More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0712 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0712  phage integrase  100 
 
 		 311 aa  640    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2398  site-specific recombinase, phage integrase family  49.21 
 
 		 313 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0327  integrase family protein  49.21 
 
 		 313 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0873412 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2030  integrase family protein  49.21 
 
 		 313 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0668  integrase family protein  49.21 
 
 		 313 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0508  site-specific recombinase, phage integrase family  49.21 
 
 		 313 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181544  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0834  site-specific recombinase, phage integrase family  49.21 
 
 		 313 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7594  integrase family protein  47.76 
 
 		 309 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1272  phage integrase  36.19 
 
 		 315 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0100836 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6954  integrase family protein  36.94 
 
 		 325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7621  integrase family protein  36.42 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0371  integrase family protein  33.98 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.366696  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4358  integrase family protein  42.38 
 
 		 330 aa  145  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.922527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1216  integrase family protein  42.38 
 
 		 330 aa  145  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4386  integrase family protein  42.38 
 
 		 330 aa  145  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4019  phage integrase family protein  33.74 
 
 		 322 aa  145  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2983  integrase family protein  42.38 
 
 		 330 aa  145  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0769  integrase family protein  33.65 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000875329 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6462  phage integrase family protein  34.93 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893515 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0776  integrase family protein  37.9 
 
 		 333 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202923 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6201  phage integrase family protein  32.78 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0244  integrase family protein  40.28 
 
 		 449 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5938  phage integrase family protein  40.49 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3265  phage integrase family protein  33.76 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7459  integrase family protein  37.24 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5407  phage integrase family protein  33.55 
 
 		 312 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.114789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0422  integrase family protein  40.1 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8115  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.09 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00832586  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3506  phage integrase family protein  33.23 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524614  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1240  phage integrase  30.19 
 
 		 330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0601  phage integrase family protein  36.29 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5349  integrase family protein  30.67 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2229  integrase family protein  30.67 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.73098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2007  integrase family protein  30.67 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4898  integrase family protein  31.2 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1334  Integrase  30.69 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.93106  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0031  Integrase  30.34 
 
 		 321 aa  108  9.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293171  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0311  Integrase  30.34 
 
 		 321 aa  108  9.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.018395  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1805  Integrase  30.34 
 
 		 321 aa  108  9.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.871906  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8260  integrase/recombinase  32.17 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164193  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2282  integrase family protein  29.8 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3697  integrase family protein  30.65 
 
 		 303 aa  95.5  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4005  integrase family protein  30.65 
 
 		 303 aa  95.5  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  28.95 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0739  site-specific recombinase XerD-like protein  29.81 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1435  integrase family protein  29.28 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0439  phage integrase  30.06 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  30.08 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2242  integrase family protein  28.14 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.435795  hitchhiker  0.000783825 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  31.56 
 
 		 319 aa  86.3  6e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  32.69 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  32.8 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.22 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.22 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.22 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.9 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.22 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.22 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.9 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.22 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.22 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.07 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  28.03 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1647  integrase domain protein SAM domain protein  33.19 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  32.03 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  29.85 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  28.45 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  31.85 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  31.48 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.16 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.62 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.69 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  30.48 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  31.01 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  28.63 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.6 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  31.6 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.2 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  24.82 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  34.87 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  29.94 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  29.34 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0880  phage integrase family protein  28.19 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0027577 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25.76 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.19 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.19 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.19 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  31.77 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  31.22 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  25.54 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  29.68 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  31.4 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  34.63 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  31.78 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  30.38 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.15 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  31.93 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  29.72 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  31.3 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>