More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0680 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0680  penicillin-binding protein  100 
 
 
942 aa  1838    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0941  penicillin-binding protein 1C  62.84 
 
 
785 aa  890    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237946  normal  0.754349 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0786  penicillin-binding protein 1C  98.36 
 
 
1060 aa  1377    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.879691  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5748  penicillin-binding protein 1C  71.86 
 
 
747 aa  1062    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2406  penicillin-binding protein 1C  98.53 
 
 
951 aa  1474    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.806049  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4091  penicillin-binding protein 1C  71.02 
 
 
745 aa  1011    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1290  penicillin-binding protein 1C  75.16 
 
 
747 aa  1156    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00589164  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4445  penicillin-binding protein 1C  73.69 
 
 
745 aa  1098    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971962  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1584  penicillin-binding protein 1C  87.13 
 
 
844 aa  1343    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1203  penicillin-binding protein 1C  93.8 
 
 
923 aa  1519    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3812  penicillin-binding protein 1C  71.86 
 
 
747 aa  1062    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.596  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3981  penicillin-binding protein 1C  75.5 
 
 
745 aa  1157    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.187688 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4556  penicillin-binding protein 1C  71.86 
 
 
747 aa  1062    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1126  penicillin-binding protein 1C  95.95 
 
 
913 aa  1585    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0888315  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3383  penicillin-binding protein 1C  60.25 
 
 
746 aa  545  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3529  penicillin-binding protein 1C  62.16 
 
 
726 aa  538  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3142  penicillin-binding protein 1C  61.87 
 
 
742 aa  530  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1343  penicillin-binding protein 1C  60.55 
 
 
747 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00458316  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1957  penicillin-binding protein 1C  59.52 
 
 
784 aa  514  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0162399 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3299  penicillin-binding protein 1C  63.34 
 
 
758 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2652  penicillin-binding protein 1C  61.78 
 
 
768 aa  505  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.447412  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5300  penicillin-binding protein 1C  61.38 
 
 
774 aa  501  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1163  penicillin-binding protein 1C  50 
 
 
705 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22385  normal  0.584003 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1576  penicillin-binding protein, putative  49.22 
 
 
713 aa  355  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.772594  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2383  penicillin-binding protein 1C  47.89 
 
 
729 aa  340  5e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.977643  normal  0.393038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  35.91 
 
 
860 aa  269  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  36.2 
 
 
853 aa  263  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  30.9 
 
 
952 aa  244  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2036  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  35.77 
 
 
779 aa  241  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0247082  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1927  glycosyl transferase family 51  35.68 
 
 
782 aa  238  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0285568  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1842  glycosyl transferase family 51  36.01 
 
 
782 aa  234  5e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0117542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4689  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 
1037 aa  223  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0836  penicillin-binding protein 1C  33.55 
 
 
719 aa  218  2.9999999999999998e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0734378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5076  penicillin-binding protein 1C  30.81 
 
 
816 aa  218  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.634438  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  30.09 
 
 
980 aa  217  8e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  31.27 
 
 
855 aa  217  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2226  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 
759 aa  215  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2518  glycosyl transferase family 51  33.17 
 
 
857 aa  214  4.9999999999999996e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09670  penicillin-binding protein 1C  34.9 
 
 
770 aa  213  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1168  penicillin-binding protein 1C  36.03 
 
 
798 aa  208  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.676311  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2356  penicillin-binding protein 1C  32.86 
 
 
762 aa  204  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2894  penicillin-binding protein 1C  32.73 
 
 
770 aa  201  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1149  penicillin-binding protein 1C  32.31 
 
 
770 aa  201  7e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391736  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1158  penicillin-binding protein 1C  32.31 
 
 
770 aa  201  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.729598  normal  0.0485769 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2670  penicillin-binding protein 1C  32.31 
 
 
770 aa  201  7e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02411  fused transglycosylase/transpeptidase  32.31 
 
 
770 aa  201  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02373  hypothetical protein  32.31 
 
 
770 aa  201  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  28.76 
 
 
648 aa  201  7.999999999999999e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3916  penicillin-binding protein 1C (PBP-1C)  31.87 
 
 
745 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.787281 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2639  penicillin-binding protein 1C  36.04 
 
 
793 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2803  penicillin-binding protein 1C  32.47 
 
 
770 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0390  penicillin-binding protein 1C  37.28 
 
 
780 aa  198  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0263  penicillin-binding protein 1C  35.76 
 
 
679 aa  196  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0164  penicillin-binding protein 1C  31.37 
 
 
797 aa  190  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0508  peptidoglycan glycosyltransferase  29.94 
 
 
927 aa  189  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  32.98 
 
 
801 aa  189  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2770  penicillin-binding protein 1C  32.84 
 
 
771 aa  189  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0543  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC  29.38 
 
 
780 aa  187  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  34.83 
 
 
727 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  34.83 
 
 
727 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1192  glycosyltransferase  31.19 
 
 
774 aa  185  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.224348  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2671  penicillin-binding protein 1C  36.96 
 
 
770 aa  185  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.122147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  29.38 
 
 
662 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0617  penicillin-binding protein 1C  31.94 
 
 
784 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701974  normal  0.0771525 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3627  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 
908 aa  184  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  35.1 
 
 
728 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3748  penicillin-binding protein 1C  36.96 
 
 
770 aa  184  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2552  penicillin-binding protein 1C  36.65 
 
 
750 aa  184  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0465357  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4847  penicillin-binding protein  36.2 
 
 
782 aa  183  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  34.89 
 
 
728 aa  183  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2077  penicillin-binding protein 1C  36.79 
 
 
706 aa  183  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145944  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2824  penicillin-binding protein 1C  36.88 
 
 
680 aa  183  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  30.06 
 
 
765 aa  183  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4387  penicillin-binding protein 1C  36.26 
 
 
782 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  29.22 
 
 
667 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2918  penicillin-binding protein 1C  35.75 
 
 
731 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0309  penicillin-binding protein 1C  26.06 
 
 
792 aa  181  7e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2683  penicillin-binding protein 1C  38.06 
 
 
771 aa  181  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3903  penicillin-binding protein 1C  31.8 
 
 
766 aa  180  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0603  bifunctional penicillin-binding protein 1C  36.63 
 
 
807 aa  180  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  30.57 
 
 
761 aa  180  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2789  penicillin-binding protein 1C  38.06 
 
 
771 aa  180  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0400715  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2901  penicillin-binding protein 1C  38.06 
 
 
771 aa  180  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2726  penicillin-binding protein 1C  36.97 
 
 
771 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  30.51 
 
 
712 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  29.2 
 
 
723 aa  179  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0572  penicillin-binding protein 1C  32.28 
 
 
784 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  32.78 
 
 
744 aa  177  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0611  penicillin-binding protein 1C  32.12 
 
 
784 aa  177  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585704  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  32.45 
 
 
701 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  30.35 
 
 
654 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  29.66 
 
 
704 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4592  penicillin-binding protein 1C  30.4 
 
 
784 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233923 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  33.57 
 
 
779 aa  175  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0637  penicillin-binding protein 1C  34.88 
 
 
683 aa  174  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405443  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3013  penicillin-binding protein 1C  34.99 
 
 
774 aa  174  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.928991  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  28.08 
 
 
788 aa  174  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
831 aa  173  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  31.7 
 
 
618 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  33.6 
 
 
714 aa  172  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>