270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1063 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1063  basic membrane lipoprotein  100 
 
 
377 aa  762    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1002  basic membrane lipoprotein  98.67 
 
 
377 aa  752    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1060  basic membrane lipoprotein  99.47 
 
 
377 aa  759    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3176  basic membrane lipoprotein  83.51 
 
 
376 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0806  putative lipoprotein  67.07 
 
 
385 aa  472  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3453  basic membrane lipoprotein  64.5 
 
 
383 aa  460  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5006  basic membrane lipoprotein  62.5 
 
 
382 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167093  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1486  basic membrane lipoprotein  62.76 
 
 
386 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2443  basic membrane lipoprotein  61.79 
 
 
384 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1135  basic membrane lipoprotein  62.87 
 
 
388 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.293026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3900  basic membrane lipoprotein  62.28 
 
 
390 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381277  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1039  basic membrane lipoprotein  62.35 
 
 
383 aa  435  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2142  basic membrane lipoprotein  62.24 
 
 
385 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3163  basic membrane lipoprotein  62.35 
 
 
387 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2501  basic membrane lipoprotein  56.27 
 
 
381 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403436  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2138  basic membrane lipoprotein  56.5 
 
 
390 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2379  basic membrane lipoprotein  59.88 
 
 
385 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185576  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2177  lipoprotein  60.06 
 
 
380 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0794  basic membrane lipoprotein  56.98 
 
 
380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0638378  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1979  basic membrane lipoprotein  59.58 
 
 
385 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2444  basic membrane lipoprotein  57.14 
 
 
382 aa  402  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0869  basic membrane lipoprotein  52.33 
 
 
356 aa  385  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2594  basic membrane lipoprotein  51.06 
 
 
362 aa  354  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266805  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5058  basic membrane lipoprotein  46.01 
 
 
365 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1288  basic membrane lipoprotein  49.73 
 
 
364 aa  345  7e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2057  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  50.15 
 
 
359 aa  344  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1923  basic membrane lipoprotein  51.35 
 
 
355 aa  344  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0526758  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0567  bmp family protein  49.7 
 
 
355 aa  334  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1902  basic membrane lipoprotein  51.2 
 
 
359 aa  333  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1941  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  50.15 
 
 
364 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00208553  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2318  basic membrane lipoprotein  49.28 
 
 
368 aa  333  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  0.178466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1490  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  48.96 
 
 
376 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0307169  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3629  basic membrane lipoprotein  48.5 
 
 
355 aa  331  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178645  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2993  basic membrane lipoprotein  49.4 
 
 
361 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2636  basic membrane lipoprotein  48.66 
 
 
376 aa  328  7e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.894025 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1118  basic membrane lipoprotein  43.78 
 
 
359 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0536373  normal  0.804172 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4187  basic membrane lipoprotein  45.48 
 
 
373 aa  325  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.083899  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2177  basic membrane lipoprotein  46.73 
 
 
368 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0663  basic membrane lipoprotein  47.6 
 
 
364 aa  322  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.888677  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0224  hypothetical protein  47.89 
 
 
365 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0759  bmp family protein  47.01 
 
 
364 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3882  basic membrane lipoprotein  48.41 
 
 
366 aa  319  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0673  basic membrane lipoprotein  47.6 
 
 
357 aa  319  5e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1927  basic membrane lipoprotein  43.57 
 
 
382 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.940408  normal  0.0318829 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1766  basic membrane lipoprotein  47.38 
 
 
358 aa  318  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01800  hypothetical protein  47.29 
 
 
365 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347768  normal  0.597763 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3237  basic membrane lipoprotein  45.78 
 
 
352 aa  315  9e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1106  basic membrane lipoprotein  49.7 
 
 
357 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3721  basic membrane lipoprotein  46.99 
 
 
367 aa  313  3.9999999999999997e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3296  basic membrane lipoprotein  45.45 
 
 
363 aa  311  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0493  basic membrane lipoprotein  47.13 
 
 
358 aa  311  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00240976  normal  0.0511349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2148  basic membrane lipoprotein  49.12 
 
 
360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.863295  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0216  basic membrane lipoprotein  44.26 
 
 
354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2146  basic membrane lipoprotein  45.98 
 
 
368 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233394  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2027  basic membrane lipoprotein  49.09 
 
 
426 aa  306  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.073285  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1953  basic membrane lipoprotein  48.65 
 
 
373 aa  306  4.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0267127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1708  basic membrane lipoprotein  49.09 
 
 
426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.918914 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2169  lipoprotein  45.45 
 
 
357 aa  306  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0737964  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1507  Bmp family membrane protein  42.19 
 
 
382 aa  306  6e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1415  basic membrane lipoprotein  43.99 
 
 
356 aa  305  8.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218463  normal  0.0969049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1719  basic membrane lipoprotein  45.62 
 
 
358 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00548824  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1015  basic membrane lipoprotein  44.51 
 
 
362 aa  301  9e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0928  basic membrane lipoprotein  44.28 
 
 
360 aa  301  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1903  basic membrane lipoprotein  45.45 
 
 
358 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94528  normal  0.373123 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1690  basic membrane lipoprotein  45.93 
 
 
355 aa  299  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00161056  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1044  basic membrane lipoprotein  45.45 
 
 
361 aa  295  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2299  basic membrane lipoprotein  41.75 
 
 
384 aa  294  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3026  basic membrane lipoprotein  40 
 
 
380 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1142  basic membrane lipoprotein  44.17 
 
 
366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111164  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2964  putative basic membrane protein  42.51 
 
 
387 aa  286  5e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3942  hypothetical protein  42.86 
 
 
364 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3243  basic membrane lipoprotein  42.39 
 
 
364 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25432  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3560  ABC transporter periplasmic-binding protein  42.39 
 
 
364 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1406  basic membrane lipoprotein  40.18 
 
 
386 aa  258  9e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000211605  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5873  basic membrane lipoprotein  38.24 
 
 
364 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4465  basic membrane lipoprotein  36.5 
 
 
365 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.117985 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6465  basic membrane lipoprotein  36.58 
 
 
365 aa  238  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866986  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0141  Bmp family membrane protein  36.09 
 
 
364 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041374  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1044  basic membrane lipoprotein  36.02 
 
 
428 aa  206  5e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00211594 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1314  basic membrane lipoprotein  36.99 
 
 
431 aa  203  4e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.348799  normal  0.383779 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0975  basic membrane lipoprotein  36.94 
 
 
432 aa  202  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.494831 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1460  basic membrane lipoprotein  40.16 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.892929 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5243  basic membrane lipoprotein  36.34 
 
 
365 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3152  basic membrane lipoprotein  34.48 
 
 
380 aa  196  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.445916 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1794  basic membrane lipoprotein  36.4 
 
 
381 aa  195  9e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1368  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  36.04 
 
 
365 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0529921  normal  0.073818 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0450  basic membrane lipoprotein  31.91 
 
 
625 aa  193  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1176  basic membrane lipoprotein  35.4 
 
 
430 aa  193  5e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0623927 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2076  basic membrane lipoprotein  36.44 
 
 
371 aa  192  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0315473 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0532  bmp family protein  43.32 
 
 
400 aa  189  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1243  basic membrane lipoprotein  35.57 
 
 
379 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.202679 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1169  twin-arginine translocation pathway signal  35.57 
 
 
369 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1360  bmp family protein  35.57 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0836  basic membrane lipoprotein  32.55 
 
 
367 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0853  basic membrane lipoprotein  34.73 
 
 
372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.674254  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4847  basic membrane lipoprotein  35.73 
 
 
371 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4474  basic membrane lipoprotein  34.12 
 
 
375 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.766807 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6457  basic membrane lipoprotein  33.53 
 
 
375 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.153955 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0270  basic membrane lipoprotein  33.05 
 
 
372 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3026  basic membrane lipoprotein  34.09 
 
 
381 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>