86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6348 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6348  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 400 aa  761    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00107036  hitchhiker  0.00103053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6821  transcriptional regulator, TetR family  55 
 
 		 230 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 230 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  36.36 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  46.51 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  50.62 
 
 		 228 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  50.62 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 205 aa  58.9  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  48.39 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 222 aa  57  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  47.22 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 225 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4026  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 234 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.62673  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 208 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 211 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 195 aa  53.1  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 205 aa  53.1  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 216 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 191 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 211 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 197 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4571  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 214 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281671  normal  0.592331 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3499  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 214 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553383  normal  0.3226 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 236 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4769  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 150 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1705  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 203 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164694  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03880  putative transcription regulator protein  49.12 
 
 		 214 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00920  transcriptional regulator, tetR family  51.79 
 
 		 240 aa  51.2  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 204 aa  51.6  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 234 aa  50.4  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  49.15 
 
 		 190 aa  50.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  46.75 
 
 		 214 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4409  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 220 aa  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 233 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 235 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 211 aa  49.7  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 239 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 205 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 202 aa  48.9  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 191 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 234 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 206 aa  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 224 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 205 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  25 
 
 		 489 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 205 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 234 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3302  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 215 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.696216 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 202 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 236 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 237 aa  46.2  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 222 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 217 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 217 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  46.67 
 
 		 206 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 227 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 260 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 200 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  27.66 
 
 		 2272 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 254 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 199 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 240 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 236 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  22.95 
 
 		 2353 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 249 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  24.08 
 
 		 1859 aa  43.9  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 231 aa  43.9  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 201 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 207 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 204 aa  43.9  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 202 aa  43.5  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 199 aa  43.5  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 237 aa  43.5  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 222 aa  43.1  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 208 aa  43.1  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 202 aa  43.1  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 196 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4375  NEAr transporter  42.11 
 
 		 1147 aa  42.7  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 203 aa  42.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 242 aa  42.7  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 201 aa  43.1  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>