66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3876 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  100 
 
 		 1380 aa  2705    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  70.02 
 
 		 1366 aa  1667    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  69.81 
 
 		 1354 aa  1659    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2489  phage tape measure protein  44.94 
 
 		 1527 aa  174  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  41.2 
 
 		 1222 aa  158  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0280  phage tape measure protein  37.98 
 
 		 530 aa  150  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3197  phage tape measure protein  35.9 
 
 		 1318 aa  147  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0873  putative bacteriophage-related transmembrane protein  33.33 
 
 		 1366 aa  145  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00870949 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  31.43 
 
 		 1095 aa  139  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2670  prophage LambdaMc01, tail tape measure protein, putative  33.76 
 
 		 1343 aa  138  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4710  phage tape measure protein  31.21 
 
 		 513 aa  134  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.262419 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  31.58 
 
 		 957 aa  132  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  31.73 
 
 		 1080 aa  132  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  29.41 
 
 		 1031 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  34.24 
 
 		 1075 aa  131  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  29.41 
 
 		 1031 aa  130  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  29.17 
 
 		 1028 aa  125  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  29.17 
 
 		 1028 aa  125  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  27.92 
 
 		 908 aa  122  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  29.17 
 
 		 1028 aa  122  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1030  bacteriophage tail tape meausure protein  33.49 
 
 		 1282 aa  120  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.519663 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  32.05 
 
 		 1080 aa  119  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  32.05 
 
 		 1080 aa  119  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  32.05 
 
 		 1080 aa  119  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4084  lambda family phage tail tape measure protein  30.08 
 
 		 1251 aa  118  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.622569  normal  0.0282318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0657  gp21  30.56 
 
 		 1056 aa  116  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2675  phage tape measure protein  35.48 
 
 		 1644 aa  116  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  26.2 
 
 		 1021 aa  115  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2890  phage tape measure protein  34.31 
 
 		 1137 aa  101  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4099  phage tape measure protein  34.31 
 
 		 1137 aa  101  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245804 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  28.13 
 
 		 914 aa  100  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  26.73 
 
 		 915 aa  100  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  27.92 
 
 		 921 aa  98.6  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  27.59 
 
 		 991 aa  97.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  26.67 
 
 		 1161 aa  97.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1517  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  30.77 
 
 		 924 aa  95.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813512  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3596  phage tape measure protein  30.14 
 
 		 632 aa  94.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0625908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  31.47 
 
 		 1122 aa  92.8  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  32.09 
 
 		 1063 aa  92.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0819  tape measure domain-containing protein  29.03 
 
 		 1451 aa  88.2  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060992  normal  0.0141632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  31.82 
 
 		 1104 aa  85.1  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1615  hypothetical protein  26.44 
 
 		 671 aa  78.6  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1471  hypothetical protein  26.4 
 
 		 668 aa  77.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1638  putative tail component of prophage CP-933K  28.29 
 
 		 936 aa  75.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663672  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1321  phage tape measure protein  26.9 
 
 		 760 aa  72  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1884  hypothetical protein  51.72 
 
 		 811 aa  72  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.505665  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2477  hypothetical protein  31.09 
 
 		 732 aa  71.6  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2488  phage tape measure protein  24.03 
 
 		 611 aa  70.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3992  hypothetical protein  36.42 
 
 		 738 aa  67.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1441  phage tape measure protein  27.14 
 
 		 706 aa  66.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2177  hypothetical protein  49.35 
 
 		 620 aa  63.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502286 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1889  hypothetical protein  31.18 
 
 		 1006 aa  61.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.405118  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2689  hypothetical protein  31.93 
 
 		 1056 aa  58.9  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08240  hypothetical protein  40.3 
 
 		 611 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0780  hypothetical protein  40.3 
 
 		 612 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  31.14 
 
 		 970 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1716  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  45.45 
 
 		 924 aa  55.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.309525  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0089  putative phage tail tape measure protein  31.37 
 
 		 1521 aa  55.5  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  52.83 
 
 		 1173 aa  55.1  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3708  hypothetical protein  50.94 
 
 		 820 aa  51.6  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  54.17 
 
 		 1127 aa  50.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  23.41 
 
 		 1167 aa  50.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0274  hypothetical protein  37.19 
 
 		 419 aa  47.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2178  phage tail tape measure protein, TP901 family  49.12 
 
 		 1342 aa  48.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0682  minor tail protein gp26-like  31.58 
 
 		 1136 aa  45.4  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.830356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0619  minor tail protein gp26-like  31.58 
 
 		 1136 aa  45.4  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>