More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7547 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 392 aa  769    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  39.9 
 
 		 394 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  37.5 
 
 		 423 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  38.28 
 
 		 529 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  37.69 
 
 		 412 aa  206  8e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  36.89 
 
 		 443 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  38.07 
 
 		 486 aa  199  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2284  protein of unknown function UPF0118  40 
 
 		 406 aa  199  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  36.39 
 
 		 357 aa  196  5.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  32.71 
 
 		 388 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3997  hypothetical protein  35.15 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00194517  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  37.01 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1608  hypothetical protein  36.71 
 
 		 371 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55717  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  33.02 
 
 		 371 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  34.66 
 
 		 436 aa  149  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  32.71 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  29.69 
 
 		 354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  29.9 
 
 		 373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  29.94 
 
 		 358 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  28.19 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  29.91 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  27.25 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  26.48 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  28.67 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  26.18 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  28.8 
 
 		 370 aa  99  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  31.13 
 
 		 348 aa  99.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08230  predicted permease  31.9 
 
 		 440 aa  96.7  7e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  28.05 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  29.41 
 
 		 358 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  27.58 
 
 		 397 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  26.69 
 
 		 345 aa  93.6  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  28.21 
 
 		 487 aa  93.6  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  26.69 
 
 		 386 aa  93.2  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  26 
 
 		 526 aa  93.2  7e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  28.21 
 
 		 423 aa  92.8  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  29.38 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  23.95 
 
 		 460 aa  91.7  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  22.44 
 
 		 361 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  22.44 
 
 		 361 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  22.26 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  22.44 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  22.26 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  26.5 
 
 		 354 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  24.06 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  27.71 
 
 		 368 aa  87.8  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  24.59 
 
 		 436 aa  87.8  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  26.69 
 
 		 345 aa  87.4  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  22.53 
 
 		 402 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  22.53 
 
 		 402 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  21.61 
 
 		 348 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  21.61 
 
 		 361 aa  86.7  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  21.61 
 
 		 361 aa  86.7  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  21.61 
 
 		 361 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  30.69 
 
 		 369 aa  86.7  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2556  protein of unknown function UPF0118  25.43 
 
 		 429 aa  86.7  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  21.9 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  26.81 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  21.54 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  20.58 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  25.83 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  23.64 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  25.29 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  26.42 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  26.15 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.6 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  25.53 
 
 		 421 aa  82.8  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0829  protein of unknown function UPF0118  30.9 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0384263  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  27.46 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  24.82 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  21.66 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  26 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2801  hypothetical protein  24.77 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.99719  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  25.78 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  23.33 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  26.71 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  32.45 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  23.24 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  23.33 
 
 		 376 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  23.18 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  23.58 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  23.45 
 
 		 365 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  25.8 
 
 		 348 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  23 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  29.78 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  22.59 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  23.59 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  26.2 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  23.86 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  22.83 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  23.7 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  23.36 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  21.12 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  23.26 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  21.12 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  21.12 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  24.42 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  28.16 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  24.6 
 
 		 563 aa  77  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>