164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2074 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2074  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 163 aa  323  9e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0360  tetratricopeptide TPR_2  39.66 
 
 		 160 aa  88.6  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3702  TPR repeat-containing protein  39.83 
 
 		 166 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.604438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3432  TPR repeat-containing protein  42.5 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2305  TPR repeat-containing protein  45.54 
 
 		 307 aa  72  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3457  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3118  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.202741  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0399  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4454  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0431  Tetratricopeptide domain protein  31.9 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2884  hypothetical protein  30.21 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.181441  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4888  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.75 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 		 1406 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 203 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  35.59 
 
 		 456 aa  52.4  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  37.5 
 
 		 648 aa  50.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1567  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.08 
 
 		 339 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00816314  normal  0.0470804 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 		 605 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  43.4 
 
 		 1252 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  43.4 
 
 		 1252 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 		 762 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 566 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.84 
 
 		 689 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 879 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 3145 aa  48.5  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0125  response regulator receiver protein  38.96 
 
 		 1131 aa  48.5  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.915528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  28.12 
 
 		 462 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  45.16 
 
 		 700 aa  47.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_002620  TC0055  type III secretion chaperone, putative  30.61 
 
 		 335 aa  47.8  0.00007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 827 aa  47.4  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  37.68 
 
 		 1124 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.89 
 
 		 758 aa  47  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 1421 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  29.13 
 
 		 681 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1897  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.47 
 
 		 725 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.66 
 
 		 626 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.66 
 
 		 626 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  39.34 
 
 		 592 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 		 423 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 3560 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 3035 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.66 
 
 		 614 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.66 
 
 		 614 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 614 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 614 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 614 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  33.77 
 
 		 577 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 1714 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3236  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.076369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0243  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.127552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  31.78 
 
 		 503 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 248 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5172  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163802  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  29.63 
 
 		 436 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1535  Tetratricopeptide domain protein  36.05 
 
 		 322 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148756  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  33.33 
 
 		 594 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  31.4 
 
 		 577 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 637 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 394 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 1827 aa  45.1  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.92 
 
 		 406 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 		 1486 aa  45.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  28.75 
 
 		 887 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.92 
 
 		 406 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 585 aa  44.7  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 626 aa  44.3  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1754  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 184 aa  44.3  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107491  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0899  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.19 
 
 		 245 aa  44.3  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  34.85 
 
 		 561 aa  44.3  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 4489 aa  43.9  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  27.73 
 
 		 865 aa  43.9  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  34.18 
 
 		 265 aa  43.9  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  34.72 
 
 		 638 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 909 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 362 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 828 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.57 
 
 		 249 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  33.66 
 
 		 626 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2201  Tfp pilus assembly protein PilF-like  27.74 
 
 		 542 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1010  tetratricopeptide TPR_2  37.88 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1186  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 482 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0407507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.57 
 
 		 249 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 670 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.44 
 
 		 603 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  33.33 
 
 		 704 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.08 
 
 		 330 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6274  predicted protein  31.65 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000285986  hitchhiker  0.0027813 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0407  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644736  normal  0.04042 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 739 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.71 
 
 		 576 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1274  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.891871 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 		 578 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0730  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 518 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0811  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.59 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.940424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.73 
 
 		 1154 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 441 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3167  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.99 
 
 		 294 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391783 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 654 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  40.98 
 
 		 697 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>