264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2993 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2993  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 361 aa  737    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0663  basic membrane lipoprotein  81.89 
 
 		 364 aa  623  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.888677  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0759  bmp family protein  80.78 
 
 		 364 aa  618  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0673  basic membrane lipoprotein  80.4 
 
 		 357 aa  598  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01800  hypothetical protein  73.2 
 
 		 365 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347768  normal  0.597763 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0224  hypothetical protein  72.93 
 
 		 365 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1923  basic membrane lipoprotein  57.39 
 
 		 355 aa  434  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0526758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1902  basic membrane lipoprotein  60.96 
 
 		 359 aa  428  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2057  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  54.25 
 
 		 359 aa  398  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0567  bmp family protein  53.67 
 
 		 355 aa  391  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3629  basic membrane lipoprotein  53.11 
 
 		 355 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178645  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5058  basic membrane lipoprotein  52.07 
 
 		 365 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2594  basic membrane lipoprotein  53.8 
 
 		 362 aa  384  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266805  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1118  basic membrane lipoprotein  52.15 
 
 		 359 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0536373  normal  0.804172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2148  basic membrane lipoprotein  56.72 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.863295  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2169  lipoprotein  52.56 
 
 		 357 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0737964  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0869  basic membrane lipoprotein  51.69 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3942  hypothetical protein  50.42 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0928  basic membrane lipoprotein  49.58 
 
 		 360 aa  368  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1719  basic membrane lipoprotein  52.19 
 
 		 358 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00548824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0493  basic membrane lipoprotein  53.59 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00240976  normal  0.0511349 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1415  basic membrane lipoprotein  50.7 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218463  normal  0.0969049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1903  basic membrane lipoprotein  52.19 
 
 		 358 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94528  normal  0.373123 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1766  basic membrane lipoprotein  52.51 
 
 		 358 aa  362  6e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3243  basic membrane lipoprotein  49.03 
 
 		 364 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3560  ABC transporter periplasmic-binding protein  48.75 
 
 		 364 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2964  putative basic membrane protein  51.4 
 
 		 387 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1106  basic membrane lipoprotein  54.24 
 
 		 357 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3163  basic membrane lipoprotein  51.06 
 
 		 387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2142  basic membrane lipoprotein  50.61 
 
 		 385 aa  350  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3237  basic membrane lipoprotein  49.11 
 
 		 352 aa  351  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3026  basic membrane lipoprotein  49.23 
 
 		 380 aa  349  5e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1690  basic membrane lipoprotein  52.68 
 
 		 355 aa  348  6e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00161056  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3900  basic membrane lipoprotein  51.52 
 
 		 390 aa  348  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381277  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1135  basic membrane lipoprotein  50.61 
 
 		 388 aa  348  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2027  basic membrane lipoprotein  53.33 
 
 		 426 aa  346  4e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.073285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1708  basic membrane lipoprotein  53.33 
 
 		 426 aa  345  5e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.918914 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3721  basic membrane lipoprotein  49.1 
 
 		 367 aa  343  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1507  Bmp family membrane protein  49.85 
 
 		 382 aa  341  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1927  basic membrane lipoprotein  48.92 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.940408  normal  0.0318829 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1486  basic membrane lipoprotein  49.4 
 
 		 386 aa  339  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1979  basic membrane lipoprotein  49.55 
 
 		 385 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5006  basic membrane lipoprotein  47.59 
 
 		 382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1015  basic membrane lipoprotein  48.94 
 
 		 362 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2379  basic membrane lipoprotein  49.25 
 
 		 385 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2177  basic membrane lipoprotein  46.25 
 
 		 368 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2443  basic membrane lipoprotein  47.73 
 
 		 384 aa  335  7e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1039  basic membrane lipoprotein  50.76 
 
 		 383 aa  335  7.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0806  putative lipoprotein  51.23 
 
 		 385 aa  335  9e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2177  lipoprotein  49.4 
 
 		 380 aa  335  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2138  basic membrane lipoprotein  49.4 
 
 		 390 aa  333  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2501  basic membrane lipoprotein  49.7 
 
 		 381 aa  332  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403436  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0794  basic membrane lipoprotein  49.55 
 
 		 380 aa  332  7.000000000000001e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0638378  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0216  basic membrane lipoprotein  46.11 
 
 		 354 aa  332  8e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3453  basic membrane lipoprotein  47.92 
 
 		 383 aa  331  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2444  basic membrane lipoprotein  48.49 
 
 		 382 aa  330  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1063  basic membrane lipoprotein  49.4 
 
 		 377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1953  basic membrane lipoprotein  47.73 
 
 		 373 aa  326  4.0000000000000003e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0267127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2636  basic membrane lipoprotein  46.87 
 
 		 376 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.894025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1490  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  46.57 
 
 		 376 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0307169  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1060  basic membrane lipoprotein  48.8 
 
 		 377 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1002  basic membrane lipoprotein  49.1 
 
 		 377 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3176  basic membrane lipoprotein  47.58 
 
 		 376 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1288  basic membrane lipoprotein  46.01 
 
 		 364 aa  318  9e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2318  basic membrane lipoprotein  46.36 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  0.178466 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3296  basic membrane lipoprotein  44.51 
 
 		 363 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2299  basic membrane lipoprotein  45.24 
 
 		 384 aa  311  9e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5873  basic membrane lipoprotein  42.62 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1941  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  46.15 
 
 		 364 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00208553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3882  basic membrane lipoprotein  43.84 
 
 		 366 aa  308  6.999999999999999e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4187  basic membrane lipoprotein  41.89 
 
 		 373 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.083899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2146  basic membrane lipoprotein  43.4 
 
 		 368 aa  298  8e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1142  basic membrane lipoprotein  44.21 
 
 		 366 aa  293  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111164  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1044  basic membrane lipoprotein  42.58 
 
 		 361 aa  290  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1406  basic membrane lipoprotein  43.95 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000211605  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0141  Bmp family membrane protein  39.94 
 
 		 364 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041374  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6465  basic membrane lipoprotein  38.66 
 
 		 365 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4465  basic membrane lipoprotein  38.53 
 
 		 365 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.117985 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0450  basic membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 625 aa  241  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0975  basic membrane lipoprotein  36.02 
 
 		 432 aa  236  6e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.494831 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0532  bmp family protein  47.15 
 
 		 400 aa  232  9e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1794  basic membrane lipoprotein  36.62 
 
 		 381 aa  230  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1176  basic membrane lipoprotein  34.16 
 
 		 430 aa  229  7e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0623927 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1314  basic membrane lipoprotein  36.46 
 
 		 431 aa  228  1e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.348799  normal  0.383779 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1460  basic membrane lipoprotein  34.49 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.892929 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1044  basic membrane lipoprotein  34.57 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00211594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0270  basic membrane lipoprotein  38.89 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4847  basic membrane lipoprotein  36.34 
 
 		 371 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5243  basic membrane lipoprotein  38.37 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3152  basic membrane lipoprotein  34.67 
 
 		 380 aa  206  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.445916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1368  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  38.08 
 
 		 365 aa  206  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0529921  normal  0.073818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3026  basic membrane lipoprotein  39.26 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0769  bmp family protein  36.7 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.109974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0853  basic membrane lipoprotein  35.77 
 
 		 372 aa  203  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.674254  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1169  twin-arginine translocation pathway signal  38.89 
 
 		 369 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4620  ABC transporter substrate-binding protein  38.97 
 
 		 369 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0689181 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1360  bmp family protein  38.89 
 
 		 369 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5659  lipoprotein  36.8 
 
 		 422 aa  202  8e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373529  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0836  basic membrane lipoprotein  35.77 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2020  basic membrane lipoprotein  36.78 
 
 		 368 aa  197  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>