228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4110 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  100 
 
 
287 aa  591  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  69.2 
 
 
293 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1327  intradiol ring-cleavage dioxygenase  70.59 
 
 
293 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.377369 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5310  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  68.99 
 
 
289 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123777  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4613  catechol 1,2-dioxygenase  71.48 
 
 
290 aa  411  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319589  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  68.75 
 
 
294 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  70.03 
 
 
308 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4137  catechol 1,2-dioxygenase  67.61 
 
 
301 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  63.41 
 
 
276 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  65.85 
 
 
279 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  63.38 
 
 
287 aa  356  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4340  intradiol ring-cleavage dioxygenase  56.83 
 
 
287 aa  318  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.362809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4404  intradiol ring-cleavage dioxygenase  58.4 
 
 
297 aa  305  6e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128185  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  52.28 
 
 
300 aa  297  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4566  intradiol ring-cleavage dioxygenase  53.02 
 
 
303 aa  285  7e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.395963 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4569  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.24 
 
 
304 aa  278  5e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.471867 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4890  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  49.11 
 
 
299 aa  278  7e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352228  normal  0.0244252 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  52.55 
 
 
283 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47.16 
 
 
295 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  47.31 
 
 
309 aa  258  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00764  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14270)  45.33 
 
 
329 aa  257  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.29 
 
 
290 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.41 
 
 
309 aa  255  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.8 
 
 
301 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.94 
 
 
293 aa  254  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.41 
 
 
290 aa  254  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5652  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  45.21 
 
 
306 aa  252  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  47.02 
 
 
278 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  45.83 
 
 
302 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  45.36 
 
 
306 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  44.76 
 
 
301 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  47.84 
 
 
296 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62287  6-chlorohydroxyquinol-1,2-dioxygenase  44.22 
 
 
328 aa  240  2e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09363  conserved hypothetical protein  42.76 
 
 
334 aa  239  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0417732 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.1 
 
 
312 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  49.13 
 
 
296 aa  235  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3196  catechol 1,2-dioxygenase  43.36 
 
 
303 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42127  normal  0.302441 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  42.86 
 
 
307 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.35 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.52 
 
 
288 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1782  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.01 
 
 
287 aa  202  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0988363  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.65 
 
 
312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5541  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.38 
 
 
287 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000749052  hitchhiker  0.0000194786 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.11 
 
 
297 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.14 
 
 
297 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5041  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.88 
 
 
296 aa  189  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193413  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  37.68 
 
 
297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52208  hydroxyquinol 1,2- dioxygenase  31.52 
 
 
311 aa  176  3e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04532  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  34.63 
 
 
295 aa  173  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00712197 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.59 
 
 
317 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08566  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03030)  35.02 
 
 
313 aa  169  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476147  normal  0.197205 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08998  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  34.75 
 
 
297 aa  167  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.21 
 
 
275 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  31.46 
 
 
313 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  31.58 
 
 
304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  32.96 
 
 
308 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1130  3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase  31.44 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  31.99 
 
 
307 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  33.1 
 
 
300 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.59 
 
 
304 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  30.88 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  30 
 
 
305 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6466  chlorocatechol 1,2-dioxygenase  33.19 
 
 
255 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4881  Catechol 1,2-dioxygenase  31.03 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.494696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  31.02 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4402  catechol dioxygenase, N-terminal  31.34 
 
 
307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1867  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.38 
 
 
304 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  32.23 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.82 
 
 
307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  29.41 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  30.8 
 
 
283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  32.1 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.82 
 
 
307 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  31.23 
 
 
305 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0484  catechol 1,2-dioxygenase  31.37 
 
 
300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  33.94 
 
 
310 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 
302 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0987  catechol 1,2-dioxygenase  31 
 
 
300 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  31 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  30.86 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  31 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2567  catechol 1,2-dioxygenase  31 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  31 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  30.86 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  31 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2711  catechol 1,2-dioxygenase  31 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  34.31 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  31.37 
 
 
300 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  31.37 
 
 
311 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  31.37 
 
 
311 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  30.71 
 
 
312 aa  125  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  30.86 
 
 
300 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  30.11 
 
 
300 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  30.86 
 
 
300 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  30.86 
 
 
300 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  31.47 
 
 
301 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0961  catechol dioxygenase domain protein  45.58 
 
 
167 aa  122  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.378182 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  29.28 
 
 
290 aa  122  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19220  catechol 1,2-dioxygenase  29.92 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.184485  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  30.53 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.315319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>