286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2041 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  65.9 
 
 
529 aa  652    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  100 
 
 
551 aa  1110    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  69.51 
 
 
531 aa  682    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  65.41 
 
 
529 aa  656    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  66.79 
 
 
523 aa  666    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  69.7 
 
 
528 aa  689    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  63.98 
 
 
530 aa  631  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  61.13 
 
 
931 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  58.72 
 
 
538 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  60.46 
 
 
896 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  51.7 
 
 
548 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  43.19 
 
 
526 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  44.73 
 
 
527 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  45.83 
 
 
528 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  44.91 
 
 
549 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  44.91 
 
 
549 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  43.14 
 
 
527 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  43.08 
 
 
527 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  45.55 
 
 
527 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  43.41 
 
 
533 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  44.29 
 
 
525 aa  361  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  43.81 
 
 
535 aa  360  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  42.57 
 
 
533 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  44.17 
 
 
532 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  43.04 
 
 
555 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  43.12 
 
 
541 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  44.49 
 
 
569 aa  352  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  43.76 
 
 
535 aa  349  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  43.32 
 
 
545 aa  349  9e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  42.75 
 
 
568 aa  345  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  42.75 
 
 
568 aa  345  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  42.99 
 
 
541 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  42.99 
 
 
569 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  42.53 
 
 
539 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  42.72 
 
 
541 aa  336  7e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  40.58 
 
 
774 aa  334  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  40.63 
 
 
739 aa  331  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  41.31 
 
 
528 aa  325  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  40.61 
 
 
555 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  44.35 
 
 
411 aa  276  6e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  39.78 
 
 
380 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  38.57 
 
 
361 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  34.94 
 
 
521 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  31.41 
 
 
549 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  26.13 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  29 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  34.71 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  32.11 
 
 
220 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  25.73 
 
 
265 aa  65.1  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  24.02 
 
 
432 aa  65.1  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  23.79 
 
 
252 aa  63.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  23.08 
 
 
363 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  30.33 
 
 
124 aa  62  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  22.91 
 
 
406 aa  61.6  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  29.51 
 
 
124 aa  60.1  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  35.04 
 
 
177 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  34.91 
 
 
186 aa  56.6  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  26.89 
 
 
454 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  25.47 
 
 
230 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 
471 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  37.65 
 
 
140 aa  56.2  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  36.44 
 
 
627 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  34.41 
 
 
151 aa  55.1  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  38.89 
 
 
116 aa  54.7  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  38.37 
 
 
137 aa  53.9  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  32.69 
 
 
113 aa  53.9  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  29.79 
 
 
216 aa  53.9  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1652  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 
137 aa  53.5  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 
459 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  35.63 
 
 
323 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  27.82 
 
 
135 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1238  hypothetical protein  27.68 
 
 
115 aa  52.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  27.82 
 
 
135 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  27.82 
 
 
135 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  27.82 
 
 
135 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
476 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  27.82 
 
 
135 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  30.23 
 
 
457 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1947  rhodanese domain-containing protein  38.74 
 
 
137 aa  52  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  28.72 
 
 
133 aa  52  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  28.43 
 
 
480 aa  52  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  32.26 
 
 
128 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 
128 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  36.96 
 
 
461 aa  52  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  34.52 
 
 
135 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  34.52 
 
 
135 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1564  rhodanese domain-containing protein  25.73 
 
 
296 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  30.61 
 
 
144 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1131  rhodanese domain-containing protein  32.58 
 
 
146 aa  51.6  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00783742  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.58 
 
 
388 aa  51.2  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  36.47 
 
 
140 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02073  rhodanese-related sulfurtransferase  26.95 
 
 
276 aa  51.2  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161687  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
222 aa  51.2  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7246  rhodanese-related sulfurtransferase  29.65 
 
 
279 aa  51.2  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0149117  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  25.88 
 
 
99 aa  51.2  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  38.46 
 
 
223 aa  51.2  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 
135 aa  51.2  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 
124 aa  51.2  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  36.47 
 
 
140 aa  51.2  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  22.4 
 
 
617 aa  50.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>