116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_21610 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  37.19 
 
 
2051 aa  902    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  36.2 
 
 
2011 aa  946    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  34.12 
 
 
2047 aa  743    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  37.48 
 
 
2039 aa  944    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  37.69 
 
 
2027 aa  923    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  36.02 
 
 
2056 aa  924    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  36.33 
 
 
2040 aa  937    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  37.13 
 
 
2067 aa  980    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  33.7 
 
 
2052 aa  690    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 
2084 aa  4161    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0459  Fibronectin type III domain protein  30.95 
 
 
2043 aa  624  1e-177  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4818  Fibronectin type III domain protein  31.03 
 
 
2069 aa  551  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0957  hypothetical protein  29.87 
 
 
1994 aa  497  1e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.736873  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1329  hypothetical protein  32.55 
 
 
1001 aa  377  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.031741  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1330  Fibronectin type III domain protein  30.2 
 
 
1052 aa  201  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  28.09 
 
 
5745 aa  145  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  27.72 
 
 
1367 aa  133  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  26.17 
 
 
4978 aa  120  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  31.62 
 
 
9585 aa  108  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  23.93 
 
 
9867 aa  105  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  26.45 
 
 
1597 aa  95.9  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  28.61 
 
 
4848 aa  94.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.92 
 
 
3816 aa  90.5  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  34.37 
 
 
2192 aa  87.4  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2911  fibronectin, type III domain-containing protein  29.78 
 
 
864 aa  86.7  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  27.47 
 
 
721 aa  83.6  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.94 
 
 
2114 aa  81.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  27.56 
 
 
892 aa  80.5  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.51 
 
 
4122 aa  80.1  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  31.23 
 
 
1879 aa  80.1  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  26.07 
 
 
3191 aa  79.3  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  23.95 
 
 
1363 aa  78.2  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  34.4 
 
 
3911 aa  77.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  28.69 
 
 
2042 aa  77  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  25.14 
 
 
1269 aa  76.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.57 
 
 
3363 aa  76.3  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3111  fibronectin type III domain-containing protein  28.61 
 
 
865 aa  73.6  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0177201 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  31.32 
 
 
3477 aa  71.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  31.41 
 
 
2839 aa  71.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  31.34 
 
 
663 aa  70.5  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  27.11 
 
 
1268 aa  70.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  26.61 
 
 
2476 aa  68.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  28.3 
 
 
1512 aa  68.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  30.74 
 
 
2377 aa  68.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  33.15 
 
 
1199 aa  67.8  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  25.49 
 
 
1269 aa  67.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  26.6 
 
 
1628 aa  65.9  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  34.76 
 
 
744 aa  65.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.78 
 
 
850 aa  64.7  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  25.71 
 
 
2816 aa  64.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  29.45 
 
 
725 aa  63.2  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.22 
 
 
3699 aa  62.8  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  29.12 
 
 
3089 aa  62.4  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.25 
 
 
1884 aa  62  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  27.41 
 
 
1215 aa  61.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  25.89 
 
 
16322 aa  62  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.87 
 
 
994 aa  61.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.16 
 
 
1215 aa  61.6  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  34.23 
 
 
2153 aa  60.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  23.73 
 
 
1410 aa  60.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  23.73 
 
 
1410 aa  60.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  26.72 
 
 
1215 aa  60.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  23.98 
 
 
1408 aa  60.1  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  29.15 
 
 
1215 aa  60.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.75 
 
 
761 aa  60.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  27.25 
 
 
1215 aa  60.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.15 
 
 
1066 aa  59.3  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  32.23 
 
 
1911 aa  59.3  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  29.31 
 
 
2503 aa  58.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  38.31 
 
 
3699 aa  58.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  33.33 
 
 
1067 aa  58.9  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  27.26 
 
 
3474 aa  58.2  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  24.79 
 
 
1502 aa  58.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  30.15 
 
 
3544 aa  57.4  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  50 
 
 
1848 aa  57.4  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  31.92 
 
 
448 aa  57  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  43.48 
 
 
2522 aa  56.2  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3369  hypothetical protein  33.77 
 
 
722 aa  56.2  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  25.72 
 
 
1221 aa  55.8  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  26.97 
 
 
1416 aa  55.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2953  hypothetical protein  33.12 
 
 
743 aa  55.8  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.143577  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  28.57 
 
 
1744 aa  54.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  29.32 
 
 
1462 aa  54.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2665  multicopper oxidase type 2  32.06 
 
 
1131 aa  53.5  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.717674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  35.8 
 
 
2670 aa  52.4  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  23.77 
 
 
4854 aa  52.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  26.94 
 
 
814 aa  52  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1998  hypothetical protein  34.57 
 
 
744 aa  51.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.160392  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  35.29 
 
 
2555 aa  51.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  26.93 
 
 
1781 aa  50.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  22.22 
 
 
1422 aa  49.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  24.6 
 
 
2767 aa  50.1  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  25.83 
 
 
2145 aa  49.3  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1243  heme peroxidase  36.07 
 
 
1625 aa  48.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.941188  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2532  multicopper oxidase, type 2  28.91 
 
 
1131 aa  48.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  27.88 
 
 
516 aa  47.8  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  26.69 
 
 
692 aa  47.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  33.63 
 
 
1752 aa  48.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.74 
 
 
2507 aa  47.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.62 
 
 
497 aa  47.8  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>