86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3112 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4969  phage integrase family protein  97.92 
 
 		 337 aa  672    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.373928 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3112  integrase family protein  100 
 
 		 337 aa  689    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.295128 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0001  Phage integrase  93.22 
 
 		 339 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5698  phage integrase family protein  90.27 
 
 		 339 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  hitchhiker  0.00119848 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4539  integrase family protein  89.97 
 
 		 339 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5161  phage integrase  90.27 
 
 		 339 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3158  integrase family protein  87.83 
 
 		 337 aa  597  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0002  phage integrase family protein  73.31 
 
 		 347 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1148  phage integrase family protein  75.56 
 
 		 347 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0330275  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0002  integrase  75.56 
 
 		 347 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.66685  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0002  phage integrase family site specific recombinase  75.56 
 
 		 347 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0002  phage integrase family protein  75.56 
 
 		 347 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1507  phage integrase family protein  75.56 
 
 		 347 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0506287  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1428  phage integrase family protein  75.24 
 
 		 347 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310189  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0003  phage integrase family site specific recombinase  75.24 
 
 		 347 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4156  integrase family protein  64.52 
 
 		 354 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7007  integrase family protein  60.71 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.436087 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3024  putative phage integrase  62.46 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5594  integrase/recombinase protein  39.88 
 
 		 341 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727948  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4344  integrase/recombinase protein  36.36 
 
 		 326 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.509087 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4234  integrase family protein  36.36 
 
 		 326 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02608  integrase/recombinase protein  36.36 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  0.0976015 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3675  phage integrase / Tyr recombinase protein  37.5 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6006  tyr recombinase activity site-specific recombination  31.17 
 
 		 391 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4939  phage integrase family protein  32.2 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.267668  normal  0.379493 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6298  integrase family protein  28.71 
 
 		 340 aa  96.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7390  integrase family protein  29.93 
 
 		 313 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.335502 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5993  Phage integrase  31.88 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5154  integrase family protein  25.75 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.557863  normal  0.471019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1729  integrase family protein  25.75 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  0.924027 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6618  Phage integrase  30.58 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6690  integrase family protein  30.66 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.254504 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0405  hypothetical protein  24.72 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000315128  hitchhiker  0.0000725469 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6214  phage integrase family protein  29.56 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.419719  hitchhiker  0.00629138 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5847  phage integrase  29.56 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.687418  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5041  hypothetical protein  24.83 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.283113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4618  integrase family protein  28.67 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4462  integrase family protein  28 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  28.26 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5334  integrase family protein  28.99 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.70643  normal  0.0475719 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0012  Phage integrase  26.01 
 
 		 320 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6779  integrase family protein  24.16 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  28.12 
 
 		 373 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5937  phage integrase family protein  28.98 
 
 		 329 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1273  phage integrase  25.84 
 
 		 331 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  27.86 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  27.92 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  27.92 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2347  phage integrase family protein  25.78 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.01871 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3558  phage integrase family protein  25.82 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  26.82 
 
 		 304 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  27.33 
 
 		 332 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0768  integrase family protein  26.5 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101801 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  27.22 
 
 		 291 aa  47.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3884  phage integrase family site specific recombinase  27.27 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1730  integrase family protein  31.01 
 
 		 317 aa  46.6  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  29.14 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4243  phage integrase  25.81 
 
 		 309 aa  46.6  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000426285 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  21.39 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5530  site-specific tyrosine recombinase XerS  30.34 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267916  hitchhiker  0.00142122 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5348  integrase family protein  27.59 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2008  integrase family protein  27.59 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2228  integrase family protein  27.59 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  24.45 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0366  phage integrase family site specific recombinase  26.43 
 
 		 173 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.61457  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  23.91 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  23.91 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  23.91 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0474  phage integrase family protein  22.74 
 
 		 355 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  27.7 
 
 		 367 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5943  phage integrase family protein  22.74 
 
 		 355 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0582  phage integrase family protein  22.74 
 
 		 355 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0142  Phage integrase  29.45 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  24.64 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00295  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.36 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5408  phage integrase family protein  29.33 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3266  phage integrase family protein  28.86 
 
 		 330 aa  43.1  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  24.5 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0131  integrase family protein  25.95 
 
 		 312 aa  43.1  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.144823 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1163  phage integrase family protein  27.7 
 
 		 472 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.562087  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  21.48 
 
 		 290 aa  42.7  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0189  Phage integrase  29.86 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0370  integrase family protein  27.35 
 
 		 332 aa  42.4  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.43 
 
 		 299 aa  42.7  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.43 
 
 		 299 aa  42.7  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.43 
 
 		 299 aa  42.7  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>