38.18 
 
 		 386 aa  246  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000211605  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5873  basic membrane lipoprotein  35.29 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6465  basic membrane lipoprotein  36.07 
 
 		 365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4465  basic membrane lipoprotein  34.82 
 
 		 365 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.117985 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0141  Bmp family membrane protein  36.78 
 
 		 364 aa  227  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041374  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0450  basic membrane lipoprotein  34.5 
 
 		 625 aa  222  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1044  basic membrane lipoprotein  33.02 
 
 		 428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00211594 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1314  basic membrane lipoprotein  34.15 
 
 		 431 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.348799  normal  0.383779 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3152  basic membrane lipoprotein  34.56 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.445916 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0532  bmp family protein  45.87 
 
 		 400 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1176  basic membrane lipoprotein  33.86 
 
 		 430 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0623927 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1794  basic membrane lipoprotein  38.01 
 
 		 381 aa  197  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0975  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 432 aa  196  6e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.494831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1159  bmp family protein  33.53 
 
 		 363 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0270  basic membrane lipoprotein  37.25 
 
 		 372 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4847  basic membrane lipoprotein  34.49 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1368  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  36.2 
 
 		 365 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0529921  normal  0.073818 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5243  basic membrane lipoprotein  35.91 
 
 		 365 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1001  basic membrane lipoprotein  33.71 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2076  basic membrane lipoprotein  33.72 
 
 		 371 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0315473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0836  basic membrane lipoprotein  34.97 
 
 		 367 aa  186  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4620  ABC transporter substrate-binding protein  36.15 
 
 		 369 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0689181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1243  basic membrane lipoprotein  33.53 
 
 		 379 aa  186  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.202679 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4474  basic membrane lipoprotein  32.31 
 
 		 375 aa  186  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.766807 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0764  basic membrane lipoprotein  32.73 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000134233  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4236  basic membrane lipoprotein  34.16 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1117  basic membrane lipoprotein  35.29 
 
 		 384 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.246215  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>