More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0840 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
1371 aa  2795    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.86 
 
 
988 aa  207  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.62 
 
 
1056 aa  199  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.45 
 
 
1056 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.94 
 
 
818 aa  184  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  21.63 
 
 
878 aa  179  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.37 
 
 
784 aa  177  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.41 
 
 
1022 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.58 
 
 
758 aa  164  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  20.57 
 
 
810 aa  161  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 
409 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 
4079 aa  143  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 
602 aa  140  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 
409 aa  139  5e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.11 
 
 
543 aa  138  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
409 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.86 
 
 
733 aa  132  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  21.67 
 
 
1013 aa  126  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.45 
 
 
1979 aa  126  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
450 aa  125  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 
762 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
2240 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  26.48 
 
 
577 aa  122  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  25.96 
 
 
577 aa  119  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  20.35 
 
 
927 aa  119  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 
3145 aa  119  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 
597 aa  119  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  17.41 
 
 
1276 aa  118  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
718 aa  118  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  22.62 
 
 
566 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 
827 aa  116  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
594 aa  116  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 
1421 aa  114  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  22.25 
 
 
764 aa  114  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  21.66 
 
 
4489 aa  111  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 
740 aa  110  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  27.99 
 
 
833 aa  108  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  21.41 
 
 
465 aa  108  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 
1060 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  21.84 
 
 
462 aa  105  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  22.8 
 
 
750 aa  104  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  23.78 
 
 
708 aa  104  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 
366 aa  103  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 
375 aa  103  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  20.73 
 
 
750 aa  102  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  23.19 
 
 
1764 aa  102  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  29.35 
 
 
828 aa  102  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.82 
 
 
1694 aa  102  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  20.36 
 
 
1094 aa  100  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0582  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 
263 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  22.36 
 
 
887 aa  100  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  19.8 
 
 
767 aa  100  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  18.67 
 
 
649 aa  99.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
288 aa  98.6  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  20 
 
 
725 aa  98.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  20.92 
 
 
955 aa  97.1  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 
879 aa  97.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  21.1 
 
 
1049 aa  97.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 
792 aa  97.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0599  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.85 
 
 
263 aa  96.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453663  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  22.04 
 
 
448 aa  96.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 
344 aa  95.9  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 
279 aa  95.9  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.52 
 
 
632 aa  96.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  19.01 
 
 
635 aa  95.9  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.17 
 
 
3301 aa  95.5  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  18.98 
 
 
562 aa  95.1  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  19.35 
 
 
397 aa  95.1  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 
505 aa  94.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  23.08 
 
 
1288 aa  94  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0887  Tetratricopeptide domain protein  21.55 
 
 
1339 aa  94  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.102317 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  23.28 
 
 
573 aa  93.2  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  20.54 
 
 
561 aa  92.4  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  19.14 
 
 
1737 aa  92.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  25.5 
 
 
1040 aa  92  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  24.25 
 
 
620 aa  91.7  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  21.03 
 
 
622 aa  90.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  21.91 
 
 
436 aa  90.5  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
512 aa  90.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  22.9 
 
 
875 aa  90.1  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  21.85 
 
 
706 aa  90.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  20.24 
 
 
561 aa  89.7  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 
620 aa  89  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  23.89 
 
 
1507 aa  88.6  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.63 
 
 
1067 aa  88.2  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 
301 aa  87.8  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  24.92 
 
 
417 aa  87.8  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  21.07 
 
 
828 aa  87.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  21.07 
 
 
828 aa  88.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.09 
 
 
2145 aa  87.8  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  22.2 
 
 
1297 aa  87  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  22.59 
 
 
732 aa  87.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  23.44 
 
 
626 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  21.11 
 
 
392 aa  87  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  20.18 
 
 
3172 aa  86.7  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.5 
 
 
689 aa  86.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 
722 aa  85.9  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.12 
 
 
289 aa  85.5  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  21.3 
 
 
301 aa  85.5  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.19 
 
 
784 aa  85.5  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>