More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2473 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  68.08 
 
 		 801 aa  1078    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 788 aa  1609    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  71.86 
 
 		 777 aa  1127    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  74.9 
 
 		 777 aa  1131    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  71.86 
 
 		 777 aa  1127    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  41.53 
 
 		 778 aa  570  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3599  TonB-dependent receptor  36.8 
 
 		 822 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  37.42 
 
 		 741 aa  500  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  38.36 
 
 		 769 aa  498  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  35.2 
 
 		 873 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  35.05 
 
 		 873 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  36.45 
 
 		 741 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1926  TonB-dependent receptor  34.66 
 
 		 779 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2237  TonB domain-containing protein  34.36 
 
 		 797 aa  411  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  0.673807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 824 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 770 aa  405  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  35.11 
 
 		 802 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1787  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 813 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 781 aa  395  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0864  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 760 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1862  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 773 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610045  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  31.2 
 
 		 935 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  34.05 
 
 		 848 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  34.02 
 
 		 856 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 		 868 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  32.58 
 
 		 787 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2188  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 841 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 821 aa  372  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1853  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 839 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1804  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 		 839 aa  369  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.451169 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  33.84 
 
 		 825 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 772 aa  369  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  33.84 
 
 		 825 aa  369  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 826 aa  363  8e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 825 aa  363  8e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 807 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 805 aa  353  8.999999999999999e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  32.7 
 
 		 775 aa  353  8.999999999999999e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 821 aa  325  3e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  36.6 
 
 		 1188 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2031  TonB-dependent receptor, plug  44.64 
 
 		 317 aa  183  9.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.773657 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7407  ferrienterobactin-like protein  26.29 
 
 		 775 aa  175  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 730 aa  122  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 688 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 700 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 700 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 700 aa  115  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 720 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  23.12 
 
 		 720 aa  112  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 694 aa  105  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 742 aa  104  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 700 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  28.49 
 
 		 700 aa  102  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 715 aa  102  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  28.49 
 
 		 700 aa  102  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 700 aa  101  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 688 aa  101  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 723 aa  101  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 700 aa  101  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  28.2 
 
 		 706 aa  100  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  27.91 
 
 		 706 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  27.91 
 
 		 706 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  27.91 
 
 		 721 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 700 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  23.3 
 
 		 792 aa  100  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  27.91 
 
 		 706 aa  99.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 675 aa  99.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  23.43 
 
 		 727 aa  99.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  22.65 
 
 		 646 aa  98.2  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 		 728 aa  98.2  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  24.1 
 
 		 743 aa  98.2  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  24.38 
 
 		 713 aa  97.4  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  22.75 
 
 		 639 aa  93.6  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  23.98 
 
 		 681 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 706 aa  92  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 705 aa  92  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  22.59 
 
 		 709 aa  91.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  22.52 
 
 		 778 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  23.69 
 
 		 729 aa  89.7  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  22.45 
 
 		 757 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 726 aa  89.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  22.11 
 
 		 757 aa  87.8  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 698 aa  87.4  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  21.82 
 
 		 653 aa  87.4  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  22.59 
 
 		 701 aa  87.4  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 731 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 821 aa  87  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  22.03 
 
 		 836 aa  87  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  22.16 
 
 		 699 aa  86.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 679 aa  85.5  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  23.66 
 
 		 791 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 709 aa  85.5  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  22.66 
 
 		 702 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  22.66 
 
 		 702 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  23.25 
 
 		 791 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 		 782 aa  84.7  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 771 aa  84.7  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  22.78 
 
 		 712 aa  84  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  22.03 
 
 		 656 aa  84  0.000000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  22.26 
 
 		 715 aa  84  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>