180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1717 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  34.44 
 
 		 1451 aa  666    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  100 
 
 		 1423 aa  2794    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  34.3 
 
 		 1463 aa  677    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  34.96 
 
 		 1530 aa  654    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  35.2 
 
 		 1448 aa  649    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  34.16 
 
 		 1463 aa  676    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  34.92 
 
 		 1441 aa  684    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  42.38 
 
 		 1428 aa  971    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  32.49 
 
 		 1489 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  32.16 
 
 		 1487 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  32.82 
 
 		 1424 aa  581  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  30.74 
 
 		 1869 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  31.12 
 
 		 1404 aa  357  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1500 aa  323  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  35.05 
 
 		 1515 aa  282  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  35.41 
 
 		 1510 aa  281  7e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  33.7 
 
 		 1538 aa  276  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1578 aa  274  7e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1501 aa  270  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  31.58 
 
 		 2140 aa  268  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  31.73 
 
 		 2032 aa  264  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  28.31 
 
 		 1276 aa  240  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1276 aa  238  8e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1276 aa  232  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  28.55 
 
 		 1550 aa  224  9e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1462 aa  196  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  32.09 
 
 		 1319 aa  193  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  35.71 
 
 		 1084 aa  180  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1206 aa  171  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  24.18 
 
 		 1448 aa  170  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1398 aa  166  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  29.67 
 
 		 1405 aa  165  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1335 aa  158  9e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  27.64 
 
 		 1550 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1392 aa  150  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  28.91 
 
 		 1396 aa  144  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  28.13 
 
 		 1270 aa  142  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  32.7 
 
 		 1937 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  31.8 
 
 		 1783 aa  134  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1406 aa  131  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1362 aa  121  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  24.01 
 
 		 1285 aa  102  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  25.23 
 
 		 1285 aa  100  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1232 aa  98.2  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1443 aa  97.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  24.1 
 
 		 1184 aa  96.3  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1262 aa  96.3  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1184 aa  96.3  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1224 aa  95.5  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  26.91 
 
 		 1359 aa  95.5  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1453 aa  90.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1292 aa  89.7  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1273 aa  90.1  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  27.65 
 
 		 1273 aa  90.1  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1229 aa  88.6  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1226 aa  85.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  23.36 
 
 		 1256 aa  85.9  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1206 aa  85.5  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0704  protein of unknown function DUF490  24.38 
 
 		 1705 aa  85.5  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1221 aa  85.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1221 aa  84.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  26.04 
 
 		 1304 aa  84.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1401 aa  84  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1352 aa  83.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1224 aa  82.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  22.07 
 
 		 1319 aa  82.8  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  25.76 
 
 		 1304 aa  82.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1304 aa  82.4  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1224 aa  82  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  24.12 
 
 		 1361 aa  82  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1392 aa  80.9  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  21.22 
 
 		 1308 aa  80.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1473 aa  80.5  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1395 aa  80.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1223 aa  80.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1226 aa  79.7  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1283 aa  79.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1434 aa  79.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  25.07 
 
 		 1344 aa  78.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1341 aa  78.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1344 aa  78.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  26.98 
 
 		 1299 aa  77  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1344 aa  77.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2805  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1317 aa  76.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1360 aa  77  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1358 aa  76.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1305 aa  77  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  28.87 
 
 		 1378 aa  76.3  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1346 aa  76.3  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  28.75 
 
 		 1380 aa  75.9  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1297 aa  75.5  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1346 aa  74.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1353 aa  73.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1218 aa  73.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  26.05 
 
 		 1025 aa  72.8  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1453 aa  72.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1398 aa  72.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  25.82 
 
 		 1443 aa  72.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1402 aa  71.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  22.73 
 
 		 1426 aa  71.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>